Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,31■■■■■ 6,28
Sox12Q04890 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,48■■■■■ 5,67
Sox12Q04890 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,64■■■■■ 5,54
Sox12Q04890 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,33■■■■■ 5,17
Sox12Q04890 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,98■■■■■ 5,11
Sox12Q04890 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,85■■■■■ 4,93
Sox12Q04890 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
Sox12Q04890 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,75■■■■■ 4,91
Sox12Q04890 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,69■■■■■ 4,9
Sox12Q04890 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,24■■■■■ 4,83
Sox12Q04890 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,23■■■■■ 4,83
Sox12Q04890 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,35■■■■■ 4,69
Sox12Q04890 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,2■■■■■ 4,67
Sox12Q04890 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,94■■■■■ 4,62
Sox12Q04890 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,88■■■■■ 4,62
Sox12Q04890 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,85■■■■■ 4,61
Sox12Q04890 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,74■■■■■ 4,59
Sox12Q04890 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
Sox12Q04890 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,48■■■■■ 4,55
Sox12Q04890 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,42■■■■■ 4,54
Sox12Q04890 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,21■■■■■ 4,51
Sox12Q04890 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,03■■■■■ 4,48
Sox12Q04890 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Sox12Q04890 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,99■■■■■ 4,47
Sox12Q04890 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Sox12Q04890 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,74■■■■■ 4,43
Sox12Q04890 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Sox12Q04890 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,41■■■■■ 4,38
Sox12Q04890 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,3■■■■■ 4,36
Sox12Q04890 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Sox12Q04890 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Sox12Q04890 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Sox12Q04890 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,04■■■■■ 4,32
Sox12Q04890 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Sox12Q04890 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,62■■■■■ 4,25
Sox12Q04890 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Sox12Q04890 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,6■■■■■ 4,25
Sox12Q04890 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Sox12Q04890 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,43■■■■■ 4,22
Sox12Q04890 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,41■■■■■ 4,22
Sox12Q04890 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Sox12Q04890 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41,15■■■■■ 4,18
Sox12Q04890 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Sox12Q04890 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,05■■■■■ 4,16
Sox12Q04890 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Sox12Q04890 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,85■■■■■ 4,13
Sox12Q04890 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Sox12Q04890 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,73■■■■■ 4,11
Sox12Q04890 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,7■■■■■ 4,11
Sox12Q04890 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Sox12Q04890 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,65■■■■■ 4,1
Sox12Q04890 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,61■■■■■ 4,09
Sox12Q04890 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,57■■■■■ 4,09
Sox12Q04890 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Sox12Q04890 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,47■■■■■ 4,07
Sox12Q04890 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Sox12Q04890 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Sox12Q04890 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,37■■■■■ 4,05
Sox12Q04890 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Sox12Q04890 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Sox12Q04890 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Sox12Q04890 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Sox12Q04890 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,24■■■■■ 4,03
Sox12Q04890 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,19■■■■■ 4,02
Sox12Q04890 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,18■■■■■ 4,02
Sox12Q04890 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,1■■■■■ 4,01
Sox12Q04890 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
Sox12Q04890 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Sox12Q04890 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Sox12Q04890 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Sox12Q04890 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Sox12Q04890 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,72■■■■□ 3,95
Sox12Q04890 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,67■■■■□ 3,94
Sox12Q04890 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Sox12Q04890 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Sox12Q04890 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Sox12Q04890 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
Sox12Q04890 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,49■■■■□ 3,91
Sox12Q04890 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Sox12Q04890 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Sox12Q04890 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Sox12Q04890 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Sox12Q04890 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,28■■■■□ 3,88
Sox12Q04890 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,26■■■■□ 3,88
Sox12Q04890 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Sox12Q04890 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Sox12Q04890 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,1■■■■□ 3,85
Sox12Q04890 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,07■■■■□ 3,85
Sox12Q04890 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Sox12Q04890 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Sox12Q04890 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,03■■■■□ 3,84
Sox12Q04890 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,02■■■■□ 3,84
Sox12Q04890 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Sox12Q04890 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,99■■■■□ 3,83
Sox12Q04890 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,96■■■■□ 3,83
Sox12Q04890 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Sox12Q04890 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
Sox12Q04890 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Sox12Q04890 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Sox12Q04890 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,7 ms