Protein–RNA interactions for Protein: P30415

Nktr, NK-tumor recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NktrP30415 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,78■■■■■ 6,2
NktrP30415 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,83■■■■■ 5,57
NktrP30415 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,86■■■■■ 5,41
NktrP30415 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,88■■■■■ 5,09
NktrP30415 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,87■■■■■ 5,09
NktrP30415 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46,01■■■■■ 4,96
NktrP30415 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,43■■■■■ 4,86
NktrP30415 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,37■■■■■ 4,85
NktrP30415 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,3■■■■■ 4,84
NktrP30415 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC44,8■■■■■ 4,76
NktrP30415 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,78■■■■■ 4,76
NktrP30415 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,78■■■■■ 4,76
NktrP30415 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,6■■■■■ 4,73
NktrP30415 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,86■■■■■ 4,61
NktrP30415 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,67■■■■■ 4,58
NktrP30415 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,53■■■■■ 4,56
NktrP30415 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,31■■■■■ 4,52
NktrP30415 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,13■■■■■ 4,5
NktrP30415 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,05■■■■■ 4,48
NktrP30415 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43,02■■■■■ 4,48
NktrP30415 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
NktrP30415 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42,99■■■■■ 4,47
NktrP30415 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,99■■■■■ 4,47
NktrP30415 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
NktrP30415 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,68■■■■■ 4,42
NktrP30415 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
NktrP30415 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,53■■■■■ 4,4
NktrP30415 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,53■■■■■ 4,4
NktrP30415 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,48■■■■■ 4,39
NktrP30415 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
NktrP30415 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
NktrP30415 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,33■■■■■ 4,37
NktrP30415 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,3■■■■■ 4,36
NktrP30415 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
NktrP30415 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
NktrP30415 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,69■■■■■ 4,26
NktrP30415 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
NktrP30415 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,67■■■■■ 4,26
NktrP30415 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,33■■■■■ 4,21
NktrP30415 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,2
NktrP30415 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,29■■■■■ 4,2
NktrP30415 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
NktrP30415 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,16■■■■■ 4,18
NktrP30415 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,11■■■■■ 4,17
NktrP30415 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,06■■■■■ 4,16
NktrP30415 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
NktrP30415 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
NktrP30415 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,7■■■■■ 4,11
NktrP30415 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC40,58■■■■■ 4,09
NktrP30415 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,52■■■■■ 4,08
NktrP30415 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
NktrP30415 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
NktrP30415 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
NktrP30415 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
NktrP30415 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,36■■■■■ 4,05
NktrP30415 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
NktrP30415 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,26■■■■■ 4,04
NktrP30415 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
NktrP30415 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,03
NktrP30415 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,19■■■■■ 4,02
NktrP30415 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
NktrP30415 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,09■■■■■ 4,01
NktrP30415 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40,05■■■■■ 4
NktrP30415 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
NktrP30415 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
NktrP30415 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,92■■■■□ 3,98
NktrP30415 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC39,89■■■■□ 3,98
NktrP30415 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,89■■■■□ 3,98
NktrP30415 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,88■■■■□ 3,97
NktrP30415 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
NktrP30415 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,85■■■■□ 3,97
NktrP30415 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,83■■■■□ 3,97
NktrP30415 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
NktrP30415 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC39,61■■■■□ 3,93
NktrP30415 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
NktrP30415 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,55■■■■□ 3,92
NktrP30415 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,53■■■■□ 3,92
NktrP30415 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,52■■■■□ 3,92
NktrP30415 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
NktrP30415 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
NktrP30415 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
NktrP30415 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
NktrP30415 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,42■■■■□ 3,9
NktrP30415 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,4■■■■□ 3,9
NktrP30415 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
NktrP30415 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
NktrP30415 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,33■■■■□ 3,89
NktrP30415 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
NktrP30415 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
NktrP30415 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
NktrP30415 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
NktrP30415 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39,13■■■■□ 3,85
NktrP30415 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,1■■■■□ 3,85
NktrP30415 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
NktrP30415 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,07■■■■□ 3,85
NktrP30415 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,07■■■■□ 3,85
NktrP30415 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
NktrP30415 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,99■■■■□ 3,83
NktrP30415 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,94■■■■□ 3,82
NktrP30415 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms