RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416105.1

PGM5P4-AS1-201, PGM5P4 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PGM5P4-AS1, Length 645 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.53■■□□□ 1.84
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ABCC9O60706 1549 aa24.15■■□□□ 1.46
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.95■■□□□ 1.42
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.92■■□□□ 1.26
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.86■■□□□ 1.25
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 NACADO15069 1562 aa22.65■■□□□ 1.22
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.49■■□□□ 1.19
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.33■■□□□ 1.17
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.32■■□□□ 1.16
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.27■■□□□ 1.16
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.9■■□□□ 1.1
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.88■■□□□ 1.09
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.84■■□□□ 1.09
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SCRIBQ14160 1630 aa21.8■■□□□ 1.08
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.77■■□□□ 1.07
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.15■□□□□ 0.98
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 NCAPD3P42695 1498 aa20.91■□□□□ 0.94
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CUX2O14529 1486 aa20.9■□□□□ 0.94
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.83■□□□□ 0.93
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ERCC6Q03468 1493 aa20.81■□□□□ 0.92
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.78■□□□□ 0.92
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SMARCA4P51532 1647 aa20.78■□□□□ 0.92
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 HMGXB3Q12766 1538 aa20.77■□□□□ 0.92
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SMARCA2P51531 1590 aa20.72■□□□□ 0.91
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 NESP48681 1621 aa20.72■□□□□ 0.91
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.59■□□□□ 0.89
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.49■□□□□ 0.87
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.48■□□□□ 0.87
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.47■□□□□ 0.87
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.3■□□□□ 0.84
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.23■□□□□ 0.83
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 WIZO95785 1651 aa20.22■□□□□ 0.83
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 WDR62O43379 1518 aa20.22■□□□□ 0.83
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.21■□□□□ 0.83
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TRIM41Q8WV44 630 aa20.07■□□□□ 0.8
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.06■□□□□ 0.8
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.04■□□□□ 0.8
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CFTRP13569 1480 aa19.99■□□□□ 0.79
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 PRDM2Q13029 1718 aa19.85■□□□□ 0.77
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 OSCARQ8IYS5 282 aa19.81■□□□□ 0.76
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.73■□□□□ 0.75
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa19.73■□□□□ 0.75
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.73■□□□□ 0.75
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.67■□□□□ 0.74
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 IFT140Q96RY7 1462 aa19.67■□□□□ 0.74
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TOPBP1Q92547 1522 aa19.66■□□□□ 0.74
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ARHGEF11O15085 1522 aa19.63■□□□□ 0.73
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.56■□□□□ 0.72
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CHD1O14646 1710 aa19.54■□□□□ 0.72
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ABCC8Q09428 1581 aa19.5■□□□□ 0.71
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ARAP1Q96P48 1450 aa19.44■□□□□ 0.7
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.43■□□□□ 0.7
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.39■□□□□ 0.69
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.37■□□□□ 0.69
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.3■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 FBLN2P98095 1184 aa19.28■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.28■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.28■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SOGA1O94964 1423 aa19.27■□□□□ 0.68
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 WDR97A6NE52 1622 aa19.25■□□□□ 0.67
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CUX1P39880 1505 aa19.25■□□□□ 0.67
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SYNJ1O43426 1573 aa19.19■□□□□ 0.66
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 GRIN2BQ13224 1484 aa19.16■□□□□ 0.66
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 PBRM1Q86U86 1689 aa19.15■□□□□ 0.66
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SYNJ2O15056 1496 aa19.14■□□□□ 0.65
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.08■□□□□ 0.65
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.05■□□□□ 0.64
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.04■□□□□ 0.64
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.01■□□□□ 0.63
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ADAMTS12P58397 1594 aa18.94■□□□□ 0.62
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 GRIN2AQ12879 1464 aa18.94■□□□□ 0.62
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 CEP170Q5SW79 1584 aa18.93■□□□□ 0.62
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 NUP160Q12769 1436 aa18.91■□□□□ 0.62
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SHROOM2Q13796 1616 aa18.89■□□□□ 0.62
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.88■□□□□ 0.61
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 TOP2BQ02880 1626 aa18.85■□□□□ 0.61
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.61
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 KIF13AQ9H1H9 1805 aa18.81■□□□□ 0.6
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.8■□□□□ 0.6
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.78■□□□□ 0.6
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PGM5P4-AS1-201ENST00000416105 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms