RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa19.93■□□□□ 0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
PGGT1B-201ENST00000296642 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.41■□□□□ 0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC9O60706 1549 aa18.39■□□□□ 0.54
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.45■□□□□ 0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.44■□□□□ 0.38
PGGT1B-201ENST00000296642 NACADO15069 1562 aa17.23■□□□□ 0.35
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17.07■□□□□ 0.32
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
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PGGT1B-201ENST00000296642 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-201ENST00000296642 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-201ENST00000296642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.72■□□□□ 0.27
PGGT1B-201ENST00000296642 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.65■□□□□ 0.26
PGGT1B-201ENST00000296642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.59■□□□□ 0.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.5■□□□□ 0.23
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.46■□□□□ 0.23
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
PGGT1B-201ENST00000296642 SCRIBQ14160 1630 aa16.4■□□□□ 0.22
PGGT1B-201ENST00000296642 CUX2O14529 1486 aa16.1■□□□□ 0.17
PGGT1B-201ENST00000296642 ERCC6Q03468 1493 aa16.02■□□□□ 0.15
PGGT1B-201ENST00000296642 NCAPD3P42695 1498 aa15.86■□□□□ 0.13
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD1Q16676 465 aa15.82■□□□□ 0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCA2P51531 1590 aa15.75■□□□□ 0.11
PGGT1B-201ENST00000296642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.73■□□□□ 0.11
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGXB3Q12766 1538 aa15.73■□□□□ 0.11
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PGGT1B-201ENST00000296642 NESP48681 1621 aa15.63■□□□□ 0.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SMARCA4P51532 1647 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-201ENST00000296642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM41Q8WV44 630 aa15.61■□□□□ 0.09
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.6■□□□□ 0.09
PGGT1B-201ENST00000296642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.57■□□□□ 0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.44■□□□□ 0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.4■□□□□ 0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.38■□□□□ 0.05
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR62O43379 1518 aa15.33■□□□□ 0.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OSCARQ8IYS5 282 aa15.33■□□□□ 0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.2■□□□□ 0.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CFTRP13569 1480 aa15.1■□□□□ 0.01
PGGT1B-201ENST00000296642 WIZO95785 1651 aa15.09■□□□□ 0.01
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1B-201ENST00000296642 MSH5O43196 834 aa15.04■□□□□ -0
PGGT1B-201ENST00000296642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT140Q96RY7 1462 aa15□□□□□ -0.01
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF11O15085 1522 aa14.99□□□□□ -0.01
PGGT1B-201ENST00000296642 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
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PGGT1B-201ENST00000296642 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM2Q13029 1718 aa14.92□□□□□ -0.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC8Q09428 1581 aa14.92□□□□□ -0.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TOPBP1Q92547 1522 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 FBLN2P98095 1184 aa14.82□□□□□ -0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.78□□□□□ -0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 ARAP1Q96P48 1450 aa14.77□□□□□ -0.04
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD1O14646 1710 aa14.77□□□□□ -0.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.75□□□□□ -0.05
PGGT1B-201ENST00000296642 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR97A6NE52 1622 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNJ1O43426 1573 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SOGA1O94964 1423 aa14.64□□□□□ -0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.59□□□□□ -0.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.57□□□□□ -0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN2BQ13224 1484 aa14.57□□□□□ -0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNJ2O15056 1496 aa14.56□□□□□ -0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.52□□□□□ -0.08
PGGT1B-201ENST00000296642 PBRM1Q86U86 1689 aa14.42□□□□□ -0.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CUX1P39880 1505 aa14.4□□□□□ -0.1
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.36□□□□□ -0.11
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN2AQ12879 1464 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1B-201ENST00000296642 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.33□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.33□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP170Q5SW79 1584 aa14.3□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP160Q12769 1436 aa14.3□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.27□□□□□ -0.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ADRA2BP18089 450 aa14.27□□□□□ -0.13
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