Protein–RNA interactions for Protein: Q76MZ3

Ppp2r1a, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC50,47■■■■■ 5,67
Ppp2r1aQ76MZ3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC46,46■■■■■ 5,03
Ppp2r1aQ76MZ3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,79■■■■■ 4,92
Ppp2r1aQ76MZ3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,76■■■■■ 4,92
Ppp2r1aQ76MZ3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,66■■■■■ 4,74
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC44,5■■■■■ 4,71
Ppp2r1aQ76MZ3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44,21■■■■■ 4,67
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC43,69■■■■■ 4,58
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43,61■■■■■ 4,57
Ppp2r1aQ76MZ3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ppp2r1aQ76MZ3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Ppp2r1aQ76MZ3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,57■■■■■ 4,41
Ppp2r1aQ76MZ3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC42,39■■■■■ 4,38
Ppp2r1aQ76MZ3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,22■■■■■ 4,35
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC42,13■■■■■ 4,33
Ppp2r1aQ76MZ3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41,99■■■■■ 4,31
Ppp2r1aQ76MZ3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,94■■■■■ 4,3
Ppp2r1aQ76MZ3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Ppp2r1aQ76MZ3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,87■■■■■ 4,29
Ppp2r1aQ76MZ3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Ppp2r1aQ76MZ3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Ppp2r1aQ76MZ3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Ppp2r1aQ76MZ3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,49■■■■■ 4,23
Ppp2r1aQ76MZ3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,34■■■■■ 4,21
Ppp2r1aQ76MZ3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,24■■■■■ 4,19
Ppp2r1aQ76MZ3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,23■■■■■ 4,19
Ppp2r1aQ76MZ3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Ppp2r1aQ76MZ3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC40,97■■■■■ 4,15
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Ppp2r1aQ76MZ3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Ppp2r1aQ76MZ3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40,84■■■■■ 4,13
Ppp2r1aQ76MZ3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,72■■■■■ 4,11
Ppp2r1aQ76MZ3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Ppp2r1aQ76MZ3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Ppp2r1aQ76MZ3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Ppp2r1aQ76MZ3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Ppp2r1aQ76MZ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Ppp2r1aQ76MZ3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Ppp2r1aQ76MZ3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Ppp2r1aQ76MZ3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Ppp2r1aQ76MZ3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Ppp2r1aQ76MZ3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Ppp2r1aQ76MZ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Ppp2r1aQ76MZ3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Ppp2r1aQ76MZ3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Ppp2r1aQ76MZ3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,58■■■■□ 3,93
Ppp2r1aQ76MZ3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Ppp2r1aQ76MZ3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Ppp2r1aQ76MZ3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Ppp2r1aQ76MZ3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Ppp2r1aQ76MZ3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,15■■■■□ 3,86
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC39,11■■■■□ 3,85
Ppp2r1aQ76MZ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Ppp2r1aQ76MZ3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3,83
Ppp2r1aQ76MZ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,96■■■■□ 3,83
Ppp2r1aQ76MZ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Ppp2r1aQ76MZ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Ppp2r1aQ76MZ3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,85■■■■□ 3,81
Ppp2r1aQ76MZ3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC38,82■■■■□ 3,8
Ppp2r1aQ76MZ3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,81■■■■□ 3,8
Ppp2r1aQ76MZ3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Ppp2r1aQ76MZ3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Ppp2r1aQ76MZ3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Ppp2r1aQ76MZ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Ppp2r1aQ76MZ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,54■■■■□ 3,76
Ppp2r1aQ76MZ3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,51■■■■□ 3,76
Ppp2r1aQ76MZ3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Ppp2r1aQ76MZ3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC38,5■■■■□ 3,75
Ppp2r1aQ76MZ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Ppp2r1aQ76MZ3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC38,43■■■■□ 3,74
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Ppp2r1aQ76MZ3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38,39■■■■□ 3,74
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38,3■■■■□ 3,72
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Ppp2r1aQ76MZ3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC38,17■■■■□ 3,7
Ppp2r1aQ76MZ3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,12■■■■□ 3,69
Ppp2r1aQ76MZ3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Ppp2r1aQ76MZ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,06■■■■□ 3,68
Ppp2r1aQ76MZ3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Ppp2r1aQ76MZ3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Ppp2r1aQ76MZ3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37,87■■■■□ 3,65
Ppp2r1aQ76MZ3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC37,79■■■■□ 3,64
Ppp2r1aQ76MZ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC37,77■■■■□ 3,64
Ppp2r1aQ76MZ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Ppp2r1aQ76MZ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37,71■■■■□ 3,63
Ppp2r1aQ76MZ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Ppp2r1aQ76MZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37,68■■■■□ 3,62
Ppp2r1aQ76MZ3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppp2r1aQ76MZ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppp2r1aQ76MZ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,66■■■■□ 3,62
Ppp2r1aQ76MZ3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Ppp2r1aQ76MZ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Ppp2r1aQ76MZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,56■■■■□ 3,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms