Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56,4■■■■■ 6,62
Lmtk3Q5XJV6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52,4■■■■■ 5,98
Lmtk3Q5XJV6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,5■■■■■ 5,84
Lmtk3Q5XJV6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49,26■■■■■ 5,48
Lmtk3Q5XJV6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48,85■■■■■ 5,41
Lmtk3Q5XJV6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47,8■■■■■ 5,24
Lmtk3Q5XJV6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,73■■■■■ 5,23
Lmtk3Q5XJV6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,41■■■■■ 5,18
Lmtk3Q5XJV6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47,4■■■■■ 5,18
Lmtk3Q5XJV6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47,05■■■■■ 5,12
Lmtk3Q5XJV6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,94■■■■■ 5,1
Lmtk3Q5XJV6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,88■■■■■ 4,94
Lmtk3Q5XJV6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,55■■■■■ 4,88
Lmtk3Q5XJV6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,55■■■■■ 4,88
Lmtk3Q5XJV6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,5■■■■■ 4,87
Lmtk3Q5XJV6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45,5■■■■■ 4,87
Lmtk3Q5XJV6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45,08■■■■■ 4,81
Lmtk3Q5XJV6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,07■■■■■ 4,81
Lmtk3Q5XJV6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,92■■■■■ 4,78
Lmtk3Q5XJV6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,87■■■■■ 4,77
Lmtk3Q5XJV6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,83■■■■■ 4,77
Lmtk3Q5XJV6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44,75■■■■■ 4,75
Lmtk3Q5XJV6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44,65■■■■■ 4,74
Lmtk3Q5XJV6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,61■■■■■ 4,73
Lmtk3Q5XJV6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Lmtk3Q5XJV6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44,04■■■■■ 4,64
Lmtk3Q5XJV6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,78■■■■■ 4,6
Lmtk3Q5XJV6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Lmtk3Q5XJV6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,67■■■■■ 4,58
Lmtk3Q5XJV6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,64■■■■■ 4,58
Lmtk3Q5XJV6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,63■■■■■ 4,58
Lmtk3Q5XJV6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,61■■■■■ 4,57
Lmtk3Q5XJV6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43,4■■■■■ 4,54
Lmtk3Q5XJV6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43,28■■■■■ 4,52
Lmtk3Q5XJV6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Lmtk3Q5XJV6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43,25■■■■■ 4,51
Lmtk3Q5XJV6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,24■■■■■ 4,51
Lmtk3Q5XJV6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43,2■■■■■ 4,51
Lmtk3Q5XJV6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,98■■■■■ 4,47
Lmtk3Q5XJV6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,88■■■■■ 4,46
Lmtk3Q5XJV6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Lmtk3Q5XJV6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Lmtk3Q5XJV6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,71■■■■■ 4,43
Lmtk3Q5XJV6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,52■■■■■ 4,4
Lmtk3Q5XJV6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,4■■■■■ 4,38
Lmtk3Q5XJV6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42,32■■■■■ 4,37
Lmtk3Q5XJV6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,31■■■■■ 4,36
Lmtk3Q5XJV6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,27■■■■■ 4,36
Lmtk3Q5XJV6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42,2■■■■■ 4,35
Lmtk3Q5XJV6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,14■■■■■ 4,34
Lmtk3Q5XJV6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42,13■■■■■ 4,34
Lmtk3Q5XJV6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,08■■■■■ 4,33
Lmtk3Q5XJV6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,99■■■■■ 4,31
Lmtk3Q5XJV6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Lmtk3Q5XJV6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41,93■■■■■ 4,3
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Lmtk3Q5XJV6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,85■■■■■ 4,29
Lmtk3Q5XJV6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,84■■■■■ 4,29
Lmtk3Q5XJV6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
Lmtk3Q5XJV6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
Lmtk3Q5XJV6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
Lmtk3Q5XJV6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41,73■■■■■ 4,27
Lmtk3Q5XJV6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Lmtk3Q5XJV6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41,54■■■■■ 4,24
Lmtk3Q5XJV6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41,44■■■■■ 4,23
Lmtk3Q5XJV6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC41,31■■■■■ 4,2
Lmtk3Q5XJV6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
Lmtk3Q5XJV6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41,24■■■■■ 4,19
Lmtk3Q5XJV6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Lmtk3Q5XJV6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Lmtk3Q5XJV6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Lmtk3Q5XJV6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,16■■■■■ 4,18
Lmtk3Q5XJV6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Lmtk3Q5XJV6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41,04■■■■■ 4,16
Lmtk3Q5XJV6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,98■■■■■ 4,15
Lmtk3Q5XJV6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Lmtk3Q5XJV6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,93■■■■■ 4,14
Lmtk3Q5XJV6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Lmtk3Q5XJV6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Lmtk3Q5XJV6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Lmtk3Q5XJV6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Lmtk3Q5XJV6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40,72■■■■■ 4,11
Lmtk3Q5XJV6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Lmtk3Q5XJV6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,56■■■■■ 4,08
Lmtk3Q5XJV6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Lmtk3Q5XJV6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Lmtk3Q5XJV6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Lmtk3Q5XJV6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40,48■■■■■ 4,07
Lmtk3Q5XJV6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Lmtk3Q5XJV6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Lmtk3Q5XJV6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Lmtk3Q5XJV6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Lmtk3Q5XJV6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Lmtk3Q5XJV6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Lmtk3Q5XJV6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Lmtk3Q5XJV6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,04
Lmtk3Q5XJV6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Lmtk3Q5XJV6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40,25■■■■■ 4,03
Lmtk3Q5XJV6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Lmtk3Q5XJV6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50,1 ms