Protein–RNA interactions for Protein: P58044

Idi1, Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Idi1P58044 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,33■■■■■ 6,29
Idi1P58044 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,47■■■■■ 5,67
Idi1P58044 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,62■■■■■ 5,53
Idi1P58044 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,35■■■■■ 5,17
Idi1P58044 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,99■■■■■ 5,11
Idi1P58044 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,97■■■■■ 4,95
Idi1P58044 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,91■■■■■ 4,94
Idi1P58044 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,71■■■■■ 4,91
Idi1P58044 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,58■■■■■ 4,89
Idi1P58044 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,3■■■■■ 4,84
Idi1P58044 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,24■■■■■ 4,83
Idi1P58044 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,31■■■■■ 4,68
Idi1P58044 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
Idi1P58044 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Idi1P58044 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,93■■■■■ 4,62
Idi1P58044 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,8■■■■■ 4,6
Idi1P58044 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,77■■■■■ 4,6
Idi1P58044 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Idi1P58044 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,49■■■■■ 4,55
Idi1P58044 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,39■■■■■ 4,54
Idi1P58044 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Idi1P58044 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,09■■■■■ 4,49
Idi1P58044 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Idi1P58044 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,96■■■■■ 4,47
Idi1P58044 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,87■■■■■ 4,45
Idi1P58044 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Idi1P58044 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,61■■■■■ 4,41
Idi1P58044 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,51■■■■■ 4,4
Idi1P58044 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,34■■■■■ 4,37
Idi1P58044 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,37
Idi1P58044 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Idi1P58044 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Idi1P58044 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,1■■■■■ 4,33
Idi1P58044 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Idi1P58044 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,79■■■■■ 4,28
Idi1P58044 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,73■■■■■ 4,27
Idi1P58044 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,64■■■■■ 4,26
Idi1P58044 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,55■■■■■ 4,24
Idi1P58044 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,46■■■■■ 4,23
Idi1P58044 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Idi1P58044 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,36■■■■■ 4,21
Idi1P58044 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Idi1P58044 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,15■■■■■ 4,18
Idi1P58044 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,14■■■■■ 4,18
Idi1P58044 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Idi1P58044 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Idi1P58044 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Idi1P58044 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,77■■■■■ 4,12
Idi1P58044 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,77■■■■■ 4,12
Idi1P58044 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Idi1P58044 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Idi1P58044 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,64■■■■■ 4,1
Idi1P58044 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,57■■■■■ 4,09
Idi1P58044 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,52■■■■■ 4,08
Idi1P58044 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,48■■■■■ 4,07
Idi1P58044 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,42■■■■■ 4,06
Idi1P58044 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Idi1P58044 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,31■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,3■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Idi1P58044 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Idi1P58044 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
Idi1P58044 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,22■■■■■ 4,03
Idi1P58044 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,94■■■■□ 3,98
Idi1P58044 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Idi1P58044 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,87■■■■□ 3,97
Idi1P58044 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Idi1P58044 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Idi1P58044 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,78■■■■□ 3,96
Idi1P58044 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Idi1P58044 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Idi1P58044 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Idi1P58044 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Idi1P58044 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Idi1P58044 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Idi1P58044 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Idi1P58044 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Idi1P58044 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Idi1P58044 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Idi1P58044 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,34■■■■□ 3,89
Idi1P58044 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Idi1P58044 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,27■■■■□ 3,88
Idi1P58044 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
Idi1P58044 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Idi1P58044 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Idi1P58044 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Idi1P58044 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Idi1P58044 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,09■■■■□ 3,85
Idi1P58044 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,07■■■■□ 3,84
Idi1P58044 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,06■■■■□ 3,84
Idi1P58044 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,04■■■■□ 3,84
Idi1P58044 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Idi1P58044 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Idi1P58044 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Idi1P58044 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Idi1P58044 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Idi1P58044 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms