RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420367.1

PDCD4-AS1-201, PDCD4 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene PDCD4-AS1, Length 778 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.38■■■□□ 2.29
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.32■■□□□ 1.64
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NACADO15069 1562 aa25.12■■□□□ 1.61
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.08■■□□□ 1.61
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.88■■□□□ 1.57
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.76■■□□□ 1.55
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.33■■□□□ 1.49
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.02■■□□□ 1.44
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SCRIBQ14160 1630 aa24.01■■□□□ 1.43
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.04■■□□□ 1.28
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SMARCA2P51531 1590 aa23.01■■□□□ 1.27
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 HMGXB3Q12766 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SMARCA4P51532 1647 aa22.93■■□□□ 1.26
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NESP48681 1621 aa22.75■■□□□ 1.23
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.69■■□□□ 1.22
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.61■■□□□ 1.21
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.44■■□□□ 1.18
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 WDR62O43379 1518 aa22.3■■□□□ 1.16
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 WIZO95785 1651 aa22.26■■□□□ 1.15
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.23■■□□□ 1.15
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.17■■□□□ 1.14
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CFTRP13569 1480 aa22.15■■□□□ 1.14
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TRIM41Q8WV44 630 aa22.14■■□□□ 1.13
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.78■■□□□ 1.08
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TOPBP1Q92547 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.49■■□□□ 1.03
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CHD1O14646 1710 aa21.42■■□□□ 1.02
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SOGA1O94964 1423 aa21.42■■□□□ 1.02
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 WDR97A6NE52 1622 aa21.41■■□□□ 1.02
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ARAP1Q96P48 1450 aa21.34■■□□□ 1.01
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 GRIN2BQ13224 1484 aa21.27■■□□□ 1
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SYNJ2O15056 1496 aa21.21■□□□□ 0.99
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.1■□□□□ 0.97
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.03■□□□□ 0.96
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PDCD4-AS1-201ENST00000420367 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.9■□□□□ 0.94
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ADAMTS12P58397 1594 aa20.89■□□□□ 0.93
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 TOP2BQ02880 1626 aa20.87■□□□□ 0.93
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.86■□□□□ 0.93
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.85■□□□□ 0.93
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 CEP170Q5SW79 1584 aa20.85■□□□□ 0.93
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 SHROOM2Q13796 1616 aa20.81■□□□□ 0.92
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.8■□□□□ 0.92
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 JPH4Q96JJ6 628 aa20.73■□□□□ 0.91
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PDCD4-AS1-201ENST00000420367 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
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