Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3X6

Anks4b, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks4bQ8K3X6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC47.88■■■■■ 5.26
Anks4bQ8K3X6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Anks4bQ8K3X6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Anks4bQ8K3X6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.61■■■■■ 4.89
Anks4bQ8K3X6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Anks4bQ8K3X6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Anks4bQ8K3X6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Anks4bQ8K3X6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Anks4bQ8K3X6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
Anks4bQ8K3X6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Anks4bQ8K3X6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
Anks4bQ8K3X6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Anks4bQ8K3X6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
Anks4bQ8K3X6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
Anks4bQ8K3X6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
Anks4bQ8K3X6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
Anks4bQ8K3X6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Anks4bQ8K3X6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
Anks4bQ8K3X6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Anks4bQ8K3X6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Anks4bQ8K3X6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Anks4bQ8K3X6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Anks4bQ8K3X6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Anks4bQ8K3X6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Anks4bQ8K3X6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Anks4bQ8K3X6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Anks4bQ8K3X6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Anks4bQ8K3X6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Anks4bQ8K3X6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Anks4bQ8K3X6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Anks4bQ8K3X6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
Anks4bQ8K3X6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Anks4bQ8K3X6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Anks4bQ8K3X6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
Anks4bQ8K3X6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Anks4bQ8K3X6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Anks4bQ8K3X6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Anks4bQ8K3X6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Anks4bQ8K3X6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Anks4bQ8K3X6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Anks4bQ8K3X6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Anks4bQ8K3X6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Anks4bQ8K3X6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Anks4bQ8K3X6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Anks4bQ8K3X6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Anks4bQ8K3X6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Anks4bQ8K3X6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Anks4bQ8K3X6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Anks4bQ8K3X6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Anks4bQ8K3X6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Anks4bQ8K3X6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Anks4bQ8K3X6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Anks4bQ8K3X6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Anks4bQ8K3X6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Anks4bQ8K3X6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Anks4bQ8K3X6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
Anks4bQ8K3X6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Anks4bQ8K3X6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Anks4bQ8K3X6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Anks4bQ8K3X6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Anks4bQ8K3X6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Anks4bQ8K3X6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Anks4bQ8K3X6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Anks4bQ8K3X6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Anks4bQ8K3X6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Anks4bQ8K3X6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Anks4bQ8K3X6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Anks4bQ8K3X6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Anks4bQ8K3X6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Anks4bQ8K3X6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Anks4bQ8K3X6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Anks4bQ8K3X6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Anks4bQ8K3X6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Anks4bQ8K3X6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Anks4bQ8K3X6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Anks4bQ8K3X6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Anks4bQ8K3X6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Anks4bQ8K3X6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Anks4bQ8K3X6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Anks4bQ8K3X6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Anks4bQ8K3X6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Anks4bQ8K3X6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Anks4bQ8K3X6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Anks4bQ8K3X6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Anks4bQ8K3X6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Anks4bQ8K3X6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Anks4bQ8K3X6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Anks4bQ8K3X6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Anks4bQ8K3X6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Anks4bQ8K3X6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Anks4bQ8K3X6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Anks4bQ8K3X6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Anks4bQ8K3X6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Anks4bQ8K3X6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
Anks4bQ8K3X6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Anks4bQ8K3X6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Anks4bQ8K3X6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Anks4bQ8K3X6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Anks4bQ8K3X6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Anks4bQ8K3X6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms