RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 PSR2Q07949 397 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 TY4A-HQ6Q5P6 413 aa10.54□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data10.53□□□□□ -0.72not detected
RDN25-1RDN25-1 ECM4P36156 370 aa10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 SUM1P46676 1062 aa10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 PTK2P47116 818 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 EIS1Q05050 843 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 DCS2Q12123 353 aa10.53□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 CDC11P32458 415 aa10.52□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 YEL1P34225 687 aa10.52□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 CSC1Q06538 782 aa10.52□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 ATG9Q12142 997 aa10.52□□□□□ -0.72
RDN25-1RDN25-1 PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 IES2P40154 320 aa10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.52□□□□□ -0.73not detected
RDN25-1RDN25-1 CHO2P05374 869 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YKR018CP36114 725 aa10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 IST1P53843 298 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 EST2Q06163 884 aa10.52□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data10.51□□□□□ -0.73not detected
RDN25-1RDN25-1 YKU80Q04437 629 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 MMR1Q06324 491 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RER2P35196 286 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 SHM1P37292 490 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ERC1P38767 581 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YIR042CP40586 236 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 PGI1P12709 554 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ARG1P22768 420 aa10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 URA1P28272 314 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RAD16P31244 790 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 DSL1P53847 754 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YOR223WQ12015 292 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ENT1Q12518 454 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RSF2P46974 1380 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 OPI1P21957 404 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 LSC2P53312 427 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RCF1Q03713 159 aa10.5□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YET1P35723 206 aa10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ECM23Q02710 187 aa10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 MET1P36150 593 aa10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 PDR1P12383 1068 aa10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ADE17P38009 592 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 GFD1Q04839 188 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YLR001CQ07895 862 aa10.49□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 CLN1P20437 546 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 NPL6P32832 435 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 CLB4P24871 460 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 HAL5P38970 855 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 MTC5Q03897 1148 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RRP6Q12149 733 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RAD1P06777 1100 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 REB1P21538 810 aa10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 CDC48P25694 835 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 NGR1P32831 672 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RRP8P38961 392 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 GCD2P12754 651 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 SWI4P25302 1093 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YFR006WP43590 535 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 DAS1P47005 663 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 PPM2Q08282 695 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 OSH3P38713 996 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 SIP3P38717 1229 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 SHE4P51534 789 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 DPL1Q05567 589 aa10.47□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 COQ1P18900 473 aa10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 RPC19P28000 142 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ATG3P40344 310 aa10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 SDA1P53313 767 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 VPS38Q05919 439 aa10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 YPL216WQ08964 1102 aa10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ARD1P07347 238 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 ATG23Q06671 453 aa10.46□□□□□ -0.73
RDN25-1RDN25-1 PHO13P19881 312 aa10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 SMY2P32909 740 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 TIF3P34167 436 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 RFT1P38206 574 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 PTP3P40048 928 aa10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 ESF2P53743 316 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 COBP00163 385 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 FMS1P50264 508 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 YML119WQ03208 357 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 CFT2Q12102 859 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 PDB1P32473 366 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 RPC25P35718 212 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 YGR237CP50089 785 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 PLP1Q04004 230 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 BUD14P27637 709 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 CCT4P39078 528 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 APP1P53933 587 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 MET7Q08645 548 aa10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 GET3Q12154 354 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 UBP1P25037 809 aa10.44□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 YOL075CQ08234 1294 aa10.44□□□□□ -0.74
RDN25-1RDN25-1 SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
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