Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC55,87■■■■■ 6,53
Tns3Q5SSZ5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC52,01■■■■■ 5,92
Tns3Q5SSZ5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,06■■■■■ 5,76
Tns3Q5SSZ5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC48,8■■■■■ 5,4
Tns3Q5SSZ5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48,22■■■■■ 5,31
Tns3Q5SSZ5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,22■■■■■ 5,15
Tns3Q5SSZ5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47,12■■■■■ 5,13
Tns3Q5SSZ5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC47,02■■■■■ 5,12
Tns3Q5SSZ5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,93■■■■■ 5,1
Tns3Q5SSZ5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,68■■■■■ 5,06
Tns3Q5SSZ5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC46,54■■■■■ 5,04
Tns3Q5SSZ5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC45,68■■■■■ 4,9
Tns3Q5SSZ5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45,26■■■■■ 4,84
Tns3Q5SSZ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC45,25■■■■■ 4,83
Tns3Q5SSZ5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,24■■■■■ 4,83
Tns3Q5SSZ5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,97■■■■■ 4,79
Tns3Q5SSZ5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,92■■■■■ 4,78
Tns3Q5SSZ5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44,53■■■■■ 4,72
Tns3Q5SSZ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,5■■■■■ 4,71
Tns3Q5SSZ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,34■■■■■ 4,69
Tns3Q5SSZ5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC44,33■■■■■ 4,69
Tns3Q5SSZ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC44,3■■■■■ 4,68
Tns3Q5SSZ5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,2■■■■■ 4,67
Tns3Q5SSZ5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,86■■■■■ 4,61
Tns3Q5SSZ5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Tns3Q5SSZ5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43,47■■■■■ 4,55
Tns3Q5SSZ5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Tns3Q5SSZ5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,19■■■■■ 4,5
Tns3Q5SSZ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,07■■■■■ 4,49
Tns3Q5SSZ5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,01■■■■■ 4,48
Tns3Q5SSZ5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,97■■■■■ 4,47
Tns3Q5SSZ5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,81■■■■■ 4,44
Tns3Q5SSZ5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Tns3Q5SSZ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42,78■■■■■ 4,44
Tns3Q5SSZ5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Tns3Q5SSZ5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC42,7■■■■■ 4,43
Tns3Q5SSZ5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,64■■■■■ 4,42
Tns3Q5SSZ5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,59■■■■■ 4,41
Tns3Q5SSZ5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Tns3Q5SSZ5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,38■■■■■ 4,37
Tns3Q5SSZ5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC42,26■■■■■ 4,36
Tns3Q5SSZ5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC42,2■■■■■ 4,35
Tns3Q5SSZ5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42,11■■■■■ 4,33
Tns3Q5SSZ5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC42,06■■■■■ 4,32
Tns3Q5SSZ5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4,31
Tns3Q5SSZ5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,98■■■■■ 4,31
Tns3Q5SSZ5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC41,91■■■■■ 4,3
Tns3Q5SSZ5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41,83■■■■■ 4,29
Tns3Q5SSZ5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41,78■■■■■ 4,28
Tns3Q5SSZ5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41,71■■■■■ 4,27
Tns3Q5SSZ5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC41,67■■■■■ 4,26
Tns3Q5SSZ5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,25
Tns3Q5SSZ5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Tns3Q5SSZ5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Tns3Q5SSZ5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Tns3Q5SSZ5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Tns3Q5SSZ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41,42■■■■■ 4,22
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Tns3Q5SSZ5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC41,31■■■■■ 4,2
Tns3Q5SSZ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,28■■■■■ 4,2
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,25■■■■■ 4,19
Tns3Q5SSZ5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,21■■■■■ 4,19
Tns3Q5SSZ5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC41,12■■■■■ 4,17
Tns3Q5SSZ5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,99■■■■■ 4,15
Tns3Q5SSZ5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40,99■■■■■ 4,15
Tns3Q5SSZ5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,9■■■■■ 4,14
Tns3Q5SSZ5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,7■■■■■ 4,11
Tns3Q5SSZ5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,69■■■■■ 4,1
Tns3Q5SSZ5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40,64■■■■■ 4,1
Tns3Q5SSZ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40,61■■■■■ 4,09
Tns3Q5SSZ5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Tns3Q5SSZ5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,55■■■■■ 4,08
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,54■■■■■ 4,08
Tns3Q5SSZ5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC40,53■■■■■ 4,08
Tns3Q5SSZ5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Tns3Q5SSZ5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Tns3Q5SSZ5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Tns3Q5SSZ5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Tns3Q5SSZ5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
Tns3Q5SSZ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Tns3Q5SSZ5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,26■■■■■ 4,04
Tns3Q5SSZ5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,24■■■■■ 4,03
Tns3Q5SSZ5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40,16■■■■■ 4,02
Tns3Q5SSZ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40,1■■■■■ 4,01
Tns3Q5SSZ5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39,99■■■■□ 3,99
Tns3Q5SSZ5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,99■■■■□ 3,99
Tns3Q5SSZ5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39,97■■■■□ 3,99
Tns3Q5SSZ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Tns3Q5SSZ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39,94■■■■□ 3,98
Tns3Q5SSZ5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Tns3Q5SSZ5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39,89■■■■□ 3,98
Tns3Q5SSZ5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Tns3Q5SSZ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39,86■■■■□ 3,97
Tns3Q5SSZ5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Tns3Q5SSZ5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Tns3Q5SSZ5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Tns3Q5SSZ5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Tns3Q5SSZ5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39,68■■■■□ 3,94
Tns3Q5SSZ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC39,64■■■■□ 3,94
Tns3Q5SSZ5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms