Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48,92■■■■■ 5,42
Stra8P70278 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,06■■■■■ 5,12
Stra8P70278 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,45■■■■■ 4,87
Stra8P70278 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,4■■■■■ 4,86
Stra8P70278 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45,03■■■■■ 4,8
Stra8P70278 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,45■■■■■ 4,71
Stra8P70278 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44,11■■■■■ 4,65
Stra8P70278 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Stra8P70278 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43,21■■■■■ 4,51
Stra8P70278 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Stra8P70278 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,79■■■■■ 4,44
Stra8P70278 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Stra8P70278 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,33■■■■■ 4,37
Stra8P70278 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42,32■■■■■ 4,37
Stra8P70278 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,31■■■■■ 4,36
Stra8P70278 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42,15■■■■■ 4,34
Stra8P70278 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,12■■■■■ 4,33
Stra8P70278 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,09■■■■■ 4,33
Stra8P70278 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Stra8P70278 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,72■■■■■ 4,27
Stra8P70278 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,46■■■■■ 4,23
Stra8P70278 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Stra8P70278 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Stra8P70278 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,23■■■■■ 4,19
Stra8P70278 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,21■■■■■ 4,19
Stra8P70278 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Stra8P70278 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40,91■■■■■ 4,14
Stra8P70278 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40,89■■■■■ 4,14
Stra8P70278 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,86■■■■■ 4,13
Stra8P70278 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Stra8P70278 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Stra8P70278 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Stra8P70278 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Stra8P70278 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Stra8P70278 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,46■■■■■ 4,07
Stra8P70278 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Stra8P70278 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,4■■■■■ 4,06
Stra8P70278 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,32■■■■■ 4,04
Stra8P70278 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,3■■■■■ 4,04
Stra8P70278 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40,28■■■■■ 4,04
Stra8P70278 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,26■■■■■ 4,04
Stra8P70278 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Stra8P70278 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Stra8P70278 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39,96■■■■□ 3,99
Stra8P70278 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,83■■■■□ 3,97
Stra8P70278 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,8■■■■□ 3,96
Stra8P70278 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39,79■■■■□ 3,96
Stra8P70278 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39,74■■■■□ 3,95
Stra8P70278 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Stra8P70278 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39,52■■■■□ 3,92
Stra8P70278 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC39,44■■■■□ 3,9
Stra8P70278 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Stra8P70278 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Stra8P70278 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Stra8P70278 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Stra8P70278 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Stra8P70278 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,13■■■■□ 3,85
Stra8P70278 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39,05■■■■□ 3,84
Stra8P70278 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Stra8P70278 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Stra8P70278 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Stra8P70278 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Stra8P70278 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Stra8P70278 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Stra8P70278 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Stra8P70278 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,69■■■■□ 3,78
Stra8P70278 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Stra8P70278 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Stra8P70278 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Stra8P70278 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,77
Stra8P70278 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Stra8P70278 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Stra8P70278 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Stra8P70278 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
Stra8P70278 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Stra8P70278 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Stra8P70278 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38,35■■■■□ 3,73
Stra8P70278 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,35■■■■□ 3,73
Stra8P70278 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Stra8P70278 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Stra8P70278 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Stra8P70278 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Stra8P70278 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,17■■■■□ 3,7
Stra8P70278 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,1■■■■□ 3,69
Stra8P70278 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,1■■■■□ 3,69
Stra8P70278 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38,02■■■■□ 3,68
Stra8P70278 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Stra8P70278 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37,94■■■■□ 3,66
Stra8P70278 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Stra8P70278 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Stra8P70278 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Stra8P70278 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Stra8P70278 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37,84■■■■□ 3,65
Stra8P70278 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Stra8P70278 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Stra8P70278 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Stra8P70278 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Stra8P70278 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,74■■■■□ 3,63
Stra8P70278 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Stra8P70278 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms