RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391877.3

DEGS1-202, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene DEGS1, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-202ENST00000391877 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.9■■■□□ 2.54
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DEGS1-202ENST00000391877 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.35■■□□□ 1.81
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DEGS1-202ENST00000391877 SMARCA2P51531 1590 aa24.05■■□□□ 1.44
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DEGS1-202ENST00000391877 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
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DEGS1-202ENST00000391877 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.48■■□□□ 1.35
DEGS1-202ENST00000391877 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.43■■□□□ 1.34
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DEGS1-202ENST00000391877 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.24■■□□□ 1.31
DEGS1-202ENST00000391877 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.23■■□□□ 1.31
DEGS1-202ENST00000391877 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
DEGS1-202ENST00000391877 WDR62O43379 1518 aa23.2■■□□□ 1.3
DEGS1-202ENST00000391877 CFTRP13569 1480 aa23.19■■□□□ 1.3
DEGS1-202ENST00000391877 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.16■■□□□ 1.3
DEGS1-202ENST00000391877 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.13■■□□□ 1.29
DEGS1-202ENST00000391877 PRDM2Q13029 1718 aa23.01■■□□□ 1.27
DEGS1-202ENST00000391877 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.94■■□□□ 1.26
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DEGS1-202ENST00000391877 ABCC8Q09428 1581 aa22.75■■□□□ 1.23
DEGS1-202ENST00000391877 OSCARQ8IYS5 282 aa22.71■■□□□ 1.23
DEGS1-202ENST00000391877 IFT140Q96RY7 1462 aa22.71■■□□□ 1.23
DEGS1-202ENST00000391877 TOPBP1Q92547 1522 aa22.7■■□□□ 1.22
DEGS1-202ENST00000391877 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.65■■□□□ 1.22
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DEGS1-202ENST00000391877 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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DEGS1-202ENST00000391877 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
DEGS1-202ENST00000391877 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.38■■□□□ 1.17
DEGS1-202ENST00000391877 SOGA1O94964 1423 aa22.38■■□□□ 1.17
DEGS1-202ENST00000391877 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-202ENST00000391877 CHD1O14646 1710 aa22.35■■□□□ 1.17
DEGS1-202ENST00000391877 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.16
DEGS1-202ENST00000391877 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.16
DEGS1-202ENST00000391877 ARHGEF11O15085 1522 aa22.32■■□□□ 1.16
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DEGS1-202ENST00000391877 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.12■■□□□ 1.13
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DEGS1-202ENST00000391877 SYNJ2O15056 1496 aa22.12■■□□□ 1.13
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DEGS1-202ENST00000391877 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.11■■□□□ 1.13
DEGS1-202ENST00000391877 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.11■■□□□ 1.13
DEGS1-202ENST00000391877 SYNJ1O43426 1573 aa22.11■■□□□ 1.13
DEGS1-202ENST00000391877 PBRM1Q86U86 1689 aa22.11■■□□□ 1.13
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DEGS1-202ENST00000391877 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.08■■□□□ 1.12
DEGS1-202ENST00000391877 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.05■■□□□ 1.12
DEGS1-202ENST00000391877 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
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DEGS1-202ENST00000391877 GRIN2AQ12879 1464 aa21.9■■□□□ 1.1
DEGS1-202ENST00000391877 ADAMTS12P58397 1594 aa21.89■■□□□ 1.09
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DEGS1-202ENST00000391877 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.85■■□□□ 1.09
DEGS1-202ENST00000391877 NUP160Q12769 1436 aa21.84■■□□□ 1.09
DEGS1-202ENST00000391877 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
DEGS1-202ENST00000391877 CEP170Q5SW79 1584 aa21.8■■□□□ 1.08
DEGS1-202ENST00000391877 SHROOM2Q13796 1616 aa21.75■■□□□ 1.07
DEGS1-202ENST00000391877 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.7■■□□□ 1.06
DEGS1-202ENST00000391877 KIF27Q86VH2 1401 aa21.59■■□□□ 1.05
DEGS1-202ENST00000391877 JPH4Q96JJ6 628 aa21.59■■□□□ 1.05
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