RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	DIT2	P21595	489 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	FAR11	P53917	953 aa		12.47	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	YLR278C	Q05854	1341 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RAD53	P22216	821 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	ASF1	P32447	279 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	YBL028C	P38202	106 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	NIT1	P40447	199 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	RSM25	P40496	264 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	GDE1	Q02979	1223 aa		12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
DDR2	YOL052C-A	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CBP1	P07252	654 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	RDS1	P25611	832 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CST26	P38226	397 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CSM2	P40465	213 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	EMP47	P43555	445 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	FOL1	P53848	824 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	AIM7	Q12156	149 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	YOR111W	Q99210	232 aa		12.45	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	MBR1	P23493	339 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	RXT2	P38255	430 aa		12.44	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CEX1	Q12453	761 aa		12.43	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	TUS1	Q06412	1307 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	CHS3	P29465	1165 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	PCI8	P40512	444 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	VPS30	Q02948	557 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	MYO1	P08964	1928 aa		12.42	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	NUC1	P08466	329 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	GAL2	P13181	574 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	ACE2	P21192	770 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	DSE3	Q08729	430 aa		12.41	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	SEC20	P28791	383 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	RPN12	P32496	274 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	MDM1	Q01846	1127 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	DCS2	Q12123	353 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	APC11	Q12157	165 aa		12.4	□□□□□ -0.42
DDR2	YOL052C-A	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CDC6	P09119	513 aa		12.39	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	VPS45	P38932	577 aa		12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	LAP2	Q10740	671 aa		12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CSR2	Q12734	1121 aa		12.38	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CIT1	P00890	479 aa		12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	YGL138C	P53122	345 aa		12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		12.37	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	ERG12	P07277	443 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	UBP9	P39967	754 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	PEA2	P40091	420 aa		12.36	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	TPM2	P40414	161 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	SOL4	P53315	255 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	TIP41	Q12199	356 aa		12.35	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.34	□□□□□ -0.43	not detected
DDR2	YOL052C-A	RGP1	P16664	663 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	LSB1	P53281	241 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	PUS5	Q06244	254 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	CSC1	Q06538	782 aa		12.34	□□□□□ -0.43
DDR2	YOL052C-A	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	DID4	P36108	232 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	ACA1	P39970	489 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	RTC4	P53850	401 aa		12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	12.33	□□□□□ -0.44	not detected
DDR2	YOL052C-A	TAF13	P11747	167 aa		12.32	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	YPT11	P48559	417 aa		12.32	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	RET3	P53600	189 aa		12.32	□□□□□ -0.44
DDR2	YOL052C-A	YOR296W	Q08748	1289 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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