RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420104.5

ARPC2-204, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC2, Length 482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-204ENST00000420104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.51■■■■■ 7.44
ARPC2-204ENST00000420104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.68■■■■■ 6.34
ARPC2-204ENST00000420104 ABCC9O60706 1549 aa53.85■■■■■ 6.21
ARPC2-204ENST00000420104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.64■■■■■ 5.86
ARPC2-204ENST00000420104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.47■■■■■ 5.83
ARPC2-204ENST00000420104 NACADO15069 1562 aa51.47■■■■■ 5.83
ARPC2-204ENST00000420104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.24■■■■■ 5.79
ARPC2-204ENST00000420104 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.06■■■■■ 5.76
ARPC2-204ENST00000420104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.82■■■■■ 5.73
ARPC2-204ENST00000420104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.41■■■■■ 5.66
ARPC2-204ENST00000420104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.22■■■■■ 5.63
ARPC2-204ENST00000420104 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.05■■■■■ 5.6
ARPC2-204ENST00000420104 SCRIBQ14160 1630 aa49.99■■■■■ 5.59
ARPC2-204ENST00000420104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.84■■■■■ 5.57
ARPC2-204ENST00000420104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.63■■■■■ 5.53
ARPC2-204ENST00000420104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
ARPC2-204ENST00000420104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.69■■■■■ 5.39
ARPC2-204ENST00000420104 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.48■■■■■ 5.35
ARPC2-204ENST00000420104 SMARCA4P51532 1647 aa47.76■■■■■ 5.24
ARPC2-204ENST00000420104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
ARPC2-204ENST00000420104 NCAPD3P42695 1498 aa47.51■■■■■ 5.2
ARPC2-204ENST00000420104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.47■■■■■ 5.19
ARPC2-204ENST00000420104 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.45■■■■■ 5.19
ARPC2-204ENST00000420104 SMARCA2P51531 1590 aa47.4■■■■■ 5.18
ARPC2-204ENST00000420104 HMGXB3Q12766 1538 aa47.24■■■■■ 5.15
ARPC2-204ENST00000420104 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.24■■■■■ 5.15
ARPC2-204ENST00000420104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
ARPC2-204ENST00000420104 WIZO95785 1651 aa46.98■■■■■ 5.11
ARPC2-204ENST00000420104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
ARPC2-204ENST00000420104 ERCC6Q03468 1493 aa46.51■■■■■ 5.04
ARPC2-204ENST00000420104 NESP48681 1621 aa46.44■■■■■ 5.03
ARPC2-204ENST00000420104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
ARPC2-204ENST00000420104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.32■■■■■ 5.01
ARPC2-204ENST00000420104 CUX2O14529 1486 aa46.23■■■■■ 4.99
ARPC2-204ENST00000420104 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.09■■■■■ 4.97
ARPC2-204ENST00000420104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.05■■■■■ 4.96
ARPC2-204ENST00000420104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.88■■■■■ 4.94
ARPC2-204ENST00000420104 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.88■■■■■ 4.94
ARPC2-204ENST00000420104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.85■■■■■ 4.93
ARPC2-204ENST00000420104 CFTRP13569 1480 aa45.77■■■■■ 4.92
ARPC2-204ENST00000420104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
ARPC2-204ENST00000420104 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.59■■■■■ 4.89
ARPC2-204ENST00000420104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.55■■■■■ 4.88
ARPC2-204ENST00000420104 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.55■■■■■ 4.88
ARPC2-204ENST00000420104 PRDM2Q13029 1718 aa45.5■■■■■ 4.87
ARPC2-204ENST00000420104 WDR62O43379 1518 aa45.46■■■■■ 4.87
ARPC2-204ENST00000420104 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.34■■■■■ 4.85
ARPC2-204ENST00000420104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
ARPC2-204ENST00000420104 TOPBP1Q92547 1522 aa44.83■■■■■ 4.77
ARPC2-204ENST00000420104 ABCC8Q09428 1581 aa44.77■■■■■ 4.76
ARPC2-204ENST00000420104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.77■■■■■ 4.76
ARPC2-204ENST00000420104 IFT140Q96RY7 1462 aa44.63■■■■■ 4.73
ARPC2-204ENST00000420104 CUX1P39880 1505 aa44.51■■■■■ 4.72
ARPC2-204ENST00000420104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.45■■■■■ 4.71
ARPC2-204ENST00000420104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
ARPC2-204ENST00000420104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.35■■■■■ 4.69
ARPC2-204ENST00000420104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
ARPC2-204ENST00000420104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.29■■■■■ 4.68
ARPC2-204ENST00000420104 SOGA1O94964 1423 aa44.25■■■■■ 4.67
ARPC2-204ENST00000420104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
ARPC2-204ENST00000420104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.66
ARPC2-204ENST00000420104 OSCARQ8IYS5 282 aa44.18■■■■■ 4.66
ARPC2-204ENST00000420104 SYNJ1O43426 1573 aa44.14■■■■■ 4.66
ARPC2-204ENST00000420104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.12■■■■■ 4.652e-9■■■□□ 15.7
ARPC2-204ENST00000420104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.12■■■■■ 4.65
ARPC2-204ENST00000420104 TOP2BQ02880 1626 aa44.11■■■■■ 4.65
ARPC2-204ENST00000420104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
ARPC2-204ENST00000420104 WDR97A6NE52 1622 aa44■■■■■ 4.63
ARPC2-204ENST00000420104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.89■■■■■ 4.62
ARPC2-204ENST00000420104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.75■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.74■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 GRIN2BQ13224 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 PBRM1Q86U86 1689 aa43.72■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.71■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 CHD1O14646 1710 aa43.71■■■■■ 4.59
ARPC2-204ENST00000420104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
ARPC2-204ENST00000420104 FBLN2P98095 1184 aa43.66■■■■■ 4.58
ARPC2-204ENST00000420104 TRIM41Q8WV44 630 aa43.58■■■■■ 4.57
ARPC2-204ENST00000420104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.5■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 SYNJ2O15056 1496 aa43.5■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.49■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 ARHGEF11O15085 1522 aa43.48■■■■■ 4.55
ARPC2-204ENST00000420104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.36■■■■■ 4.53
ARPC2-204ENST00000420104 ADAMTS12P58397 1594 aa43.33■■■■■ 4.53
ARPC2-204ENST00000420104 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.31■■■■■ 4.52
ARPC2-204ENST00000420104 KIF27Q86VH2 1401 aa43.25■■■■■ 4.51
ARPC2-204ENST00000420104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.22■■■■■ 4.51
ARPC2-204ENST00000420104 GRIN2AQ12879 1464 aa43.18■■■■■ 4.5
ARPC2-204ENST00000420104 IGF1RP08069 1367 aa43.09■■■■■ 4.49
ARPC2-204ENST00000420104 ARAP1Q96P48 1450 aa43.08■■■■■ 4.49
ARPC2-204ENST00000420104 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.05■■■■■ 4.48
ARPC2-204ENST00000420104 CEP170Q5SW79 1584 aa43■■■■■ 4.47
ARPC2-204ENST00000420104 NUP160Q12769 1436 aa42.99■■■■■ 4.47
ARPC2-204ENST00000420104 CUL7Q14999 1698 aa42.98■■■■■ 4.47
ARPC2-204ENST00000420104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.96■■■■■ 4.47
ARPC2-204ENST00000420104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.84■■■■■ 4.45
ARPC2-204ENST00000420104 SHROOM2Q13796 1616 aa42.7■■■■■ 4.43
ARPC2-204ENST00000420104 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.67■■■■■ 4.42
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