RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.19■□□□□ 0.66
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
LRRTM4-202ENST00000409093 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.27■□□□□ 0.52
LRRTM4-202ENST00000409093 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.25■□□□□ 0.51
LRRTM4-202ENST00000409093 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.24■□□□□ 0.51
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC9O60706 1549 aa18.02■□□□□ 0.48
LRRTM4-202ENST00000409093 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.94■□□□□ 0.46
LRRTM4-202ENST00000409093 NACADO15069 1562 aa17.82■□□□□ 0.44
LRRTM4-202ENST00000409093 SCRIBQ14160 1630 aa17.73■□□□□ 0.43
LRRTM4-202ENST00000409093 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.64■□□□□ 0.41
LRRTM4-202ENST00000409093 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.34■□□□□ 0.37
LRRTM4-202ENST00000409093 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
LRRTM4-202ENST00000409093 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.18■□□□□ 0.34
LRRTM4-202ENST00000409093 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.1■□□□□ 0.33
LRRTM4-202ENST00000409093 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.1■□□□□ 0.33
LRRTM4-202ENST00000409093 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
LRRTM4-202ENST00000409093 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
LRRTM4-202ENST00000409093 WIZO95785 1651 aa17■□□□□ 0.31
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCA4P51532 1647 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRTM4-202ENST00000409093 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.93■□□□□ 0.3
LRRTM4-202ENST00000409093 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LRRTM4-202ENST00000409093 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.72■□□□□ 0.27
LRRTM4-202ENST00000409093 SMARCA2P51531 1590 aa16.66■□□□□ 0.26
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.63■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.63■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
LRRTM4-202ENST00000409093 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM41Q8WV44 630 aa16.54■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
LRRTM4-202ENST00000409093 HMGXB3Q12766 1538 aa16.45■□□□□ 0.22
LRRTM4-202ENST00000409093 NCAPD3P42695 1498 aa16.43■□□□□ 0.22
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC8Q09428 1581 aa16.38■□□□□ 0.21
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.32■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.31■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
LRRTM4-202ENST00000409093 MYT1Q01538 1121 aa16.27■□□□□ 0.19
LRRTM4-202ENST00000409093 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
LRRTM4-202ENST00000409093 SYNJ1O43426 1573 aa16.17■□□□□ 0.18
LRRTM4-202ENST00000409093 CFTRP13569 1480 aa16.13■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 PRDM2Q13029 1718 aa16.12■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 SOGA1O94964 1423 aa16.09■□□□□ 0.17
LRRTM4-202ENST00000409093 TOP2BQ02880 1626 aa16.07■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 EEA1Q15075 1411 aa16.06■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.05■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.04■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.02■□□□□ 0.16
LRRTM4-202ENST00000409093 CUX1P39880 1505 aa15.98■□□□□ 0.15
LRRTM4-202ENST00000409093 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.96■□□□□ 0.15
LRRTM4-202ENST00000409093 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.89■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 GOLGA3Q08378 1498 aa15.88■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 NESP48681 1621 aa15.88■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF21BO75037 1637 aa15.87■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.87■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.86■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.84■□□□□ 0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.83■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 CEP162Q5TB80 1403 aa15.81■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF27Q86VH2 1401 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.79■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.78■□□□□ 0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.76■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.74■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TOPBP1Q92547 1522 aa15.73■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 CUX2O14529 1486 aa15.72■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.72■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PRXQ9BXM0 1461 aa15.71■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.71■□□□□ 0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 CLIP1P30622 1438 aa15.64■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.64■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 IGF1RP08069 1367 aa15.61■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR97A6NE52 1622 aa15.58■□□□□ 0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.55■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.53■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.52■□□□□ 0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CUL7Q14999 1698 aa15.51■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.5■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 HRCP23327 699 aa15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.46■□□□□ 0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ARAP1Q96P48 1450 aa15.45■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 ERCC6Q03468 1493 aa15.44■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR62O43379 1518 aa15.44■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.41■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 APLP2Q06481 763 aa15.4■□□□□ 0.06
LRRTM4-202ENST00000409093 PBRM1Q86U86 1689 aa15.39■□□□□ 0.05
LRRTM4-202ENST00000409093 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms