RNA–Protein interactions for RNA: YLR297W

YLR297W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YLR297W, Length 390 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR297W	YLR297W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YLR297W	YLR297W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YLR297W	YLR297W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR297W	YLR297W	TAF7	Q05021	590 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YLR297W	YLR297W	UGA4	P32837	571 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	CTH1	P47976	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SAM37	P50110	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	YAF9	P53930	226 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SDH1	Q00711	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PMT7	Q06644	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	YIG1	Q08956	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SPO74	P45819	413 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	IPL1	P38991	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MEC3	Q02574	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	WHI5	Q12416	295 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MET4	P32389	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SEA4	P38164	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MMM1	P41800	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	GCV1	P48015	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PEX13	P80667	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	DAL4	Q04895	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	TOS4	Q06266	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	HSL1	P34244	1518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
YLR297W	YLR297W	YKL077W	P36081	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SLS1	P42900	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	DAK2	P43550	591 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	SAP155	P43612	1002 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	EAR1	Q03212	550 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YLR297W	YLR297W	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	EXO5	P38289	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	AVT1	P47082	602 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	RSM26	P47141	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	YGR045C	P53229	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	YNR063W	P53749	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	RCM1	P53972	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	NFS1	P25374	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	CIT3	P43635	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	MSH3	P25336	1018 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	PPX1	P38698	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	NEM1	P38757	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	VPS35	P34110	944 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	SQT1	P35184	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	ULP1	Q02724	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	OXR1	Q08952	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	SHU2	P38957	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	FAA3	P39002	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	NSI1	Q12457	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	LRG1	P35688	1017 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	XKS1	P42826	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	HIR3	P47171	1648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	PEX28	P38848	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	ALT1	P52893	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	TPP1	Q03796	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YLR297W	YLR297W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YLR297W	YLR297W	SEC20	P28791	383 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR297W	YLR297W	ATG14	P38270	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YLR297W	YLR297W	YAR028W	P39548	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55 ms