RNA–Protein interactions for RNA: YOR317W

FAA1, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA1	YOR317W	MDJ2	P42834	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
FAA1	YOR317W	YGR021W	P53212	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	CDC45	Q08032	650 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	FOB1	O13329	566 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	COX6	P00427	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RKM3	P38222	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	VID27	P40157	782 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	GPI8	P49018	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	IRC3	Q06683	689 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	MNL2	Q12205	849 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	HSP42	Q12329	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	CYB2	P00175	591 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PIF1	P07271	859 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PPH3	P32345	308 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SEC9	P40357	651 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	BFA1	P47113	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RCF1	Q03713	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PSR1	Q07800	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RAD51	P25454	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	NPL4	P33755	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PAF1	P38351	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	DAK2	P43550	591 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	TEA1	P47988	759 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RTF1	P53064	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	YNL108C	P53929	270 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	ATG16	Q03818	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SSM4	P40318	1319 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	MST1	P07236	462 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	not detected
FAA1	YOR317W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PEA2	P40091	420 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PHM6	Q05637	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	BDF2	Q07442	638 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	RRI2	Q12348	645 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SIT4	P20604	311 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	BRF1	P29056	596 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	TGL4	P36165	910 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	TAT2	P38967	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	VPS16	Q03308	798 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	PPM2	Q08282	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FAA1	YOR317W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	YBL036C	P38197	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	VPS29	P38759	282 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	VHR2	P40041	505 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MRX10	Q05648	414 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	GRC3	Q07845	632 aa		4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MRC1	P25588	1096 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	DPB3	P27344	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	TFC3	P34111	1160 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	FYV10	P40492	516 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	EMP47	P43555	445 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	SPO20	Q04359	397 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	CEX1	Q12453	761 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	RAD4	P14736	754 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	HSE1	P38753	452 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MTO1	P53070	669 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	KAR5	Q04746	504 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	PIN2	Q12057	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	YAP1801	P38856	637 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	YHR218W	P38899	603 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	THI12	P42883	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	THI5	P43534	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	YJL049W	P47048	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	THI11	P47183	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	PIB1	Q06651	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	THI13	Q07748	340 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	ANP1	P32629	500 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	STE5	P32917	917 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAA1	YOR317W	SLX4	Q12098	748 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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