Protein–RNA interactions for Protein: Q06671

ATG23, Autophagy-related protein 23, yeastyeast

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG23Q06671 NSR1YGR159C 1245 nt21.28■■□□□ 1
ATG23Q06671 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.98■□□□□ 0.95
ATG23Q06671 NOP1YDL014W 984 nt20.13■□□□□ 0.81
ATG23Q06671 MDJ1YFL016C 1536 nt19.46■□□□□ 0.71
ATG23Q06671 YKL036CYKL036C 393 nt18.1■□□□□ 0.49
ATG23Q06671 YJL027CYJL027C 417 nt17.87■□□□□ 0.45
ATG23Q06671 SRX1YKL086W 384 nt17.61■□□□□ 0.41
ATG23Q06671 Q0297Q0297 156 nt17.47■□□□□ 0.39
ATG23Q06671 DBP2YNL112W 1641 nt17.01■□□□□ 0.31
ATG23Q06671 YBR190WYBR190W 312 nt16.69■□□□□ 0.26
ATG23Q06671 YCR051WYCR051W 669 nt16.66■□□□□ 0.26
ATG23Q06671 SCS3YGL126W 1143 nt16.31■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 RTC3YHR087W 336 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG23Q06671 CCC1YLR220W 969 nt16.06■□□□□ 0.16
ATG23Q06671 SSA3YBL075C 1950 nt15.89■□□□□ 0.13
ATG23Q06671 RVS167YDR388W 1449 nt15.81■□□□□ 0.12
ATG23Q06671 SCJ1YMR214W 1134 nt15.71■□□□□ 0.11
ATG23Q06671 YOL085CYOL085C 342 nt15.7■□□□□ 0.1
ATG23Q06671 RPP1BYDL130W 321 nt15.68■□□□□ 0.1
ATG23Q06671 PUT4YOR348C 1884 nt15.61■□□□□ 0.09
ATG23Q06671 PKP1YIL042C 1185 nt15.54■□□□□ 0.08
ATG23Q06671 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.2■□□□□ 0.02
ATG23Q06671 ARE1YCR048W 1833 nt15.17■□□□□ 0.02
ATG23Q06671 SHR5YOL110W 714 nt15.16■□□□□ 0.02
ATG23Q06671 PET122YER153C 765 nt15.07■□□□□ 0
ATG23Q06671 URN1YPR152C 1398 nt15.07■□□□□ 0
ATG23Q06671 POA1YBR022W 534 nt15.05■□□□□ -0
ATG23Q06671 SAH1YER043C 1350 nt15.01□□□□□ -0.01
ATG23Q06671 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.98□□□□□ -0.01
ATG23Q06671 OPI9YLR338W 858 nt14.96□□□□□ -0.01
ATG23Q06671 DEP1YAL013W 1218 nt14.91□□□□□ -0.02
ATG23Q06671 BSC6YOL137W 1494 nt14.85□□□□□ -0.03
ATG23Q06671 SCR1SCR1 522 nt14.71□□□□□ -0.05
ATG23Q06671 YDJ1YNL064C 1230 nt14.7□□□□□ -0.06
ATG23Q06671 RPN10YHR200W 807 nt14.69□□□□□ -0.06
ATG23Q06671 YNL208WYNL208W 600 nt14.6□□□□□ -0.07
ATG23Q06671 SPT5YML010W 3192 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG23Q06671 ATS1YAL020C 1002 nt14.57□□□□□ -0.08
ATG23Q06671 BUD23YCR047C 828 nt14.55□□□□□ -0.08
ATG23Q06671 RRN5YLR141W 1092 nt14.55□□□□□ -0.08
ATG23Q06671 PUN1YLR414C 792 nt14.51□□□□□ -0.09
ATG23Q06671 GAR1YHR089C 618 nt14.46□□□□□ -0.09
ATG23Q06671 PTC2YER089C 1395 nt14.43□□□□□ -0.1
ATG23Q06671 YJR018WYJR018W 363 nt14.32□□□□□ -0.12
ATG23Q06671 SSA4YER103W 1929 nt14.31□□□□□ -0.12
ATG23Q06671 NAB2YGL122C 1578 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG23Q06671 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.27□□□□□ -0.13
ATG23Q06671 FIS1YIL065C 468 nt14.13□□□□□ -0.15
ATG23Q06671 RSB1YOR049C 1065 nt14.09□□□□□ -0.15
ATG23Q06671 YJR120WYJR120W 351 nt14.07□□□□□ -0.16
ATG23Q06671 DAL1YIR027C 1383 nt14.03□□□□□ -0.16
ATG23Q06671 TIR1YER011W 765 nt14□□□□□ -0.17
ATG23Q06671 MEP2YNL142W 1500 nt13.99□□□□□ -0.17
ATG23Q06671 FPR4YLR449W 1179 nt13.97□□□□□ -0.17
ATG23Q06671 SSA1YAL005C 1929 nt13.97□□□□□ -0.17
ATG23Q06671 PHO4YFR034C 939 nt13.92□□□□□ -0.18
ATG23Q06671 RPP2BYDR382W 333 nt13.87□□□□□ -0.19
ATG23Q06671 INM2YDR287W 879 nt13.85□□□□□ -0.19
ATG23Q06671 YPS1YLR120C 1710 nt13.84□□□□□ -0.19
ATG23Q06671 BDF1YLR399C 2061 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG23Q06671 DCW1YKL046C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
ATG23Q06671 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.7□□□□□ -0.22
ATG23Q06671 SRB2YHR041C 633 nt13.68□□□□□ -0.22
ATG23Q06671 YBL100CYBL100C 315 nt13.68□□□□□ -0.22
ATG23Q06671 YDR095CYDR095C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG23Q06671 TAT1YBR069C 1860 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG23Q06671 EMI2YDR516C 1503 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG23Q06671 PST2YDR032C 597 nt13.53□□□□□ -0.24
ATG23Q06671 BDH2YAL061W 1254 nt13.53□□□□□ -0.24
ATG23Q06671 YBR220CYBR220C 1683 nt13.5□□□□□ -0.25
ATG23Q06671 FUN26YAL022C 1554 nt13.49□□□□□ -0.25
ATG23Q06671 YMR090WYMR090W 684 nt13.46□□□□□ -0.25
ATG23Q06671 YDL221WYDL221W 552 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG23Q06671 PTP1YDL230W 1008 nt13.43□□□□□ -0.26
ATG23Q06671 CAC2YML102W 1407 nt13.41□□□□□ -0.26
ATG23Q06671 ALF1YNL148C 765 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG23Q06671 RPP2AYOL039W 321 nt13.39□□□□□ -0.27
ATG23Q06671 SDH1YKL148C 1923 nt13.36□□□□□ -0.27
ATG23Q06671 TRM9YML014W 840 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG23Q06671 WWM1YFL010C 636 nt13.31□□□□□ -0.28
ATG23Q06671 CCT6YDR188W 1641 nt13.28□□□□□ -0.28
ATG23Q06671 LSM3YLR438C-A 270 nt13.23□□□□□ -0.29
ATG23Q06671 SIS1YNL007C 1059 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG23Q06671 IRC15YPL017C 1500 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG23Q06671 SCC4YER147C 1875 nt13.2□□□□□ -0.3
ATG23Q06671 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG23Q06671 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG23Q06671 GIS3YLR094C 1509 nt13.13□□□□□ -0.31
ATG23Q06671 GFD2YCL036W 1701 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG23Q06671 PCH2YBR186W 1695 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG23Q06671 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.09□□□□□ -0.31
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