RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

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Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.53□□□□□ -1.04
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.55□□□□□ -1.2
SNORD17-201ENST00000390930 ABCC9O60706 1549 aa7.42□□□□□ -1.22
SNORD17-201ENST00000390930 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNORD17-201ENST00000390930 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD17-201ENST00000390930 NACADO15069 1562 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD17-201ENST00000390930 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.1□□□□□ -1.27
SNORD17-201ENST00000390930 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.06□□□□□ -1.28
SNORD17-201ENST00000390930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.04□□□□□ -1.28
SNORD17-201ENST00000390930 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.01□□□□□ -1.29
SNORD17-201ENST00000390930 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
SNORD17-201ENST00000390930 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.95□□□□□ -1.3
SNORD17-201ENST00000390930 SCRIBQ14160 1630 aa6.91□□□□□ -1.3
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.86□□□□□ -1.31
SNORD17-201ENST00000390930 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.79□□□□□ -1.32
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SNORD17-201ENST00000390930 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.71□□□□□ -1.34
SNORD17-201ENST00000390930 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.67□□□□□ -1.34
SNORD17-201ENST00000390930 SMARCA4P51532 1647 aa6.61□□□□□ -1.35
SNORD17-201ENST00000390930 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.59□□□□□ -1.35
SNORD17-201ENST00000390930 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.59□□□□□ -1.36
SNORD17-201ENST00000390930 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SNORD17-201ENST00000390930 NCAPD3P42695 1498 aa6.57□□□□□ -1.36
SNORD17-201ENST00000390930 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.55□□□□□ -1.36
SNORD17-201ENST00000390930 SMARCA2P51531 1590 aa6.53□□□□□ -1.36
SNORD17-201ENST00000390930 WIZO95785 1651 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD17-201ENST00000390930 HMGXB3Q12766 1538 aa6.52□□□□□ -1.37
SNORD17-201ENST00000390930 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SNORD17-201ENST00000390930 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNORD17-201ENST00000390930 NESP48681 1621 aa6.44□□□□□ -1.38
SNORD17-201ENST00000390930 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SNORD17-201ENST00000390930 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.38□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.38□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.37□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.36□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 CFTRP13569 1480 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 ERCC6Q03468 1493 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD17-201ENST00000390930 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.33□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.3□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 PRDM2Q13029 1718 aa6.29□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 CUX2O14529 1486 aa6.28□□□□□ -1.4
SNORD17-201ENST00000390930 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.27□□□□□ -1.41
SNORD17-201ENST00000390930 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.27□□□□□ -1.41
SNORD17-201ENST00000390930 WDR62O43379 1518 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD17-201ENST00000390930 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SNORD17-201ENST00000390930 TOPBP1Q92547 1522 aa6.2□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 DNMBPQ6XZF7 1577 aa6.18□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 CUX1P39880 1505 aa6.18□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 ABCC8Q09428 1581 aa6.16□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SNORD17-201ENST00000390930 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.15□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.14□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 IFT140Q96RY7 1462 aa6.14□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 SYNJ1O43426 1573 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 SOGA1O94964 1423 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.12□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 WDR97A6NE52 1622 aa6.1□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 TOP2BQ02880 1626 aa6.1□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.1□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SNORD17-201ENST00000390930 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.08□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa6.06□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 CHD1O14646 1710 aa6.05□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 PBRM1Q86U86 1689 aa6.04□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.04□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.04□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 GRIN2BQ13224 1484 aa6.03□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 OSCARQ8IYS5 282 aa6.03□□□□□ -1.44
SNORD17-201ENST00000390930 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 FBLN2P98095 1184 aa6□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.99□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 ADAMTS12P58397 1594 aa5.99□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 SYNJ2O15056 1496 aa5.99□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 IGF1RP08069 1367 aa5.99□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.99□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.98□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.97□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 KIF27Q86VH2 1401 aa5.97□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 GRIN2AQ12879 1464 aa5.96□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.96□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.96□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.96□□□□□ -1.45
SNORD17-201ENST00000390930 NUP160Q12769 1436 aa5.96□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 CEP170Q5SW79 1584 aa5.96□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 ARHGEF11O15085 1522 aa5.95□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM41Q8WV44 630 aa5.95□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 CHIC1Q5VXU3 224 aa5.93□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.93□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.93□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 CUL7Q14999 1698 aa5.92□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 ARAP1Q96P48 1450 aa5.92□□□□□ -1.46
SNORD17-201ENST00000390930 SHROOM2Q13796 1616 aa5.92□□□□□ -1.46
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