RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.44■■□□□ 1.98
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SMIM25-201ENST00000421019 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.61■■□□□ 1.53
SMIM25-201ENST00000421019 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.58■■□□□ 1.37
SMIM25-201ENST00000421019 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.51■■□□□ 1.35
SMIM25-201ENST00000421019 NACADO15069 1562 aa23.4■■□□□ 1.34
SMIM25-201ENST00000421019 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.34■■□□□ 1.33
SMIM25-201ENST00000421019 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
SMIM25-201ENST00000421019 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.04■■□□□ 1.28
SMIM25-201ENST00000421019 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.88■■□□□ 1.25
SMIM25-201ENST00000421019 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.85■■□□□ 1.25
SMIM25-201ENST00000421019 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SMIM25-201ENST00000421019 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.67■■□□□ 1.22
SMIM25-201ENST00000421019 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.61■■□□□ 1.21
SMIM25-201ENST00000421019 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.43■■□□□ 1.18
SMIM25-201ENST00000421019 SCRIBQ14160 1630 aa22.42■■□□□ 1.18
SMIM25-201ENST00000421019 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.4■■□□□ 1.18
SMIM25-201ENST00000421019 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SMIM25-201ENST00000421019 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.77■■□□□ 1.08
SMIM25-201ENST00000421019 NCAPD3P42695 1498 aa21.64■■□□□ 1.06
SMIM25-201ENST00000421019 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.53■■□□□ 1.04
SMIM25-201ENST00000421019 CUX2O14529 1486 aa21.52■■□□□ 1.03
SMIM25-201ENST00000421019 ERCC6Q03468 1493 aa21.5■■□□□ 1.03
SMIM25-201ENST00000421019 SMARCA2P51531 1590 aa21.45■■□□□ 1.02
SMIM25-201ENST00000421019 HMGXB3Q12766 1538 aa21.4■■□□□ 1.02
SMIM25-201ENST00000421019 SMARCA4P51532 1647 aa21.39■■□□□ 1.01
SMIM25-201ENST00000421019 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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SMIM25-201ENST00000421019 NESP48681 1621 aa21.28■■□□□ 1
SMIM25-201ENST00000421019 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.21■□□□□ 0.99
SMIM25-201ENST00000421019 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.12■□□□□ 0.97
SMIM25-201ENST00000421019 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.12■□□□□ 0.97
SMIM25-201ENST00000421019 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.08■□□□□ 0.97
SMIM25-201ENST00000421019 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
SMIM25-201ENST00000421019 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.99■□□□□ 0.95
SMIM25-201ENST00000421019 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.91■□□□□ 0.94
SMIM25-201ENST00000421019 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.86■□□□□ 0.93
SMIM25-201ENST00000421019 WIZO95785 1651 aa20.81■□□□□ 0.92
SMIM25-201ENST00000421019 WDR62O43379 1518 aa20.78■□□□□ 0.92
SMIM25-201ENST00000421019 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.74■□□□□ 0.91
SMIM25-201ENST00000421019 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.71■□□□□ 0.91
SMIM25-201ENST00000421019 TRIM41Q8WV44 630 aa20.71■□□□□ 0.91
SMIM25-201ENST00000421019 CFTRP13569 1480 aa20.69■□□□□ 0.9
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SMIM25-201ENST00000421019 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SMIM25-201ENST00000421019 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.39■□□□□ 0.85
SMIM25-201ENST00000421019 IFT140Q96RY7 1462 aa20.36■□□□□ 0.85
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SMIM25-201ENST00000421019 PRDM2Q13029 1718 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM25-201ENST00000421019 ABCC8Q09428 1581 aa20.29■□□□□ 0.84
SMIM25-201ENST00000421019 TOPBP1Q92547 1522 aa20.28■□□□□ 0.84
SMIM25-201ENST00000421019 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.18■□□□□ 0.82
SMIM25-201ENST00000421019 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.18■□□□□ 0.82
SMIM25-201ENST00000421019 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.18■□□□□ 0.82
SMIM25-201ENST00000421019 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.17■□□□□ 0.82
SMIM25-201ENST00000421019 ARHGEF11O15085 1522 aa20.15■□□□□ 0.82
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SMIM25-201ENST00000421019 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM25-201ENST00000421019 FBLN2P98095 1184 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM25-201ENST00000421019 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SMIM25-201ENST00000421019 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SMIM25-201ENST00000421019 SOGA1O94964 1423 aa20.02■□□□□ 0.8
SMIM25-201ENST00000421019 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20■□□□□ 0.79
SMIM25-201ENST00000421019 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SMIM25-201ENST00000421019 CHD1O14646 1710 aa19.96■□□□□ 0.79
SMIM25-201ENST00000421019 ARAP1Q96P48 1450 aa19.93■□□□□ 0.78
SMIM25-201ENST00000421019 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SMIM25-201ENST00000421019 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SMIM25-201ENST00000421019 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.92■□□□□ 0.78
SMIM25-201ENST00000421019 WDR97A6NE52 1622 aa19.88■□□□□ 0.77
SMIM25-201ENST00000421019 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.88■□□□□ 0.77
SMIM25-201ENST00000421019 CUX1P39880 1505 aa19.86■□□□□ 0.77
SMIM25-201ENST00000421019 GRIN2BQ13224 1484 aa19.86■□□□□ 0.77
SMIM25-201ENST00000421019 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
SMIM25-201ENST00000421019 SYNJ1O43426 1573 aa19.8■□□□□ 0.76
SMIM25-201ENST00000421019 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.8■□□□□ 0.76
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SMIM25-201ENST00000421019 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SMIM25-201ENST00000421019 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.63■□□□□ 0.73
SMIM25-201ENST00000421019 PBRM1Q86U86 1689 aa19.62■□□□□ 0.73
SMIM25-201ENST00000421019 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.61■□□□□ 0.73
SMIM25-201ENST00000421019 GRIN2AQ12879 1464 aa19.57■□□□□ 0.72
SMIM25-201ENST00000421019 NUP160Q12769 1436 aa19.53■□□□□ 0.72
SMIM25-201ENST00000421019 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.52■□□□□ 0.72
SMIM25-201ENST00000421019 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SMIM25-201ENST00000421019 TOP2BQ02880 1626 aa19.48■□□□□ 0.71
SMIM25-201ENST00000421019 ADAMTS12P58397 1594 aa19.48■□□□□ 0.71
SMIM25-201ENST00000421019 CEP170Q5SW79 1584 aa19.45■□□□□ 0.7
SMIM25-201ENST00000421019 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.45■□□□□ 0.7
SMIM25-201ENST00000421019 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.44■□□□□ 0.7
SMIM25-201ENST00000421019 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.44■□□□□ 0.7
SMIM25-201ENST00000421019 JPH4Q96JJ6 628 aa19.41■□□□□ 0.7
SMIM25-201ENST00000421019 SHROOM2Q13796 1616 aa19.38■□□□□ 0.69
SMIM25-201ENST00000421019 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SMIM25-201ENST00000421019 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
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