Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI4

Pip4k2b, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2bQ80XI4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC58.08■■■■■ 6.89
Pip4k2bQ80XI4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC54.33■■■■■ 6.29
Pip4k2bQ80XI4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
Pip4k2bQ80XI4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC51.05■■■■■ 5.76
Pip4k2bQ80XI4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC49.52■■■■■ 5.52
Pip4k2bQ80XI4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC49.2■■■■■ 5.47
Pip4k2bQ80XI4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Pip4k2bQ80XI4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
Pip4k2bQ80XI4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Pip4k2bQ80XI4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
Pip4k2bQ80XI4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
Pip4k2bQ80XI4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC48.04■■■■■ 5.28
Pip4k2bQ80XI4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Pip4k2bQ80XI4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
Pip4k2bQ80XI4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.59■■■■■ 5.21
Pip4k2bQ80XI4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
Pip4k2bQ80XI4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Pip4k2bQ80XI4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Pip4k2bQ80XI4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Pip4k2bQ80XI4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC46.26■■■■■ 5
Pip4k2bQ80XI4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Pip4k2bQ80XI4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Pip4k2bQ80XI4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Pip4k2bQ80XI4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Pip4k2bQ80XI4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Pip4k2bQ80XI4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
Pip4k2bQ80XI4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
Pip4k2bQ80XI4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC44.44■■■■■ 4.7
Pip4k2bQ80XI4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
Pip4k2bQ80XI4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
Pip4k2bQ80XI4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Pip4k2bQ80XI4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
Pip4k2bQ80XI4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
Pip4k2bQ80XI4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Pip4k2bQ80XI4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
Pip4k2bQ80XI4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Pip4k2bQ80XI4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Pip4k2bQ80XI4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Pip4k2bQ80XI4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Pip4k2bQ80XI4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Pip4k2bQ80XI4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
Pip4k2bQ80XI4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Pip4k2bQ80XI4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Pip4k2bQ80XI4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Pip4k2bQ80XI4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Pip4k2bQ80XI4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
Pip4k2bQ80XI4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Pip4k2bQ80XI4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
Pip4k2bQ80XI4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Pip4k2bQ80XI4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
Pip4k2bQ80XI4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
Pip4k2bQ80XI4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Pip4k2bQ80XI4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Pip4k2bQ80XI4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Pip4k2bQ80XI4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Pip4k2bQ80XI4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Pip4k2bQ80XI4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC42.54■■■■■ 4.4
Pip4k2bQ80XI4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
Pip4k2bQ80XI4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Pip4k2bQ80XI4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
Pip4k2bQ80XI4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
Pip4k2bQ80XI4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Pip4k2bQ80XI4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
Pip4k2bQ80XI4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Pip4k2bQ80XI4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Pip4k2bQ80XI4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Pip4k2bQ80XI4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Pip4k2bQ80XI4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
Pip4k2bQ80XI4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Pip4k2bQ80XI4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pip4k2bQ80XI4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Pip4k2bQ80XI4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Pip4k2bQ80XI4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Pip4k2bQ80XI4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Pip4k2bQ80XI4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Pip4k2bQ80XI4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Pip4k2bQ80XI4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Pip4k2bQ80XI4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Pip4k2bQ80XI4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Pip4k2bQ80XI4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Pip4k2bQ80XI4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
Pip4k2bQ80XI4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Pip4k2bQ80XI4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Pip4k2bQ80XI4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Pip4k2bQ80XI4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Pip4k2bQ80XI4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
Pip4k2bQ80XI4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Pip4k2bQ80XI4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Pip4k2bQ80XI4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Pip4k2bQ80XI4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pip4k2bQ80XI4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Pip4k2bQ80XI4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pip4k2bQ80XI4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pip4k2bQ80XI4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Pip4k2bQ80XI4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pip4k2bQ80XI4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
Pip4k2bQ80XI4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
Pip4k2bQ80XI4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Pip4k2bQ80XI4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
Pip4k2bQ80XI4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms