Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.25■■■■■ 6.27
NinlQ6ZQ12 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
NinlQ6ZQ12 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
NinlQ6ZQ12 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.75■■■■■ 5.24
NinlQ6ZQ12 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
NinlQ6ZQ12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
NinlQ6ZQ12 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
NinlQ6ZQ12 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
NinlQ6ZQ12 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NinlQ6ZQ12 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
NinlQ6ZQ12 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
NinlQ6ZQ12 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
NinlQ6ZQ12 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
NinlQ6ZQ12 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
NinlQ6ZQ12 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
NinlQ6ZQ12 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
NinlQ6ZQ12 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
NinlQ6ZQ12 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
NinlQ6ZQ12 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.53■■■■■ 4.56
NinlQ6ZQ12 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
NinlQ6ZQ12 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
NinlQ6ZQ12 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NinlQ6ZQ12 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
NinlQ6ZQ12 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NinlQ6ZQ12 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NinlQ6ZQ12 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
NinlQ6ZQ12 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NinlQ6ZQ12 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NinlQ6ZQ12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
NinlQ6ZQ12 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
NinlQ6ZQ12 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
NinlQ6ZQ12 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
NinlQ6ZQ12 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
NinlQ6ZQ12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NinlQ6ZQ12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
NinlQ6ZQ12 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NinlQ6ZQ12 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
NinlQ6ZQ12 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NinlQ6ZQ12 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NinlQ6ZQ12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NinlQ6ZQ12 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
NinlQ6ZQ12 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
NinlQ6ZQ12 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
NinlQ6ZQ12 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
NinlQ6ZQ12 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NinlQ6ZQ12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NinlQ6ZQ12 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NinlQ6ZQ12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NinlQ6ZQ12 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
NinlQ6ZQ12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
NinlQ6ZQ12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NinlQ6ZQ12 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
NinlQ6ZQ12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
NinlQ6ZQ12 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
NinlQ6ZQ12 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
NinlQ6ZQ12 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
NinlQ6ZQ12 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NinlQ6ZQ12 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NinlQ6ZQ12 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NinlQ6ZQ12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
NinlQ6ZQ12 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
NinlQ6ZQ12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
NinlQ6ZQ12 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NinlQ6ZQ12 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
NinlQ6ZQ12 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NinlQ6ZQ12 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NinlQ6ZQ12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NinlQ6ZQ12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
NinlQ6ZQ12 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
NinlQ6ZQ12 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NinlQ6ZQ12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NinlQ6ZQ12 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NinlQ6ZQ12 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NinlQ6ZQ12 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NinlQ6ZQ12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NinlQ6ZQ12 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NinlQ6ZQ12 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
NinlQ6ZQ12 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NinlQ6ZQ12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
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