RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428881.1

RPL4P3-201, Transcript of ribosomal protein L4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene RPL4P3, Length 1,311 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P3-201ENST00000428881 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.81■□□□□ 0.92
RPL4P3-201ENST00000428881 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RPL4P3-201ENST00000428881 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.44■□□□□ 0.54
RPL4P3-201ENST00000428881 ABCC9O60706 1549 aa18.44■□□□□ 0.54
RPL4P3-201ENST00000428881 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.78■□□□□ 0.44
RPL4P3-201ENST00000428881 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.65■□□□□ 0.42
RPL4P3-201ENST00000428881 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.55■□□□□ 0.4
RPL4P3-201ENST00000428881 NACADO15069 1562 aa17.48■□□□□ 0.39
RPL4P3-201ENST00000428881 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RPL4P3-201ENST00000428881 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
RPL4P3-201ENST00000428881 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.25■□□□□ 0.35
RPL4P3-201ENST00000428881 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.15■□□□□ 0.34
RPL4P3-201ENST00000428881 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.13■□□□□ 0.33
RPL4P3-201ENST00000428881 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.06■□□□□ 0.32
RPL4P3-201ENST00000428881 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.99■□□□□ 0.31
RPL4P3-201ENST00000428881 SCRIBQ14160 1630 aa16.96■□□□□ 0.31
RPL4P3-201ENST00000428881 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.74■□□□□ 0.27
RPL4P3-201ENST00000428881 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RPL4P3-201ENST00000428881 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.58■□□□□ 0.24
RPL4P3-201ENST00000428881 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.56■□□□□ 0.24
RPL4P3-201ENST00000428881 NCAPD3P42695 1498 aa16.17■□□□□ 0.18
RPL4P3-201ENST00000428881 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.16■□□□□ 0.18
RPL4P3-201ENST00000428881 SMARCA4P51532 1647 aa16.15■□□□□ 0.18
RPL4P3-201ENST00000428881 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
RPL4P3-201ENST00000428881 SMARCA2P51531 1590 aa16.09■□□□□ 0.17
RPL4P3-201ENST00000428881 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.05■□□□□ 0.16
RPL4P3-201ENST00000428881 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RPL4P3-201ENST00000428881 HMGXB3Q12766 1538 aa15.99■□□□□ 0.15
RPL4P3-201ENST00000428881 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.94■□□□□ 0.14
RPL4P3-201ENST00000428881 ERCC6Q03468 1493 aa15.91■□□□□ 0.14
RPL4P3-201ENST00000428881 NESP48681 1621 aa15.88■□□□□ 0.13
RPL4P3-201ENST00000428881 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
RPL4P3-201ENST00000428881 WIZO95785 1651 aa15.87■□□□□ 0.13
RPL4P3-201ENST00000428881 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
RPL4P3-201ENST00000428881 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.74■□□□□ 0.11
RPL4P3-201ENST00000428881 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.72■□□□□ 0.11
RPL4P3-201ENST00000428881 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.72■□□□□ 0.11
RPL4P3-201ENST00000428881 CUX2O14529 1486 aa15.7■□□□□ 0.1
RPL4P3-201ENST00000428881 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
RPL4P3-201ENST00000428881 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
RPL4P3-201ENST00000428881 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.58■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.56■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.55■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 CFTRP13569 1480 aa15.55■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.55■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.52■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.52■□□□□ 0.08
RPL4P3-201ENST00000428881 WDR62O43379 1518 aa15.41■□□□□ 0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
RPL4P3-201ENST00000428881 PRDM2Q13029 1718 aa15.27■□□□□ 0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 TOPBP1Q92547 1522 aa15.25■□□□□ 0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 ABCC8Q09428 1581 aa15.24■□□□□ 0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 IFT140Q96RY7 1462 aa15.21■□□□□ 0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 OSCARQ8IYS5 282 aa15.19■□□□□ 0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.17■□□□□ 0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 SOGA1O94964 1423 aa15.13■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.11■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 FBLN2P98095 1184 aa15.11■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 TRIM41Q8WV44 630 aa15.09■□□□□ 0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.06■□□□□ 0
RPL4P3-201ENST00000428881 CUX1P39880 1505 aa15.06■□□□□ 0
RPL4P3-201ENST00000428881 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RPL4P3-201ENST00000428881 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RPL4P3-201ENST00000428881 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 GRIN2BQ13224 1484 aa14.91□□□□□ -0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.9□□□□□ -0.02
RPL4P3-201ENST00000428881 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.88□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.87□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 SYNJ1O43426 1573 aa14.86□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 CHD1O14646 1710 aa14.85□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 WDR97A6NE52 1622 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 TOP2BQ02880 1626 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL4P3-201ENST00000428881 SYNJ2O15056 1496 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 ARHGEF11O15085 1522 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.81□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 FOXD1Q16676 465 aa14.77□□□□□ -0.04
RPL4P3-201ENST00000428881 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.77□□□□□ -0.05
RPL4P3-201ENST00000428881 PBRM1Q86U86 1689 aa14.76□□□□□ -0.05
RPL4P3-201ENST00000428881 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.72□□□□□ -0.05
RPL4P3-201ENST00000428881 GRIN2AQ12879 1464 aa14.7□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.69□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 ARAP1Q96P48 1450 aa14.68□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 KIF27Q86VH2 1401 aa14.67□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 ADAMTS12P58397 1594 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 IGF1RP08069 1367 aa14.65□□□□□ -0.06
RPL4P3-201ENST00000428881 JPH4Q96JJ6 628 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms