RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.44■■■□□ 2.46
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SPC25-201ENST00000282074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.42■■□□□ 1.82
SPC25-201ENST00000282074 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.29■■□□□ 1.8
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SPC25-201ENST00000282074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.02■■□□□ 1.76
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SPC25-201ENST00000282074 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.24■■□□□ 1.63
SPC25-201ENST00000282074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.2■■□□□ 1.62
SPC25-201ENST00000282074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.13■■□□□ 1.61
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SPC25-201ENST00000282074 ERCC6Q03468 1493 aa24.21■■□□□ 1.47
SPC25-201ENST00000282074 NCAPD3P42695 1498 aa24.15■■□□□ 1.46
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SPC25-201ENST00000282074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.99■■□□□ 1.43
SPC25-201ENST00000282074 SMARCA2P51531 1590 aa23.91■■□□□ 1.42
SPC25-201ENST00000282074 HMGXB3Q12766 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
SPC25-201ENST00000282074 NESP48681 1621 aa23.86■■□□□ 1.41
SPC25-201ENST00000282074 SMARCA4P51532 1647 aa23.81■■□□□ 1.4
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SPC25-201ENST00000282074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.65■■□□□ 1.38
SPC25-201ENST00000282074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.6■■□□□ 1.37
SPC25-201ENST00000282074 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.59■■□□□ 1.37
SPC25-201ENST00000282074 TRIM41Q8WV44 630 aa23.56■■□□□ 1.36
SPC25-201ENST00000282074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.48■■□□□ 1.35
SPC25-201ENST00000282074 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.43■■□□□ 1.34
SPC25-201ENST00000282074 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.41■■□□□ 1.34
SPC25-201ENST00000282074 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.36■■□□□ 1.33
SPC25-201ENST00000282074 WDR62O43379 1518 aa23.28■■□□□ 1.32
SPC25-201ENST00000282074 OSCARQ8IYS5 282 aa23.21■■□□□ 1.31
SPC25-201ENST00000282074 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.18■■□□□ 1.3
SPC25-201ENST00000282074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.12■■□□□ 1.29
SPC25-201ENST00000282074 WIZO95785 1651 aa23.1■■□□□ 1.29
SPC25-201ENST00000282074 CFTRP13569 1480 aa23.02■■□□□ 1.28
SPC25-201ENST00000282074 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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SPC25-201ENST00000282074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SPC25-201ENST00000282074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.8■■□□□ 1.24
SPC25-201ENST00000282074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.8■■□□□ 1.24
SPC25-201ENST00000282074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.8■■□□□ 1.24
SPC25-201ENST00000282074 IFT140Q96RY7 1462 aa22.76■■□□□ 1.23
SPC25-201ENST00000282074 ARHGEF11O15085 1522 aa22.72■■□□□ 1.23
SPC25-201ENST00000282074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SPC25-201ENST00000282074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.67■■□□□ 1.22
SPC25-201ENST00000282074 PRDM2Q13029 1718 aa22.65■■□□□ 1.22
SPC25-201ENST00000282074 TOPBP1Q92547 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
SPC25-201ENST00000282074 ABCC8Q09428 1581 aa22.6■■□□□ 1.21
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SPC25-201ENST00000282074 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.59■■□□□ 1.21
SPC25-201ENST00000282074 FOXD1Q16676 465 aa22.57■■□□□ 1.2
SPC25-201ENST00000282074 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPC25-201ENST00000282074 FBLN2P98095 1184 aa22.51■■□□□ 1.19
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SPC25-201ENST00000282074 ARAP1Q96P48 1450 aa22.44■■□□□ 1.18
SPC25-201ENST00000282074 CHD1O14646 1710 aa22.43■■□□□ 1.18
SPC25-201ENST00000282074 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPC25-201ENST00000282074 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPC25-201ENST00000282074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPC25-201ENST00000282074 SOGA1O94964 1423 aa22.3■■□□□ 1.16
SPC25-201ENST00000282074 POTEDQ86YR6 584 aa22.29■■□□□ 1.16
SPC25-201ENST00000282074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SPC25-201ENST00000282074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.27■■□□□ 1.16
SPC25-201ENST00000282074 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
SPC25-201ENST00000282074 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.2■■□□□ 1.14
SPC25-201ENST00000282074 WDR97A6NE52 1622 aa22.19■■□□□ 1.14
SPC25-201ENST00000282074 SYNJ1O43426 1573 aa22.19■■□□□ 1.14
SPC25-201ENST00000282074 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPC25-201ENST00000282074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.15■■□□□ 1.14
SPC25-201ENST00000282074 GRIN2BQ13224 1484 aa22.14■■□□□ 1.13
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SPC25-201ENST00000282074 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.83■■□□□ 1.09
SPC25-201ENST00000282074 GRIN2AQ12879 1464 aa21.83■■□□□ 1.08
SPC25-201ENST00000282074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.79■■□□□ 1.08
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SPC25-201ENST00000282074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
SPC25-201ENST00000282074 CEP170Q5SW79 1584 aa21.76■■□□□ 1.07
SPC25-201ENST00000282074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.72■■□□□ 1.07
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTS12P58397 1594 aa21.71■■□□□ 1.07
SPC25-201ENST00000282074 SHROOM2Q13796 1616 aa21.67■■□□□ 1.06
SPC25-201ENST00000282074 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SPC25-201ENST00000282074 JPH4Q96JJ6 628 aa21.63■■□□□ 1.05
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