RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W RTG2P32608 588 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W VPS24P36095 224 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W PPX1P38698 397 aa4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W IRC24P40580 263 aa4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
YPT53YNL093W GRX3Q03835 250 aa4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W CYB2P00175 591 aa4.74□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W CTF4Q01454 927 aa4.74□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W RPC31P17890 251 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W MSM1P22438 575 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W RAD51P25454 400 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W BRF1P29056 596 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W STE5P32917 917 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W TTI1P36097 1038 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W YKR073CP36153 106 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W APM2P38700 605 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W PIL1P53252 339 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W PHM6Q05637 104 aa4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W MEP1P40260 492 aa4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W TIM54P47045 478 aa4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W AVT1P47082 602 aa4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W POL32P47110 350 aa4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W GPI8P49018 411 aa4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W ARI1P53111 347 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
YPT53YNL093W IDI1P15496 288 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SAS3P34218 831 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W PES4P39684 611 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W VAC8P39968 578 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W QDR2P40474 542 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W BFA1P47113 574 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W VPS5Q92331 675 aa4.71□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W PET111P08468 800 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W UBP1P25037 809 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W PHO87P25360 923 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W NGR1P32831 672 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W NPR3P38742 1146 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MSH4P40965 878 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W ITC1P53125 1264 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YPR172WQ06608 200 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YLR122CQ12312 125 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W CEX1Q12453 761 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SAC3P46674 1301 aa4.7□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W FOB1O13329 566 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W INH1P01097 85 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W ATE1P16639 503 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SFA1P32771 386 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SCD5P34758 872 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W JNM1P36224 373 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YAP1801P38856 637 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MNN1P39106 762 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YEN1P40028 759 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W IOC3P43596 787 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YJR142WP47173 342 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W CTH1P47976 325 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W ROM1P53046 1155 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YML083CQ04526 418 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W KAR5Q04746 504 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W GRC3Q07845 632 aa4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SEC8P32855 1065 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SEC9P40357 651 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W TED1P40533 473 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W DAK2P43550 591 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W BNI5P53890 448 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YNL011CP53980 444 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W ATG16Q03818 150 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YBL113CQ7M4S9 792 aa4.68□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MET6P05694 767 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SPS1P08458 490 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W COQ2P32378 372 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W KAE1P36132 386 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W RIX1P38883 763 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W UBP12P39538 1254 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W VID27P40157 782 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W VTI1Q04338 217 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SPO20Q04359 397 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W RSC2Q06488 889 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W MED7Q08278 222 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W YOR131CQ12486 218 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W INO80P53115 1489 aa4.67□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W HAP4P14064 554 aa4.66□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W NAM7P30771 971 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W SUV3P32580 737 aa4.66□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YPT53YNL093W DOT6P40059 670 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
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