RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253470.4

TTTY11-201, Transcript of testis-specific transcript, Y-linked 11, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTTY11, Length 837 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTTY11-201ENST00000253470 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.66■■□□□ 1.54
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TTTY11-201ENST00000253470 SMARCA2P51531 1590 aa19.19■□□□□ 0.66
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TTTY11-201ENST00000253470 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.86■□□□□ 0.61
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TTTY11-201ENST00000253470 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.78■□□□□ 0.6
TTTY11-201ENST00000253470 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa18.76■□□□□ 0.59
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TTTY11-201ENST00000253470 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.64■□□□□ 0.57
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TTTY11-201ENST00000253470 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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TTTY11-201ENST00000253470 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.01■□□□□ 0.47
TTTY11-201ENST00000253470 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.01■□□□□ 0.47
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TTTY11-201ENST00000253470 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
TTTY11-201ENST00000253470 ARHGEF11O15085 1522 aa17.97■□□□□ 0.47
TTTY11-201ENST00000253470 SOGA1O94964 1423 aa17.97■□□□□ 0.47
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TTTY11-201ENST00000253470 GRIN2BQ13224 1484 aa17.77■□□□□ 0.44
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TTTY11-201ENST00000253470 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.71■□□□□ 0.43
TTTY11-201ENST00000253470 SYNJ1O43426 1573 aa17.69■□□□□ 0.42
TTTY11-201ENST00000253470 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.66■□□□□ 0.42
TTTY11-201ENST00000253470 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.63■□□□□ 0.41
TTTY11-201ENST00000253470 PBRM1Q86U86 1689 aa17.62■□□□□ 0.41
TTTY11-201ENST00000253470 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.61■□□□□ 0.41
TTTY11-201ENST00000253470 GRIN2AQ12879 1464 aa17.54■□□□□ 0.4
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TTTY11-201ENST00000253470 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.5■□□□□ 0.39
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