Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,25■■■■■ 6,27
NinlQ6ZQ12 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,82■■■■■ 5,73
NinlQ6ZQ12 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,93■■■■■ 5,58
NinlQ6ZQ12 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,75■■■■■ 5,24
NinlQ6ZQ12 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,15■■■■■ 4,98
NinlQ6ZQ12 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46,14■■■■■ 4,98
NinlQ6ZQ12 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,95■■■■■ 4,95
NinlQ6ZQ12 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,63■■■■■ 4,9
NinlQ6ZQ12 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,27■■■■■ 4,84
NinlQ6ZQ12 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,19■■■■■ 4,82
NinlQ6ZQ12 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,06■■■■■ 4,8
NinlQ6ZQ12 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,03■■■■■ 4,8
NinlQ6ZQ12 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,91■■■■■ 4,78
NinlQ6ZQ12 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,77■■■■■ 4,76
NinlQ6ZQ12 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,74■■■■■ 4,75
NinlQ6ZQ12 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44,67■■■■■ 4,74
NinlQ6ZQ12 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44,23■■■■■ 4,67
NinlQ6ZQ12 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,22■■■■■ 4,67
NinlQ6ZQ12 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,53■■■■■ 4,56
NinlQ6ZQ12 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43,49■■■■■ 4,55
NinlQ6ZQ12 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,45■■■■■ 4,55
NinlQ6ZQ12 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,23■■■■■ 4,51
NinlQ6ZQ12 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43,21■■■■■ 4,51
NinlQ6ZQ12 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,15■■■■■ 4,5
NinlQ6ZQ12 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42,84■■■■■ 4,45
NinlQ6ZQ12 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
NinlQ6ZQ12 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,52■■■■■ 4,4
NinlQ6ZQ12 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
NinlQ6ZQ12 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,44■■■■■ 4,38
NinlQ6ZQ12 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,42■■■■■ 4,38
NinlQ6ZQ12 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
NinlQ6ZQ12 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
NinlQ6ZQ12 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,15■■■■■ 4,34
NinlQ6ZQ12 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42,08■■■■■ 4,33
NinlQ6ZQ12 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
NinlQ6ZQ12 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
NinlQ6ZQ12 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41,84■■■■■ 4,29
NinlQ6ZQ12 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,81■■■■■ 4,28
NinlQ6ZQ12 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,8■■■■■ 4,28
NinlQ6ZQ12 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41,68■■■■■ 4,26
NinlQ6ZQ12 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
NinlQ6ZQ12 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41,63■■■■■ 4,25
NinlQ6ZQ12 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,59■■■■■ 4,25
NinlQ6ZQ12 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,53■■■■■ 4,24
NinlQ6ZQ12 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41,42■■■■■ 4,22
NinlQ6ZQ12 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,33■■■■■ 4,21
NinlQ6ZQ12 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,29■■■■■ 4,2
NinlQ6ZQ12 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,27■■■■■ 4,2
NinlQ6ZQ12 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,22■■■■■ 4,19
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
NinlQ6ZQ12 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,96■■■■■ 4,15
NinlQ6ZQ12 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
NinlQ6ZQ12 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,74■■■■■ 4,11
NinlQ6ZQ12 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
NinlQ6ZQ12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,56■■■■■ 4,08
NinlQ6ZQ12 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
NinlQ6ZQ12 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
NinlQ6ZQ12 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
NinlQ6ZQ12 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,39■■■■■ 4,06
NinlQ6ZQ12 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,26■■■■■ 4,04
NinlQ6ZQ12 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,03
NinlQ6ZQ12 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,25■■■■■ 4,03
NinlQ6ZQ12 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,23■■■■■ 4,03
NinlQ6ZQ12 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,19■■■■■ 4,02
NinlQ6ZQ12 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,02
NinlQ6ZQ12 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,99■■■■□ 3,99
NinlQ6ZQ12 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,96■■■■□ 3,99
NinlQ6ZQ12 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
NinlQ6ZQ12 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,79■■■■□ 3,96
NinlQ6ZQ12 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,75■■■■□ 3,95
NinlQ6ZQ12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39,75■■■■□ 3,95
NinlQ6ZQ12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,63■■■■□ 3,93
NinlQ6ZQ12 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
NinlQ6ZQ12 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,59■■■■□ 3,93
NinlQ6ZQ12 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,59■■■■□ 3,93
NinlQ6ZQ12 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
NinlQ6ZQ12 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
NinlQ6ZQ12 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
NinlQ6ZQ12 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39,4■■■■□ 3,9
NinlQ6ZQ12 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
NinlQ6ZQ12 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,36■■■■□ 3,89
NinlQ6ZQ12 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
NinlQ6ZQ12 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,31■■■■□ 3,88
NinlQ6ZQ12 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,27■■■■□ 3,88
NinlQ6ZQ12 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
NinlQ6ZQ12 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,24■■■■□ 3,87
NinlQ6ZQ12 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
NinlQ6ZQ12 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,18■■■■□ 3,86
NinlQ6ZQ12 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NinlQ6ZQ12 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
NinlQ6ZQ12 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,08■■■■□ 3,85
NinlQ6ZQ12 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
NinlQ6ZQ12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,06■■■■□ 3,84
NinlQ6ZQ12 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,84
NinlQ6ZQ12 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,99■■■■□ 3,83
NinlQ6ZQ12 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
NinlQ6ZQ12 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,93■■■■□ 3,82
NinlQ6ZQ12 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
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