RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414722.5

CASC2-201, Transcript of cancer susceptibility 2, humanhuman

TSL 5

Gene CASC2, Length 679 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2-201ENST00000414722 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.79■■■■■ 5.88
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CASC2-201ENST00000414722 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.86■■■■■ 4.45
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CASC2-201ENST00000414722 SCRIBQ14160 1630 aa42.07■■■■■ 4.33
CASC2-201ENST00000414722 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
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CASC2-201ENST00000414722 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.74■■■■■ 4.11
CASC2-201ENST00000414722 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.42■■■■■ 4.06
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CASC2-201ENST00000414722 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.93■■■■□ 3.98
CASC2-201ENST00000414722 NCAPD3P42695 1498 aa39.88■■■■□ 3.98
CASC2-201ENST00000414722 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.81■■■■□ 3.96
CASC2-201ENST00000414722 HMGXB3Q12766 1538 aa39.77■■■■□ 3.96
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CASC2-201ENST00000414722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.91■■■■□ 3.82
CASC2-201ENST00000414722 ERCC6Q03468 1493 aa38.82■■■■□ 3.81
CASC2-201ENST00000414722 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.72■■■■□ 3.79
CASC2-201ENST00000414722 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.6■■■■□ 3.77
CASC2-201ENST00000414722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.59■■■■□ 3.77
CASC2-201ENST00000414722 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.58■■■■□ 3.77
CASC2-201ENST00000414722 CFTRP13569 1480 aa38.53■■■■□ 3.76
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CASC2-201ENST00000414722 CUX2O14529 1486 aa38.36■■■■□ 3.73
CASC2-201ENST00000414722 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.33■■■■□ 3.73
CASC2-201ENST00000414722 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.31■■■■□ 3.72
CASC2-201ENST00000414722 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.22■■■■□ 3.71
CASC2-201ENST00000414722 WDR62O43379 1518 aa38.11■■■■□ 3.69
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CASC2-201ENST00000414722 ABCC8Q09428 1581 aa37.72■■■■□ 3.63
CASC2-201ENST00000414722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.72■■■■□ 3.63
CASC2-201ENST00000414722 TOPBP1Q92547 1522 aa37.72■■■■□ 3.63
CASC2-201ENST00000414722 IFT140Q96RY7 1462 aa37.47■■■■□ 3.59
CASC2-201ENST00000414722 CUX1P39880 1505 aa37.46■■■■□ 3.59
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CASC2-201ENST00000414722 SYNJ1O43426 1573 aa37.17■■■■□ 3.54
CASC2-201ENST00000414722 WDR97A6NE52 1622 aa37.09■■■■□ 3.53
CASC2-201ENST00000414722 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.07■■■■□ 3.52
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CASC2-201ENST00000414722 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
CASC2-201ENST00000414722 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.96■■■■□ 3.51
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CASC2-201ENST00000414722 PBRM1Q86U86 1689 aa36.84■■■■□ 3.49
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CASC2-201ENST00000414722 GRIN2BQ13224 1484 aa36.82■■■■□ 3.48
CASC2-201ENST00000414722 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.78■■■■□ 3.48
CASC2-201ENST00000414722 CHD1O14646 1710 aa36.77■■■■□ 3.48
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CASC2-201ENST00000414722 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
CASC2-201ENST00000414722 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
CASC2-201ENST00000414722 ADAMTS12P58397 1594 aa36.51■■■■□ 3.44
CASC2-201ENST00000414722 KIF27Q86VH2 1401 aa36.45■■■■□ 3.43
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CASC2-201ENST00000414722 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.3■■■■□ 3.4
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CASC2-201ENST00000414722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.04■■■■□ 3.36
CASC2-201ENST00000414722 SHROOM2Q13796 1616 aa35.94■■■■□ 3.34
CASC2-201ENST00000414722 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.91■■■■□ 3.34
CASC2-201ENST00000414722 ARAP1Q96P48 1450 aa35.9■■■■□ 3.34
CASC2-201ENST00000414722 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
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