RNA–Protein interactions for RNA: YHL029C

OCA5, Transcript of Cytoplasmic protein required for replication of Brome mosaic virus, yeast

Gene OCA5, Length 2,040 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA5	YHL029C	MNR2	P35724	969 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	HEL1	P36113	551 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RFC5	P38251	354 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ATG14	P38270	344 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.74	□□□□□ -1.49	not detected
OCA5	YHL029C	YML119W	Q03208	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	COG4	Q06096	861 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	AOS1	Q06624	347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	OMS1	Q06668	471 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	DRS2	P39524	1355 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	HIR2	P32480	875 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	TFC3	P34111	1160 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	KDX1	P36005	433 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ILM1	P47155	203 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ALD2	P47771	506 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	CWH41	P53008	833 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	KRE28	Q04431	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ATG9	Q12142	997 aa		5.74	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RKR1	Q04781	1562 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RAV1	P47104	1357 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	DNF2	Q12675	1612 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	FAR1	P21268	830 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	STE11	P23561	717 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ELM1	P32801	640 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YEL1	P34225	687 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	LHS1	P36016	881 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YIR042C	P40586	236 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YGL082W	P53155	381 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RIA1	P53893	1110 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	IOC2	Q12072	812 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	APC2	Q12440	853 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YRF1-4	O13559	1382 aa		5.73	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	DAL5	P15365	543 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SPT8	P38915	602 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YIL092W	P40497	633 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RTF1	P53064	558 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	DSL1	P53847	754 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SPP1	Q03012	353 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	BIK1	P11709	440 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	BUD14	P27637	709 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SWC3	P31376	625 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	RGD1	P38339	666 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	VNX1	P42839	908 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	NPA3	P47122	385 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	ORM1	P53224	222 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	APC11	Q12157	165 aa		5.72	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SWI1	P09547	1314 aa		5.71	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	PDR18	P53756	1333 aa		5.71	□□□□□ -1.49
OCA5	YHL029C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	CLB4	P24871	460 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	SRL3	P36167	246 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	YJL171C	P46992	396 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	YJR142W	P47173	342 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	BNI4	P53858	892 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
OCA5	YHL029C	FMP30	Q02883	468 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	HOT1	Q03213	719 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	PKH1	Q03407	766 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	YPR172W	Q06608	200 aa		5.71	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	YLF2	P38746	405 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	VID28	P40547	921 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	ATG36	P46983	293 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	CIR2	Q08822	631 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	HAP1	P0CE41	1502 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	SEC66	P33754	206 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	MSN5	P52918	1224 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	TPO2	P53283	614 aa		5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
OCA5	YHL029C	SEC6	P32844	805 aa		5.69	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms