Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,68■■■■■ 6,18
Nrxn1Q9CS84 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,9■■■■■ 5,58
Nrxn1Q9CS84 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,88■■■■■ 5,41
Nrxn1Q9CS84 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,87■■■■■ 5,09
Nrxn1Q9CS84 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,61■■■■■ 5,05
Nrxn1Q9CS84 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,67■■■■■ 4,9
Nrxn1Q9CS84 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,46■■■■■ 4,87
Nrxn1Q9CS84 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,38■■■■■ 4,86
Nrxn1Q9CS84 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,17■■■■■ 4,82
Nrxn1Q9CS84 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Nrxn1Q9CS84 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,81■■■■■ 4,76
Nrxn1Q9CS84 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,73■■■■■ 4,75
Nrxn1Q9CS84 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,53■■■■■ 4,72
Nrxn1Q9CS84 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,91■■■■■ 4,62
Nrxn1Q9CS84 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,65■■■■■ 4,58
Nrxn1Q9CS84 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,33■■■■■ 4,53
Nrxn1Q9CS84 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,32■■■■■ 4,53
Nrxn1Q9CS84 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,2■■■■■ 4,51
Nrxn1Q9CS84 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,2■■■■■ 4,51
Nrxn1Q9CS84 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Nrxn1Q9CS84 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,84■■■■■ 4,45
Nrxn1Q9CS84 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Nrxn1Q9CS84 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Nrxn1Q9CS84 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,63■■■■■ 4,42
Nrxn1Q9CS84 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Nrxn1Q9CS84 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,46■■■■■ 4,39
Nrxn1Q9CS84 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,44■■■■■ 4,38
Nrxn1Q9CS84 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,39■■■■■ 4,38
Nrxn1Q9CS84 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Nrxn1Q9CS84 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Nrxn1Q9CS84 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,98■■■■■ 4,31
Nrxn1Q9CS84 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Nrxn1Q9CS84 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,88■■■■■ 4,3
Nrxn1Q9CS84 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
Nrxn1Q9CS84 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,84■■■■■ 4,29
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Nrxn1Q9CS84 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,77■■■■■ 4,28
Nrxn1Q9CS84 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,46■■■■■ 4,23
Nrxn1Q9CS84 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,26■■■■■ 4,19
Nrxn1Q9CS84 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Nrxn1Q9CS84 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Nrxn1Q9CS84 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,98■■■■■ 4,15
Nrxn1Q9CS84 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Nrxn1Q9CS84 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40,73■■■■■ 4,11
Nrxn1Q9CS84 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,72■■■■■ 4,11
Nrxn1Q9CS84 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Nrxn1Q9CS84 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Nrxn1Q9CS84 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Nrxn1Q9CS84 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Nrxn1Q9CS84 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,38■■■■■ 4,05
Nrxn1Q9CS84 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,35■■■■■ 4,05
Nrxn1Q9CS84 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,33■■■■■ 4,05
Nrxn1Q9CS84 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
Nrxn1Q9CS84 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Nrxn1Q9CS84 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Nrxn1Q9CS84 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Nrxn1Q9CS84 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,15■■■■■ 4,02
Nrxn1Q9CS84 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,92■■■■□ 3,98
Nrxn1Q9CS84 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,91■■■■□ 3,98
Nrxn1Q9CS84 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,9■■■■□ 3,98
Nrxn1Q9CS84 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Nrxn1Q9CS84 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Nrxn1Q9CS84 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,85■■■■□ 3,97
Nrxn1Q9CS84 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Nrxn1Q9CS84 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,82■■■■□ 3,97
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Nrxn1Q9CS84 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,75■■■■□ 3,95
Nrxn1Q9CS84 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Nrxn1Q9CS84 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Nrxn1Q9CS84 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Nrxn1Q9CS84 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39,64■■■■□ 3,94
Nrxn1Q9CS84 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,55■■■■□ 3,92
Nrxn1Q9CS84 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Nrxn1Q9CS84 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Nrxn1Q9CS84 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Nrxn1Q9CS84 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Nrxn1Q9CS84 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Nrxn1Q9CS84 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,35■■■■□ 3,89
Nrxn1Q9CS84 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Nrxn1Q9CS84 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Nrxn1Q9CS84 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Nrxn1Q9CS84 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Nrxn1Q9CS84 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Nrxn1Q9CS84 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,07■■■■□ 3,84
Nrxn1Q9CS84 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Nrxn1Q9CS84 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,04■■■■□ 3,84
Nrxn1Q9CS84 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,04■■■■□ 3,84
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Nrxn1Q9CS84 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,01■■■■□ 3,83
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Nrxn1Q9CS84 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Nrxn1Q9CS84 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Nrxn1Q9CS84 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Nrxn1Q9CS84 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Nrxn1Q9CS84 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Nrxn1Q9CS84 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Nrxn1Q9CS84 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms