RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51,46■■■■■ 5,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 NischQ80TM9 1593 aa51,43■■■■■ 5,82
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc9P70170 1546 aa49,95■■■■■ 5,59
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abcc8B2RUS7 1588 aa49,3■■■■■ 5,48
Odc1-201ENSMUST00000171737 ScribQ80U72 1612 aa46,79■■■■■ 5,08
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rhox8Q6VSS7 320 aa45,84■■■■■ 4,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dcaf1Q80TR8 1506 aa45,7■■■■■ 4,91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm5dQ62240 1548 aa45,52■■■■■ 4,88
Odc1-201ENSMUST00000171737 NacadQ5SWP3 1504 aa45,29■■■■■ 4,84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa44,97■■■■■ 4,79
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc180J3QNE4 1664 aa44,5■■■■■ 4,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Baz1aO88379 1555 aa44,4■■■■■ 4,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44,38■■■■■ 4,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rtl1Q7M732 1744 aa44,14■■■■■ 4,66
Odc1-201ENSMUST00000171737 Crybg2B7ZCC2 1516 aa43,85■■■■■ 4,61
Odc1-201ENSMUST00000171737 BicraF8VPZ9 1578 aa43,64■■■■■ 4,58
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43,52■■■■■ 4,56
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smarca2Q6DIC0 1577 aa43,31■■■■■ 4,52
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42,72■■■■■ 4,43
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42,6■■■■■ 4,41
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42,16■■■■■ 4,34
Odc1-201ENSMUST00000171737 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42,03■■■■■ 4,32
Odc1-201ENSMUST00000171737 Synj1Q8CHC4 1574 aa41,97■■■■■ 4,31
Odc1-201ENSMUST00000171737 Trim41Q5NCC3 630 aa41,92■■■■■ 4,3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP41,87■■■■■ 4,29
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP41,84■■■■■ 4,29
Odc1-201ENSMUST00000171737 CftrP26361 1476 aa41,83■■■■■ 4,29
Odc1-201ENSMUST00000171737 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41,75■■■■■ 4,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa41,74■■■■■ 4,27
Odc1-201ENSMUST00000171737 Golga3P55937 1487 aa41,16■■■■■ 4,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41,15■■■■■ 4,18
Odc1-201ENSMUST00000171737 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41,13■■■■■ 4,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41,1■■■■■ 4,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41,08■■■■■ 4,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ercc6F8VPZ5 1481 aa41,07■■■■■ 4,17
Odc1-201ENSMUST00000171737 Top2bQ64511 1612 aa41,02■■■■■ 4,16
Odc1-201ENSMUST00000171737 HrcG5E8J6 738 aa40,99■■■■■ 4,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cngb1E1AZ71 1325 aa40,98■■■■■ 4,15
Odc1-201ENSMUST00000171737 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40,75■■■■■ 4,11
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40,67■■■■■ 4,1
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40,61■■■■■ 4,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40,59■■■■■ 4,09
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chic1Q8CBW7 227 aa40,45■■■■■ 4,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam135aQ6NS59 1506 aa40,45■■■■■ 4,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep164Q5DU05 1446 aa40,44■■■■■ 4,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40,39■■■■■ 4,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fmn1Q05860 1466 aa40,36■■■■■ 4,05
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa40,3■■■■■ 4,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 TnnQ80Z71 1560 aa40,29■■■■■ 4,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40,25■■■■■ 4,03
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif15Q6P9L6 1387 aa40,08■■■■■ 4,01
Odc1-201ENSMUST00000171737 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP39,99■■■■□ 3,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ubl4bQ9CQ84 188 aa39,95■■■■□ 3,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Camsap1A2AHC3 1581 aa39,75■■■■□ 3,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Baz1bQ9Z277 1479 aa39,73■■■■□ 3,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cux2P70298 1426 aa39,72■■■■□ 3,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gab3Q8BSM5 595 aa39,69■■■■□ 3,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ccdc18Q640L5 1455 aa39,55■■■■□ 3,92
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mrc2Q64449 1479 aa39,49■■■■□ 3,91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Il27Q8K3I6 234 aa39,49■■■■□ 3,91
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39,38■■■■□ 3,89
Odc1-201ENSMUST00000171737 Grin2bQ01097 1482 aa39,31■■■■□ 3,88
Odc1-201ENSMUST00000171737 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39,28■■■■□ 3,88
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtprkP35822 1457 aa39,24■■■■□ 3,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39,2■■■■□ 3,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 NrkQ9R0G8 1455 aa39,2■■■■□ 3,87
Odc1-201ENSMUST00000171737 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39,16■■■■□ 3,86
Odc1-201ENSMUST00000171737 Shroom4Q1W617 1475 aa39,13■■■■□ 3,85
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP39,08■■■■□ 3,85
Odc1-201ENSMUST00000171737 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39,07■■■■□ 3,84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep162Q6ZQ06 1403 aa39,05■■■■□ 3,84
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP38,99■■■■□ 3,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Npm2Q80W85 207 aa38,97■■■■□ 3,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Duox2A2AQ99 1517 aa38,96■■■■□ 3,83
Odc1-201ENSMUST00000171737 Efcab5A0JP43 1406 aa38,87■■■■□ 3,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Crocc2F6XLV1 1638 aa38,86■■■■□ 3,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgap35Q91YM2 1499 aa38,86■■■■□ 3,81
Odc1-201ENSMUST00000171737 Samd9lQ69Z37 1561 aa38,79■■■■□ 3,8
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa38,68■■■■□ 3,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Map3k1P53349 1493 aa38,67■■■■□ 3,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myt1lP97500 1187 aa38,63■■■■□ 3,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38,63■■■■□ 3,78
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plb1Q3TTY0 1478 aa38,61■■■■□ 3,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP38,61■■■■□ 3,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38,59■■■■□ 3,77
Odc1-201ENSMUST00000171737 SynmQ70IV5 1561 aa38,49■■■■□ 3,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zeb1Q64318 1117 aa38,48■■■■□ 3,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38,46■■■■□ 3,75
Odc1-201ENSMUST00000171737 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38,42■■■■□ 3,74
Odc1-201ENSMUST00000171737 Clip1Q922J3 1391 aa38,35■■■■□ 3,73
Odc1-201ENSMUST00000171737 Disp1Q3TDN0 1521 aa38,31■■■■□ 3,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38,3■■■■□ 3,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Setd1bQ8CFT2 1985 aa38,27■■■■□ 3,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38,26■■■■□ 3,72
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ift140E9PY46 1464 aa38,24■■■■□ 3,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pla2r1Q62028 1487 aa38,24■■■■□ 3,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Grin2aP35436 1464 aa38,2■■■■□ 3,71
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ankrd26Q811D2 1581 aa38,15■■■■□ 3,7
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cux1P53564 1515 aa38,12■■■■□ 3,69
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38,12■■■■□ 3,69
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11 ms