RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414894.1

PRKCQ-AS1-201, PRKCQ antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene PRKCQ-AS1, Length 365 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
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PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.7□□□□□ -0.22
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
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PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 TOPBP1Q92547 1522 aa13.62□□□□□ -0.23
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PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.42□□□□□ -0.26
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PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 SOGA1O94964 1423 aa13.39□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.38□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 DMRT2Q9Y5R5 561 aa13.37□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.36□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.35□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 WDR97A6NE52 1622 aa13.32□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 SYNJ1O43426 1573 aa13.31□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 CUX1P39880 1505 aa13.3□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 GRIN2BQ13224 1484 aa13.29□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 SYNJ2O15056 1496 aa13.29□□□□□ -0.28
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.24□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 PBRM1Q86U86 1689 aa13.21□□□□□ -0.3
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
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PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.18□□□□□ -0.3
PRKCQ-AS1-201ENST00000414894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.16□□□□□ -0.3
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