Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

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Length 1,632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,89■■■■■ 6,38
Pik3c2bE9QAN8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC51,14■■■■■ 5,78
Pik3c2bE9QAN8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5,6
Pik3c2bE9QAN8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,99■■■■■ 5,27
Pik3c2bE9QAN8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47,48■■■■■ 5,19
Pik3c2bE9QAN8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,53■■■■■ 5,04
Pik3c2bE9QAN8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,39■■■■■ 5,02
Pik3c2bE9QAN8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,11■■■■■ 4,97
Pik3c2bE9QAN8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,05■■■■■ 4,96
Pik3c2bE9QAN8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,99■■■■■ 4,95
Pik3c2bE9QAN8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,67■■■■■ 4,9
Pik3c2bE9QAN8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,94■■■■■ 4,78
Pik3c2bE9QAN8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,83■■■■■ 4,77
Pik3c2bE9QAN8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,46■■■■■ 4,71
Pik3c2bE9QAN8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,32■■■■■ 4,69
Pik3c2bE9QAN8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,31■■■■■ 4,68
Pik3c2bE9QAN8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,24■■■■■ 4,67
Pik3c2bE9QAN8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,17■■■■■ 4,66
Pik3c2bE9QAN8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,94■■■■■ 4,62
Pik3c2bE9QAN8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,7■■■■■ 4,59
Pik3c2bE9QAN8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,67■■■■■ 4,58
Pik3c2bE9QAN8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,51■■■■■ 4,56
Pik3c2bE9QAN8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,5■■■■■ 4,55
Pik3c2bE9QAN8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,41■■■■■ 4,54
Pik3c2bE9QAN8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,4■■■■■ 4,54
Pik3c2bE9QAN8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,09■■■■■ 4,49
Pik3c2bE9QAN8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,93■■■■■ 4,46
Pik3c2bE9QAN8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Pik3c2bE9QAN8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Pik3c2bE9QAN8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,6■■■■■ 4,41
Pik3c2bE9QAN8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Pik3c2bE9QAN8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,49■■■■■ 4,39
Pik3c2bE9QAN8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,48■■■■■ 4,39
Pik3c2bE9QAN8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
Pik3c2bE9QAN8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,23■■■■■ 4,35
Pik3c2bE9QAN8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Pik3c2bE9QAN8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,03■■■■■ 4,32
Pik3c2bE9QAN8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,91■■■■■ 4,3
Pik3c2bE9QAN8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,86■■■■■ 4,29
Pik3c2bE9QAN8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,74■■■■■ 4,27
Pik3c2bE9QAN8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,26
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,6■■■■■ 4,25
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,54■■■■■ 4,24
Pik3c2bE9QAN8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Pik3c2bE9QAN8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,45■■■■■ 4,23
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Pik3c2bE9QAN8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41,24■■■■■ 4,19
Pik3c2bE9QAN8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41,22■■■■■ 4,19
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,19■■■■■ 4,19
Pik3c2bE9QAN8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Pik3c2bE9QAN8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,12■■■■■ 4,17
Pik3c2bE9QAN8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Pik3c2bE9QAN8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,04■■■■■ 4,16
Pik3c2bE9QAN8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,94■■■■■ 4,14
Pik3c2bE9QAN8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Pik3c2bE9QAN8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,85■■■■■ 4,13
Pik3c2bE9QAN8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,85■■■■■ 4,13
Pik3c2bE9QAN8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Pik3c2bE9QAN8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,74■■■■■ 4,11
Pik3c2bE9QAN8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,73■■■■■ 4,11
Pik3c2bE9QAN8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Pik3c2bE9QAN8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Pik3c2bE9QAN8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,46■■■■■ 4,07
Pik3c2bE9QAN8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Pik3c2bE9QAN8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,37■■■■■ 4,05
Pik3c2bE9QAN8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Pik3c2bE9QAN8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Pik3c2bE9QAN8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,2■■■■■ 4,03
Pik3c2bE9QAN8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Pik3c2bE9QAN8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Pik3c2bE9QAN8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,09■■■■■ 4,01
Pik3c2bE9QAN8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,04■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Pik3c2bE9QAN8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
Pik3c2bE9QAN8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,85■■■■□ 3,97
Pik3c2bE9QAN8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,85■■■■□ 3,97
Pik3c2bE9QAN8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,84■■■■□ 3,97
Pik3c2bE9QAN8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Pik3c2bE9QAN8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,81■■■■□ 3,96
Pik3c2bE9QAN8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Pik3c2bE9QAN8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,73■■■■□ 3,95
Pik3c2bE9QAN8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Pik3c2bE9QAN8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Pik3c2bE9QAN8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
Pik3c2bE9QAN8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,56■■■■□ 3,92
Pik3c2bE9QAN8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
Pik3c2bE9QAN8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Pik3c2bE9QAN8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Pik3c2bE9QAN8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39,43■■■■□ 3,9
Pik3c2bE9QAN8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,37■■■■□ 3,89
Pik3c2bE9QAN8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Pik3c2bE9QAN8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,89
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Pik3c2bE9QAN8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Pik3c2bE9QAN8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Pik3c2bE9QAN8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Pik3c2bE9QAN8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,2■■■■□ 3,87
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