Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC56.89■■■■■ 6.7
Nrxn3Q6P9K9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
Nrxn3Q6P9K9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.92
Nrxn3Q6P9K9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC49.79■■■■■ 5.56
Nrxn3Q6P9K9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48.94■■■■■ 5.43
Nrxn3Q6P9K9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.29
Nrxn3Q6P9K9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47.9■■■■■ 5.26
Nrxn3Q6P9K9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
Nrxn3Q6P9K9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
Nrxn3Q6P9K9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
Nrxn3Q6P9K9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
Nrxn3Q6P9K9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC46.63■■■■■ 5.06
Nrxn3Q6P9K9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Nrxn3Q6P9K9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.99
Nrxn3Q6P9K9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
Nrxn3Q6P9K9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Nrxn3Q6P9K9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Nrxn3Q6P9K9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Nrxn3Q6P9K9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Nrxn3Q6P9K9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Nrxn3Q6P9K9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC45.19■■■■■ 4.82
Nrxn3Q6P9K9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Nrxn3Q6P9K9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
Nrxn3Q6P9K9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Nrxn3Q6P9K9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Nrxn3Q6P9K9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Nrxn3Q6P9K9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Nrxn3Q6P9K9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Nrxn3Q6P9K9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
Nrxn3Q6P9K9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Nrxn3Q6P9K9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC43.56■■■■■ 4.56
Nrxn3Q6P9K9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC43.5■■■■■ 4.55
Nrxn3Q6P9K9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Nrxn3Q6P9K9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Nrxn3Q6P9K9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Nrxn3Q6P9K9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Nrxn3Q6P9K9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Nrxn3Q6P9K9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Nrxn3Q6P9K9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Nrxn3Q6P9K9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Nrxn3Q6P9K9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Nrxn3Q6P9K9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.85■■■■■ 4.45
Nrxn3Q6P9K9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
Nrxn3Q6P9K9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Nrxn3Q6P9K9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Nrxn3Q6P9K9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
Nrxn3Q6P9K9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.73■■■■■ 4.43
Nrxn3Q6P9K9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Nrxn3Q6P9K9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
Nrxn3Q6P9K9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
Nrxn3Q6P9K9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
Nrxn3Q6P9K9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
Nrxn3Q6P9K9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Nrxn3Q6P9K9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Nrxn3Q6P9K9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Nrxn3Q6P9K9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Nrxn3Q6P9K9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Nrxn3Q6P9K9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Nrxn3Q6P9K9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Nrxn3Q6P9K9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Nrxn3Q6P9K9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Nrxn3Q6P9K9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Nrxn3Q6P9K9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Nrxn3Q6P9K9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Nrxn3Q6P9K9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Nrxn3Q6P9K9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Nrxn3Q6P9K9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Nrxn3Q6P9K9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Nrxn3Q6P9K9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Nrxn3Q6P9K9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
Nrxn3Q6P9K9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Nrxn3Q6P9K9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Nrxn3Q6P9K9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
Nrxn3Q6P9K9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Nrxn3Q6P9K9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Nrxn3Q6P9K9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Nrxn3Q6P9K9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Nrxn3Q6P9K9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
Nrxn3Q6P9K9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
Nrxn3Q6P9K9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Nrxn3Q6P9K9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Nrxn3Q6P9K9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Nrxn3Q6P9K9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Nrxn3Q6P9K9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Nrxn3Q6P9K9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Nrxn3Q6P9K9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Nrxn3Q6P9K9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Nrxn3Q6P9K9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms