Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.27■■■■■ 6.12
CatipB9EKE5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.32■■■■■ 5.49
CatipB9EKE5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
CatipB9EKE5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
CatipB9EKE5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.27■■■■■ 5
CatipB9EKE5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
CatipB9EKE5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CatipB9EKE5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
CatipB9EKE5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
CatipB9EKE5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CatipB9EKE5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.44■■■■■ 4.7
CatipB9EKE5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
CatipB9EKE5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
CatipB9EKE5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CatipB9EKE5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
CatipB9EKE5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
CatipB9EKE5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CatipB9EKE5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
CatipB9EKE5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
CatipB9EKE5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CatipB9EKE5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CatipB9EKE5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CatipB9EKE5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
CatipB9EKE5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CatipB9EKE5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CatipB9EKE5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CatipB9EKE5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CatipB9EKE5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CatipB9EKE5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CatipB9EKE5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CatipB9EKE5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CatipB9EKE5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CatipB9EKE5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CatipB9EKE5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CatipB9EKE5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CatipB9EKE5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CatipB9EKE5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CatipB9EKE5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CatipB9EKE5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
CatipB9EKE5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CatipB9EKE5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CatipB9EKE5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CatipB9EKE5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
CatipB9EKE5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CatipB9EKE5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
CatipB9EKE5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
CatipB9EKE5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
CatipB9EKE5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
CatipB9EKE5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CatipB9EKE5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CatipB9EKE5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CatipB9EKE5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
CatipB9EKE5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.01■■■■■ 4
CatipB9EKE5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CatipB9EKE5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CatipB9EKE5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CatipB9EKE5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CatipB9EKE5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
CatipB9EKE5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CatipB9EKE5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
CatipB9EKE5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
CatipB9EKE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
CatipB9EKE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
CatipB9EKE5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
CatipB9EKE5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
CatipB9EKE5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CatipB9EKE5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
CatipB9EKE5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
CatipB9EKE5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CatipB9EKE5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CatipB9EKE5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CatipB9EKE5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CatipB9EKE5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CatipB9EKE5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CatipB9EKE5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CatipB9EKE5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CatipB9EKE5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
CatipB9EKE5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CatipB9EKE5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CatipB9EKE5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.08■■■■□ 3.85
CatipB9EKE5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CatipB9EKE5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CatipB9EKE5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CatipB9EKE5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CatipB9EKE5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CatipB9EKE5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CatipB9EKE5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CatipB9EKE5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CatipB9EKE5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CatipB9EKE5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CatipB9EKE5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CatipB9EKE5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CatipB9EKE5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CatipB9EKE5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CatipB9EKE5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CatipB9EKE5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CatipB9EKE5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CatipB9EKE5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
CatipB9EKE5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CatipB9EKE5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms