RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383170.3

AQP4-202, Transcript of aquaporin 4, humanhuman

TSL 4

Gene AQP4, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4-202ENST00000383170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.29■■□□□ 1.96
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AQP4-202ENST00000383170 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.62■■□□□ 1.37
AQP4-202ENST00000383170 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.5■■□□□ 1.35
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AQP4-202ENST00000383170 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.03■■□□□ 1.28
AQP4-202ENST00000383170 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
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AQP4-202ENST00000383170 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
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AQP4-202ENST00000383170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.43■■□□□ 1.18
AQP4-202ENST00000383170 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.39■■□□□ 1.17
AQP4-202ENST00000383170 SCRIBQ14160 1630 aa22.34■■□□□ 1.17
AQP4-202ENST00000383170 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
AQP4-202ENST00000383170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.1■■□□□ 1.13
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AQP4-202ENST00000383170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.37■■□□□ 1.01
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AQP4-202ENST00000383170 SMARCA2P51531 1590 aa21.29■■□□□ 1
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AQP4-202ENST00000383170 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.13■□□□□ 0.97
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AQP4-202ENST00000383170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.06■□□□□ 0.96
AQP4-202ENST00000383170 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21■□□□□ 0.95
AQP4-202ENST00000383170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
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AQP4-202ENST00000383170 WDR62O43379 1518 aa20.78■□□□□ 0.92
AQP4-202ENST00000383170 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.77■□□□□ 0.92
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AQP4-202ENST00000383170 PRDM2Q13029 1718 aa20.33■□□□□ 0.85
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AQP4-202ENST00000383170 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
AQP4-202ENST00000383170 IFT140Q96RY7 1462 aa20.21■□□□□ 0.83
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AQP4-202ENST00000383170 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
AQP4-202ENST00000383170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
AQP4-202ENST00000383170 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.92■□□□□ 0.78
AQP4-202ENST00000383170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.84■□□□□ 0.77
AQP4-202ENST00000383170 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.83■□□□□ 0.77
AQP4-202ENST00000383170 WDR97A6NE52 1622 aa19.81■□□□□ 0.76
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AQP4-202ENST00000383170 FBLN2P98095 1184 aa19.78■□□□□ 0.76
AQP4-202ENST00000383170 SOGA1O94964 1423 aa19.77■□□□□ 0.76
AQP4-202ENST00000383170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
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AQP4-202ENST00000383170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.75■□□□□ 0.75
AQP4-202ENST00000383170 SYNJ1O43426 1573 aa19.73■□□□□ 0.75
AQP4-202ENST00000383170 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
AQP4-202ENST00000383170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
AQP4-202ENST00000383170 GRIN2BQ13224 1484 aa19.67■□□□□ 0.74
AQP4-202ENST00000383170 SYNJ2O15056 1496 aa19.67■□□□□ 0.74
AQP4-202ENST00000383170 PBRM1Q86U86 1689 aa19.63■□□□□ 0.73
AQP4-202ENST00000383170 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
AQP4-202ENST00000383170 TOP2BQ02880 1626 aa19.6■□□□□ 0.73
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AQP4-202ENST00000383170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.58■□□□□ 0.73
AQP4-202ENST00000383170 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.57■□□□□ 0.72
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AQP4-202ENST00000383170 ADAMTS12P58397 1594 aa19.44■□□□□ 0.7
AQP4-202ENST00000383170 CEP170Q5SW79 1584 aa19.42■□□□□ 0.7
AQP4-202ENST00000383170 SHROOM2Q13796 1616 aa19.4■□□□□ 0.7
AQP4-202ENST00000383170 NUP160Q12769 1436 aa19.4■□□□□ 0.7
AQP4-202ENST00000383170 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.35■□□□□ 0.69
AQP4-202ENST00000383170 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.29■□□□□ 0.68
AQP4-202ENST00000383170 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.29■□□□□ 0.68
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AQP4-202ENST00000383170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.27■□□□□ 0.68
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