RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mink1Q9JM52 1308 aa33,27■■■□□ 2,92
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Cnga1P29974 684 aa33,23■■■□□ 2,91
Odc1-201ENSMUST00000171737 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP33,22■■■□□ 2,91
Odc1-201ENSMUST00000171737 NktrP30415 1453 aa33,22■■■□□ 2,91
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Adgrl1Q80TR1 1466 aa32,95■■■□□ 2,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa32,95■■■□□ 2,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Med1Q925J9 1575 aa32,94■■■□□ 2,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa32,93■■■□□ 2,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP32,93■■■□□ 2,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa32,92■■■□□ 2,86
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP32,89■■■□□ 2,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 KdrP35918 1367 aa32,89■■■□□ 2,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k19E9Q3S4 1311 aa32,87■■■□□ 2,85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q3UJC8 639 aa32,86■■■□□ 2,85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Scn4aQ9ER60 1841 aa32,85■■■□□ 2,85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf710Q3U288 666 aa32,84■■■□□ 2,85
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa32,8■■■□□ 2,84
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Tns3Q5SSZ5 1440 aa32,73■■■□□ 2,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Idi2Q8BFZ6 227 aa32,73■■■□□ 2,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc10Q8R4P9 1501 aa32,73■■■□□ 2,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Anks4bQ8K3X6 423 aa32,73■■■□□ 2,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 C3P01027 1663 aa32,71■■■□□ 2,83
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP32,66■■■□□ 2,82
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Odc1-201ENSMUST00000171737 P2rx7Q9Z1M0 595 aa32,65■■■□□ 2,82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mon2Q80TL7 1715 aa32,64■■■□□ 2,82
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Iqsec2Q5DU25 1478 aa32,63■■■□□ 2,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa32,62■■■□□ 2,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Idi1P58044 227 aa32,62■■■□□ 2,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif16bB1AVY7 1312 aa32,6■■■□□ 2,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa32,6■■■□□ 2,81
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa32,57■■■□□ 2,8
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Pik3c2aQ61194 1686 aa32,5■■■□□ 2,79
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Ofd1Q80Z25 1017 aa32,49■■■□□ 2,79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pip4k2bQ80XI4 416 aa32,48■■■□□ 2,79
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Znf335A2A5K6 1337 aa32,46■■■□□ 2,79
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Odc1-201ENSMUST00000171737 Ap3b2Q9JME5 1082 aa32,41■■■□□ 2,78
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