Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,08■■■■■ 6,25
NgefQ8CHT1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,24■■■■■ 5,63
NgefQ8CHT1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,44■■■■■ 5,51
NgefQ8CHT1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,1■■■■■ 5,13
NgefQ8CHT1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,8■■■■■ 5,08
NgefQ8CHT1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,68■■■■■ 4,9
NgefQ8CHT1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,65■■■■■ 4,9
NgefQ8CHT1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,63■■■■■ 4,9
NgefQ8CHT1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,54■■■■■ 4,88
NgefQ8CHT1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,06■■■■■ 4,8
NgefQ8CHT1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,96■■■■■ 4,79
NgefQ8CHT1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,27■■■■■ 4,68
NgefQ8CHT1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,14■■■■■ 4,66
NgefQ8CHT1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,73■■■■■ 4,59
NgefQ8CHT1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,72■■■■■ 4,59
NgefQ8CHT1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
NgefQ8CHT1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,66■■■■■ 4,58
NgefQ8CHT1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
NgefQ8CHT1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,29■■■■■ 4,52
NgefQ8CHT1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
NgefQ8CHT1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
NgefQ8CHT1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,84■■■■■ 4,45
NgefQ8CHT1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
NgefQ8CHT1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,83■■■■■ 4,45
NgefQ8CHT1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,8■■■■■ 4,44
NgefQ8CHT1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
NgefQ8CHT1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,47■■■■■ 4,39
NgefQ8CHT1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,39■■■■■ 4,38
NgefQ8CHT1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,32■■■■■ 4,36
NgefQ8CHT1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
NgefQ8CHT1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,06■■■■■ 4,32
NgefQ8CHT1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
NgefQ8CHT1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,84■■■■■ 4,29
NgefQ8CHT1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,76■■■■■ 4,28
NgefQ8CHT1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
NgefQ8CHT1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,45■■■■■ 4,23
NgefQ8CHT1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,42■■■■■ 4,22
NgefQ8CHT1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
NgefQ8CHT1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,28■■■■■ 4,2
NgefQ8CHT1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
NgefQ8CHT1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,22■■■■■ 4,19
NgefQ8CHT1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
NgefQ8CHT1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,02■■■■■ 4,16
NgefQ8CHT1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
NgefQ8CHT1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,92■■■■■ 4,14
NgefQ8CHT1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
NgefQ8CHT1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
NgefQ8CHT1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,63■■■■■ 4,1
NgefQ8CHT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,52■■■■■ 4,08
NgefQ8CHT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
NgefQ8CHT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
NgefQ8CHT1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
NgefQ8CHT1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,44■■■■■ 4,06
NgefQ8CHT1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,4■■■■■ 4,06
NgefQ8CHT1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,38■■■■■ 4,05
NgefQ8CHT1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
NgefQ8CHT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,25■■■■■ 4,03
NgefQ8CHT1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
NgefQ8CHT1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
NgefQ8CHT1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,16■■■■■ 4,02
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,12■■■■■ 4,01
NgefQ8CHT1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
NgefQ8CHT1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
NgefQ8CHT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,07■■■■■ 4,01
NgefQ8CHT1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3,99
NgefQ8CHT1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,97■■■■□ 3,99
NgefQ8CHT1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,81■■■■□ 3,96
NgefQ8CHT1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,75■■■■□ 3,95
NgefQ8CHT1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
NgefQ8CHT1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
NgefQ8CHT1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
NgefQ8CHT1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
NgefQ8CHT1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,6■■■■□ 3,93
NgefQ8CHT1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,58■■■■□ 3,93
NgefQ8CHT1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
NgefQ8CHT1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
NgefQ8CHT1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
NgefQ8CHT1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
NgefQ8CHT1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,44■■■■□ 3,9
NgefQ8CHT1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
NgefQ8CHT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,23■■■■□ 3,87
NgefQ8CHT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
NgefQ8CHT1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
NgefQ8CHT1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
NgefQ8CHT1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,06■■■■□ 3,84
NgefQ8CHT1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,06■■■■□ 3,84
NgefQ8CHT1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
NgefQ8CHT1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
NgefQ8CHT1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,01■■■■□ 3,84
NgefQ8CHT1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,83
NgefQ8CHT1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
NgefQ8CHT1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
NgefQ8CHT1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
NgefQ8CHT1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
NgefQ8CHT1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,86■■■■□ 3,81
NgefQ8CHT1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
NgefQ8CHT1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
NgefQ8CHT1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,76■■■■□ 3,8
NgefQ8CHT1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,75■■■■□ 3,79
NgefQ8CHT1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
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