RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mink1Q9JM52 1308 aa33.27■■■□□ 2.92
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mrs2Q5NCE8 434 aa33.25■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 PzpQ61838 1495 aa33.25■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cps1Q8C196 1500 aa33.23■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cnga1P29974 684 aa33.23■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 NktrP30415 1453 aa33.22■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa33.21■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arap3Q8R5G7 1538 aa33.2■■■□□ 2.91
Odc1-201ENSMUST00000171737 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zranb1Q7M760 708 aa33.17■■■□□ 2.9
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp32F8VPZ3 1604 aa33.16■■■□□ 2.9
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa33.16■■■□□ 2.9
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pik3r4Q8VD65 1358 aa33.12■■■□□ 2.89
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa33.11■■■□□ 2.89
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdk19Q8BWD8 501 aa33.08■■■□□ 2.89
Odc1-201ENSMUST00000171737 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
Odc1-201ENSMUST00000171737 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nrxn1Q9CS84 1514 aa33.05■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gsto1O09131 240 aa33.04■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa33.04■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rims2Q9EQZ7 1530 aa33.04■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa33.04■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dcaf11Q91VU6 549 aa33.02■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif7B7ZNG0 1348 aa33.02■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa33.02■■■□□ 2.88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tex14Q7M6U3 1450 aa33■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa32.99■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa32.98■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stra8P70278 393 aa32.97■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q7TT23 1179 aa32.97■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Brwd3A2AHJ4 1799 aa32.97■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa32.96■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 NrdcQ8BHG1 1161 aa32.96■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrl1Q80TR1 1466 aa32.95■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa32.95■■■□□ 2.87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Med1Q925J9 1575 aa32.94■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa32.93■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa32.92■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 FanciQ8K368 1330 aa32.9■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 KdrP35918 1367 aa32.89■■■□□ 2.86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k19E9Q3S4 1311 aa32.87■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q3UJC8 639 aa32.86■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scn4aQ9ER60 1841 aa32.85■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf710Q3U288 666 aa32.84■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 NinlQ6ZQ12 1394 aa32.84■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf316Q6PGE4 1016 aa32.82■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 C5P06684 1680 aa32.82■■■□□ 2.85
Odc1-201ENSMUST00000171737 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Als2Q920R0 1651 aa32.81■■■□□ 2.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtpruB1AUH1 1446 aa32.8■■■□□ 2.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa32.8■■■□□ 2.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zscan21Q07231 555 aa32.8■■■□□ 2.84
Odc1-201ENSMUST00000171737 NalcnQ8BXR5 1738 aa32.75■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmem94Q7TSH8 1360 aa32.74■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tns3Q5SSZ5 1440 aa32.73■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Idi2Q8BFZ6 227 aa32.73■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc10Q8R4P9 1501 aa32.73■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Anks4bQ8K3X6 423 aa32.73■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 C3P01027 1663 aa32.71■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sirt1Q923E4 737 aa32.71■■■□□ 2.83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Col14a1Q80X19 1797 aa32.68■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atf7ipQ7TT18 1306 aa32.68■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm10563F6WIE4 79 aa32.66■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa32.66■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 P2rx7Q9Z1M0 595 aa32.65■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mon2Q80TL7 1715 aa32.64■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
Odc1-201ENSMUST00000171737 CatipB9EKE5 520 aa32.63■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif1aP33173 1695 aa32.63■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nlrp6Q91WS2 869 aa32.63■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Iqsec2Q5DU25 1478 aa32.63■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa32.62■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Idi1P58044 227 aa32.62■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif16bB1AVY7 1312 aa32.6■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa32.6■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa32.57■■■□□ 2.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 Esx1O88933 382 aa32.56■■■□□ 2.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sox12Q04890 314 aa32.55■■■□□ 2.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 NgefQ8CHT1 710 aa32.55■■■□□ 2.8
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pik3c2aQ61194 1686 aa32.5■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Col18a1P39061 1774 aa32.49■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ofd1Q80Z25 1017 aa32.49■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pip4k2bQ80XI4 416 aa32.48■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rapgef3Q8VCC8 918 aa32.48■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf335A2A5K6 1337 aa32.46■■■□□ 2.79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp19Q3UJD6 1360 aa32.43■■■□□ 2.78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slain2Q8CI08 581 aa32.42■■■□□ 2.78
Odc1-201ENSMUST00000171737 GsdmaQ9EST1 446 aa32.42■■■□□ 2.78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ap3b2Q9JME5 1082 aa32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms