Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC52,98■■■■■ 6,07
Cnga1P29974 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,03■■■■■ 5,44
Cnga1P29974 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,25■■■■■ 5,31
Cnga1P29974 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,23■■■■■ 4,99
Cnga1P29974 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC45,94■■■■■ 4,94
Cnga1P29974 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,63■■■■■ 4,89
Cnga1P29974 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,25■■■■■ 4,83
Cnga1P29974 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,83■■■■■ 4,77
Cnga1P29974 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,74■■■■■ 4,75
Cnga1P29974 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,68■■■■■ 4,74
Cnga1P29974 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,32■■■■■ 4,69
Cnga1P29974 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,16■■■■■ 4,66
Cnga1P29974 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,06■■■■■ 4,64
Cnga1P29974 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,96■■■■■ 4,63
Cnga1P29974 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,13■■■■■ 4,49
Cnga1P29974 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
Cnga1P29974 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC42,9■■■■■ 4,46
Cnga1P29974 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,84■■■■■ 4,45
Cnga1P29974 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,74■■■■■ 4,43
Cnga1P29974 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,65■■■■■ 4,42
Cnga1P29974 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC42,63■■■■■ 4,41
Cnga1P29974 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Cnga1P29974 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,35■■■■■ 4,37
Cnga1P29974 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,3■■■■■ 4,36
Cnga1P29974 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Cnga1P29974 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Cnga1P29974 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Cnga1P29974 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Cnga1P29974 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,02■■■■■ 4,32
Cnga1P29974 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Cnga1P29974 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,97■■■■■ 4,31
Cnga1P29974 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,29
Cnga1P29974 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,87■■■■■ 4,29
Cnga1P29974 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC41,86■■■■■ 4,29
Cnga1P29974 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Cnga1P29974 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC41,69■■■■■ 4,26
Cnga1P29974 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Cnga1P29974 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Cnga1P29974 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Cnga1P29974 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Cnga1P29974 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Cnga1P29974 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Cnga1P29974 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Cnga1P29974 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Cnga1P29974 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Cnga1P29974 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,57■■■■■ 4,09
Cnga1P29974 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Cnga1P29974 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Cnga1P29974 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC40,36■■■■■ 4,05
Cnga1P29974 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Cnga1P29974 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,3■■■■■ 4,04
Cnga1P29974 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Cnga1P29974 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,22■■■■■ 4,03
Cnga1P29974 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Cnga1P29974 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
Cnga1P29974 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40■■■■□ 3,99
Cnga1P29974 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,96■■■■□ 3,99
Cnga1P29974 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Cnga1P29974 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Cnga1P29974 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC39,75■■■■□ 3,95
Cnga1P29974 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Cnga1P29974 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Cnga1P29974 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Cnga1P29974 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Cnga1P29974 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,61■■■■□ 3,93
Cnga1P29974 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Cnga1P29974 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Cnga1P29974 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Cnga1P29974 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Cnga1P29974 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Cnga1P29974 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Cnga1P29974 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,34■■■■□ 3,89
Cnga1P29974 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Cnga1P29974 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Cnga1P29974 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Cnga1P29974 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Cnga1P29974 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Cnga1P29974 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC39,24■■■■□ 3,87
Cnga1P29974 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Cnga1P29974 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Cnga1P29974 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,2■■■■□ 3,87
Cnga1P29974 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Cnga1P29974 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Cnga1P29974 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Cnga1P29974 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Cnga1P29974 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,85
Cnga1P29974 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39■■■■□ 3,83
Cnga1P29974 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Cnga1P29974 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
Cnga1P29974 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Cnga1P29974 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
Cnga1P29974 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
Cnga1P29974 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Cnga1P29974 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC38,9■■■■□ 3,82
Cnga1P29974 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Cnga1P29974 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Cnga1P29974 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Cnga1P29974 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Cnga1P29974 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC38,71■■■■□ 3,79
Cnga1P29974 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms