RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328886.4

TMIGD1-201, Transcript of transmembrane and immunoglobulin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIGD1, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1-201ENST00000328886 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.36■■■□□ 2.29
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TMIGD1-201ENST00000328886 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.27■■□□□ 1.64
TMIGD1-201ENST00000328886 NACADO15069 1562 aa25.03■■□□□ 1.6
TMIGD1-201ENST00000328886 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.01■■□□□ 1.59
TMIGD1-201ENST00000328886 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.95■■□□□ 1.58
TMIGD1-201ENST00000328886 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
TMIGD1-201ENST00000328886 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.64■■□□□ 1.54
TMIGD1-201ENST00000328886 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.6■■□□□ 1.53
TMIGD1-201ENST00000328886 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.46■■□□□ 1.51
TMIGD1-201ENST00000328886 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TMIGD1-201ENST00000328886 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.23■■□□□ 1.47
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TMIGD1-201ENST00000328886 SCRIBQ14160 1630 aa24.11■■□□□ 1.45
TMIGD1-201ENST00000328886 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.01■■□□□ 1.43
TMIGD1-201ENST00000328886 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.99■■□□□ 1.43
TMIGD1-201ENST00000328886 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
TMIGD1-201ENST00000328886 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.12■■□□□ 1.29
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TMIGD1-201ENST00000328886 ERCC6Q03468 1493 aa23.05■■□□□ 1.28
TMIGD1-201ENST00000328886 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23■■□□□ 1.27
TMIGD1-201ENST00000328886 CUX2O14529 1486 aa22.99■■□□□ 1.27
TMIGD1-201ENST00000328886 SMARCA2P51531 1590 aa22.97■■□□□ 1.27
TMIGD1-201ENST00000328886 SMARCA4P51532 1647 aa22.96■■□□□ 1.27
TMIGD1-201ENST00000328886 HMGXB3Q12766 1538 aa22.92■■□□□ 1.26
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TMIGD1-201ENST00000328886 NESP48681 1621 aa22.79■■□□□ 1.24
TMIGD1-201ENST00000328886 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.7■■□□□ 1.22
TMIGD1-201ENST00000328886 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.63■■□□□ 1.21
TMIGD1-201ENST00000328886 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.62■■□□□ 1.21
TMIGD1-201ENST00000328886 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TMIGD1-201ENST00000328886 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.52■■□□□ 1.2
TMIGD1-201ENST00000328886 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.51■■□□□ 1.19
TMIGD1-201ENST00000328886 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.39■■□□□ 1.18
TMIGD1-201ENST00000328886 WIZO95785 1651 aa22.36■■□□□ 1.17
TMIGD1-201ENST00000328886 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.33■■□□□ 1.16
TMIGD1-201ENST00000328886 WDR62O43379 1518 aa22.25■■□□□ 1.15
TMIGD1-201ENST00000328886 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.23■■□□□ 1.15
TMIGD1-201ENST00000328886 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TMIGD1-201ENST00000328886 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.16■■□□□ 1.14
TMIGD1-201ENST00000328886 TRIM41Q8WV44 630 aa22.14■■□□□ 1.13
TMIGD1-201ENST00000328886 CFTRP13569 1480 aa22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1-201ENST00000328886 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TMIGD1-201ENST00000328886 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMIGD1-201ENST00000328886 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TMIGD1-201ENST00000328886 OSCARQ8IYS5 282 aa21.93■■□□□ 1.1
TMIGD1-201ENST00000328886 PRDM2Q13029 1718 aa21.9■■□□□ 1.1
TMIGD1-201ENST00000328886 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.81■■□□□ 1.08
TMIGD1-201ENST00000328886 IFT140Q96RY7 1462 aa21.77■■□□□ 1.08
TMIGD1-201ENST00000328886 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
TMIGD1-201ENST00000328886 TOPBP1Q92547 1522 aa21.71■■□□□ 1.07
TMIGD1-201ENST00000328886 ABCC8Q09428 1581 aa21.69■■□□□ 1.06
TMIGD1-201ENST00000328886 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1-201ENST00000328886 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1-201ENST00000328886 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.66■■□□□ 1.06
TMIGD1-201ENST00000328886 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.64■■□□□ 1.05
TMIGD1-201ENST00000328886 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TMIGD1-201ENST00000328886 ARHGEF11O15085 1522 aa21.56■■□□□ 1.04
TMIGD1-201ENST00000328886 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.03
TMIGD1-201ENST00000328886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TMIGD1-201ENST00000328886 CHD1O14646 1710 aa21.49■■□□□ 1.03
TMIGD1-201ENST00000328886 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TMIGD1-201ENST00000328886 FBLN2P98095 1184 aa21.48■■□□□ 1.03
TMIGD1-201ENST00000328886 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.44■■□□□ 1.02
TMIGD1-201ENST00000328886 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.4■■□□□ 1.02
TMIGD1-201ENST00000328886 SOGA1O94964 1423 aa21.39■■□□□ 1.02
TMIGD1-201ENST00000328886 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TMIGD1-201ENST00000328886 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.34■■□□□ 1.01
TMIGD1-201ENST00000328886 ARAP1Q96P48 1450 aa21.33■■□□□ 1.01
TMIGD1-201ENST00000328886 WDR97A6NE52 1622 aa21.32■■□□□ 1
TMIGD1-201ENST00000328886 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.32■■□□□ 1
TMIGD1-201ENST00000328886 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
TMIGD1-201ENST00000328886 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
TMIGD1-201ENST00000328886 CUX1P39880 1505 aa21.27■■□□□ 1
TMIGD1-201ENST00000328886 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
TMIGD1-201ENST00000328886 SYNJ1O43426 1573 aa21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1-201ENST00000328886 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1-201ENST00000328886 GRIN2BQ13224 1484 aa21.24■□□□□ 0.99
TMIGD1-201ENST00000328886 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.21■□□□□ 0.99
TMIGD1-201ENST00000328886 SYNJ2O15056 1496 aa21.18■□□□□ 0.98
TMIGD1-201ENST00000328886 PBRM1Q86U86 1689 aa21.15■□□□□ 0.98
TMIGD1-201ENST00000328886 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.13■□□□□ 0.97
TMIGD1-201ENST00000328886 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
TMIGD1-201ENST00000328886 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.07■□□□□ 0.96
TMIGD1-201ENST00000328886 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.05■□□□□ 0.96
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TMIGD1-201ENST00000328886 ADAMTS12P58397 1594 aa20.93■□□□□ 0.94
TMIGD1-201ENST00000328886 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.9■□□□□ 0.94
TMIGD1-201ENST00000328886 TOP2BQ02880 1626 aa20.89■□□□□ 0.94
TMIGD1-201ENST00000328886 CEP170Q5SW79 1584 aa20.87■□□□□ 0.93
TMIGD1-201ENST00000328886 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.87■□□□□ 0.93
TMIGD1-201ENST00000328886 NUP160Q12769 1436 aa20.87■□□□□ 0.93
TMIGD1-201ENST00000328886 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.86■□□□□ 0.93
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TMIGD1-201ENST00000328886 SHROOM2Q13796 1616 aa20.78■□□□□ 0.92
TMIGD1-201ENST00000328886 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TMIGD1-201ENST00000328886 JPH4Q96JJ6 628 aa20.67■□□□□ 0.9
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