RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379435.3

TRBV20OR9-2-201, Transcript of T cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional), humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV20OR9-2, Length 416 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.29■■■□□ 2.6
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.81■■■□□ 2.04
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TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.19■■□□□ 1.78
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.16■■□□□ 1.78
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NACADO15069 1562 aa26.12■■□□□ 1.77
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.84■■□□□ 1.73
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.64■■□□□ 1.7
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SCRIBQ14160 1630 aa25.42■■□□□ 1.66
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.38■■□□□ 1.65
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.03■■□□□ 1.6
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.94■■□□□ 1.58
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.61■■□□□ 1.53
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.42■■□□□ 1.5
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SMARCA4P51532 1647 aa24.29■■□□□ 1.48
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.13■■□□□ 1.45
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SMARCA2P51531 1590 aa24.09■■□□□ 1.45
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NCAPD3P42695 1498 aa24.09■■□□□ 1.45
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.01■■□□□ 1.43
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 HMGXB3Q12766 1538 aa23.98■■□□□ 1.43
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WIZO95785 1651 aa23.9■■□□□ 1.42
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NESP48681 1621 aa23.56■■□□□ 1.36
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.48■■□□□ 1.35
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ERCC6Q03468 1493 aa23.43■■□□□ 1.34
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.4■■□□□ 1.34
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.34■■□□□ 1.33
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.31■■□□□ 1.32
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.3■■□□□ 1.32
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CFTRP13569 1480 aa23.26■■□□□ 1.31
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PRDM2Q13029 1718 aa23.15■■□□□ 1.3
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.15■■□□□ 1.3
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CUX2O14529 1486 aa23.14■■□□□ 1.29
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.12■■□□□ 1.29
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.07■■□□□ 1.28
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WDR62O43379 1518 aa22.99■■□□□ 1.27
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TOPBP1Q92547 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.76■■□□□ 1.23
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ABCC8Q09428 1581 aa22.76■■□□□ 1.23
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CUX1P39880 1505 aa22.63■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IFT140Q96RY7 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
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TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.53■■□□□ 1.2
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SOGA1O94964 1423 aa22.5■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SYNJ1O43426 1573 aa22.46■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.46■■□□□ 1.19
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TOP2BQ02880 1626 aa22.44■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.4■■□□□ 1.18
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 WDR97A6NE52 1622 aa22.39■■□□□ 1.17
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.31■■□□□ 1.16
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.24■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 PBRM1Q86U86 1689 aa22.24■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GRIN2BQ13224 1484 aa22.22■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CHD1O14646 1710 aa22.21■■□□□ 1.15
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 OSCARQ8IYS5 282 aa22.2■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FBLN2P98095 1184 aa22.17■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SYNJ2O15056 1496 aa22.07■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.05■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ADAMTS12P58397 1594 aa22.04■■□□□ 1.12
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 KIF27Q86VH2 1401 aa22.01■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 TRIM41Q8WV44 630 aa22■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 GRIN2AQ12879 1464 aa21.95■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 IGF1RP08069 1367 aa21.91■■□□□ 1.1
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.89■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.89■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.89■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.87■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CUL7Q14999 1698 aa21.87■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ARHGEF11O15085 1522 aa21.86■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CEP170Q5SW79 1584 aa21.86■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 NUP160Q12769 1436 aa21.83■■□□□ 1.09
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.8■■□□□ 1.08
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.75■■□□□ 1.07
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 ARAP1Q96P48 1450 aa21.69■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 SHROOM2Q13796 1616 aa21.68■■□□□ 1.06
TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
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