Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.68■■■■■ 6.18
Nrxn1Q9CS84 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
Nrxn1Q9CS84 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.41
Nrxn1Q9CS84 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
Nrxn1Q9CS84 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
Nrxn1Q9CS84 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Nrxn1Q9CS84 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Nrxn1Q9CS84 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Nrxn1Q9CS84 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Nrxn1Q9CS84 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Nrxn1Q9CS84 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
Nrxn1Q9CS84 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
Nrxn1Q9CS84 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Nrxn1Q9CS84 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Nrxn1Q9CS84 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
Nrxn1Q9CS84 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Nrxn1Q9CS84 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
Nrxn1Q9CS84 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
Nrxn1Q9CS84 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Nrxn1Q9CS84 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Nrxn1Q9CS84 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
Nrxn1Q9CS84 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Nrxn1Q9CS84 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Nrxn1Q9CS84 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.63■■■■■ 4.42
Nrxn1Q9CS84 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Nrxn1Q9CS84 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
Nrxn1Q9CS84 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
Nrxn1Q9CS84 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
Nrxn1Q9CS84 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Nrxn1Q9CS84 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Nrxn1Q9CS84 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Nrxn1Q9CS84 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Nrxn1Q9CS84 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.88■■■■■ 4.3
Nrxn1Q9CS84 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Nrxn1Q9CS84 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Nrxn1Q9CS84 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Nrxn1Q9CS84 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Nrxn1Q9CS84 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
Nrxn1Q9CS84 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Nrxn1Q9CS84 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Nrxn1Q9CS84 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Nrxn1Q9CS84 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Nrxn1Q9CS84 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
Nrxn1Q9CS84 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Nrxn1Q9CS84 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Nrxn1Q9CS84 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Nrxn1Q9CS84 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Nrxn1Q9CS84 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Nrxn1Q9CS84 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Nrxn1Q9CS84 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
Nrxn1Q9CS84 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Nrxn1Q9CS84 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Nrxn1Q9CS84 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Nrxn1Q9CS84 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Nrxn1Q9CS84 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Nrxn1Q9CS84 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Nrxn1Q9CS84 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Nrxn1Q9CS84 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
Nrxn1Q9CS84 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Nrxn1Q9CS84 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Nrxn1Q9CS84 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Nrxn1Q9CS84 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Nrxn1Q9CS84 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Nrxn1Q9CS84 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Nrxn1Q9CS84 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Nrxn1Q9CS84 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Nrxn1Q9CS84 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Nrxn1Q9CS84 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Nrxn1Q9CS84 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Nrxn1Q9CS84 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Nrxn1Q9CS84 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Nrxn1Q9CS84 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
Nrxn1Q9CS84 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Nrxn1Q9CS84 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Nrxn1Q9CS84 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Nrxn1Q9CS84 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Nrxn1Q9CS84 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Nrxn1Q9CS84 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Nrxn1Q9CS84 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Nrxn1Q9CS84 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Nrxn1Q9CS84 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Nrxn1Q9CS84 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Nrxn1Q9CS84 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Nrxn1Q9CS84 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Nrxn1Q9CS84 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Nrxn1Q9CS84 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.83
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Nrxn1Q9CS84 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Nrxn1Q9CS84 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Nrxn1Q9CS84 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Nrxn1Q9CS84 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Nrxn1Q9CS84 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Nrxn1Q9CS84 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Nrxn1Q9CS84 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms