Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.91■■■■■ 6.22
PtpruB1AUH1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.16■■■■■ 5.62
PtpruB1AUH1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
PtpruB1AUH1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.1■■■■■ 5.13
PtpruB1AUH1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
PtpruB1AUH1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
PtpruB1AUH1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
PtpruB1AUH1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
PtpruB1AUH1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
PtpruB1AUH1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
PtpruB1AUH1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PtpruB1AUH1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
PtpruB1AUH1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PtpruB1AUH1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
PtpruB1AUH1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
PtpruB1AUH1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
PtpruB1AUH1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
PtpruB1AUH1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
PtpruB1AUH1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
PtpruB1AUH1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
PtpruB1AUH1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
PtpruB1AUH1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
PtpruB1AUH1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.77■■■■■ 4.44
PtpruB1AUH1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PtpruB1AUH1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PtpruB1AUH1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PtpruB1AUH1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PtpruB1AUH1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
PtpruB1AUH1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PtpruB1AUH1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
PtpruB1AUH1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
PtpruB1AUH1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
PtpruB1AUH1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
PtpruB1AUH1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
PtpruB1AUH1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
PtpruB1AUH1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
PtpruB1AUH1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
PtpruB1AUH1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PtpruB1AUH1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PtpruB1AUH1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PtpruB1AUH1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PtpruB1AUH1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
PtpruB1AUH1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.08■■■■■ 4.17
PtpruB1AUH1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PtpruB1AUH1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
PtpruB1AUH1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.76■■■■■ 4.11
PtpruB1AUH1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PtpruB1AUH1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PtpruB1AUH1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
PtpruB1AUH1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PtpruB1AUH1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PtpruB1AUH1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PtpruB1AUH1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PtpruB1AUH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
PtpruB1AUH1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
PtpruB1AUH1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PtpruB1AUH1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PtpruB1AUH1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
PtpruB1AUH1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PtpruB1AUH1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
PtpruB1AUH1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PtpruB1AUH1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PtpruB1AUH1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PtpruB1AUH1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PtpruB1AUH1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PtpruB1AUH1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PtpruB1AUH1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PtpruB1AUH1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PtpruB1AUH1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtpruB1AUH1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PtpruB1AUH1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PtpruB1AUH1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PtpruB1AUH1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtpruB1AUH1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtpruB1AUH1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtpruB1AUH1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PtpruB1AUH1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PtpruB1AUH1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PtpruB1AUH1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PtpruB1AUH1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PtpruB1AUH1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PtpruB1AUH1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtpruB1AUH1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
PtpruB1AUH1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
PtpruB1AUH1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
PtpruB1AUH1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtpruB1AUH1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
PtpruB1AUH1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
PtpruB1AUH1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
PtpruB1AUH1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
PtpruB1AUH1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PtpruB1AUH1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
PtpruB1AUH1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PtpruB1AUH1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
PtpruB1AUH1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
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