Protein–RNA interactions for Protein: P30415

Nktr, NK-tumor recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NktrP30415 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53.78■■■■■ 6.2
NktrP30415 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
NktrP30415 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
NktrP30415 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.88■■■■■ 5.09
NktrP30415 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
NktrP30415 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
NktrP30415 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
NktrP30415 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
NktrP30415 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
NktrP30415 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
NktrP30415 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44.78■■■■■ 4.76
NktrP30415 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
NktrP30415 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
NktrP30415 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
NktrP30415 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
NktrP30415 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
NktrP30415 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
NktrP30415 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.5
NktrP30415 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NktrP30415 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NktrP30415 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NktrP30415 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
NktrP30415 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
NktrP30415 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
NktrP30415 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NktrP30415 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
NktrP30415 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NktrP30415 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
NktrP30415 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NktrP30415 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
NktrP30415 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NktrP30415 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
NktrP30415 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
NktrP30415 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
NktrP30415 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
NktrP30415 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
NktrP30415 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NktrP30415 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
NktrP30415 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NktrP30415 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
NktrP30415 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
NktrP30415 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
NktrP30415 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NktrP30415 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
NktrP30415 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
NktrP30415 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
NktrP30415 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
NktrP30415 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NktrP30415 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
NktrP30415 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NktrP30415 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
NktrP30415 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NktrP30415 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NktrP30415 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
NktrP30415 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NktrP30415 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NktrP30415 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NktrP30415 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NktrP30415 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
NktrP30415 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NktrP30415 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
NktrP30415 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NktrP30415 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
NktrP30415 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
NktrP30415 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
NktrP30415 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
NktrP30415 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NktrP30415 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
NktrP30415 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
NktrP30415 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NktrP30415 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
NktrP30415 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NktrP30415 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NktrP30415 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
NktrP30415 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NktrP30415 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
NktrP30415 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
NktrP30415 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NktrP30415 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NktrP30415 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NktrP30415 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NktrP30415 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NktrP30415 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NktrP30415 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NktrP30415 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NktrP30415 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NktrP30415 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NktrP30415 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NktrP30415 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NktrP30415 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NktrP30415 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NktrP30415 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NktrP30415 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NktrP30415 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NktrP30415 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
NktrP30415 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
NktrP30415 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NktrP30415 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
NktrP30415 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NktrP30415 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms