Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,99■■■■■ 6,23
Ap3b2Q9JME5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,1■■■■■ 5,61
Ap3b2Q9JME5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,38■■■■■ 5,5
Ap3b2Q9JME5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,94■■■■■ 5,1
Ap3b2Q9JME5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,82■■■■■ 5,09
Ap3b2Q9JME5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,71■■■■■ 4,91
Ap3b2Q9JME5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
Ap3b2Q9JME5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,59■■■■■ 4,89
Ap3b2Q9JME5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,51■■■■■ 4,88
Ap3b2Q9JME5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,06■■■■■ 4,8
Ap3b2Q9JME5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,83■■■■■ 4,77
Ap3b2Q9JME5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,15■■■■■ 4,66
Ap3b2Q9JME5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,93■■■■■ 4,62
Ap3b2Q9JME5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,73■■■■■ 4,59
Ap3b2Q9JME5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,68■■■■■ 4,58
Ap3b2Q9JME5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,53■■■■■ 4,56
Ap3b2Q9JME5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,52■■■■■ 4,56
Ap3b2Q9JME5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,38■■■■■ 4,53
Ap3b2Q9JME5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,32■■■■■ 4,53
Ap3b2Q9JME5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,49
Ap3b2Q9JME5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Ap3b2Q9JME5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,82■■■■■ 4,45
Ap3b2Q9JME5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Ap3b2Q9JME5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,79■■■■■ 4,44
Ap3b2Q9JME5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,72■■■■■ 4,43
Ap3b2Q9JME5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,7■■■■■ 4,43
Ap3b2Q9JME5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
Ap3b2Q9JME5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,39■■■■■ 4,38
Ap3b2Q9JME5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
Ap3b2Q9JME5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Ap3b2Q9JME5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,96■■■■■ 4,31
Ap3b2Q9JME5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,91■■■■■ 4,3
Ap3b2Q9JME5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,9■■■■■ 4,3
Ap3b2Q9JME5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,26
Ap3b2Q9JME5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,63■■■■■ 4,25
Ap3b2Q9JME5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,48■■■■■ 4,23
Ap3b2Q9JME5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Ap3b2Q9JME5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,36■■■■■ 4,21
Ap3b2Q9JME5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Ap3b2Q9JME5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Ap3b2Q9JME5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,15■■■■■ 4,18
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,07■■■■■ 4,17
Ap3b2Q9JME5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4,15
Ap3b2Q9JME5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Ap3b2Q9JME5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,96■■■■■ 4,15
Ap3b2Q9JME5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,7■■■■■ 4,11
Ap3b2Q9JME5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Ap3b2Q9JME5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,62■■■■■ 4,09
Ap3b2Q9JME5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,55■■■■■ 4,08
Ap3b2Q9JME5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Ap3b2Q9JME5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ap3b2Q9JME5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,42■■■■■ 4,06
Ap3b2Q9JME5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,33■■■■■ 4,05
Ap3b2Q9JME5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Ap3b2Q9JME5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,3■■■■■ 4,04
Ap3b2Q9JME5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,27■■■■■ 4,04
Ap3b2Q9JME5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Ap3b2Q9JME5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,16■■■■■ 4,02
Ap3b2Q9JME5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,11■■■■■ 4,01
Ap3b2Q9JME5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,04■■■■■ 4
Ap3b2Q9JME5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Ap3b2Q9JME5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Ap3b2Q9JME5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Ap3b2Q9JME5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC39,99■■■■□ 3,99
Ap3b2Q9JME5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,95■■■■□ 3,99
Ap3b2Q9JME5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,92■■■■□ 3,98
Ap3b2Q9JME5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,9■■■■□ 3,98
Ap3b2Q9JME5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,7■■■■□ 3,95
Ap3b2Q9JME5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Ap3b2Q9JME5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Ap3b2Q9JME5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,62■■■■□ 3,93
Ap3b2Q9JME5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,62■■■■□ 3,93
Ap3b2Q9JME5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Ap3b2Q9JME5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,6■■■■□ 3,93
Ap3b2Q9JME5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Ap3b2Q9JME5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Ap3b2Q9JME5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,47■■■■□ 3,91
Ap3b2Q9JME5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,44■■■■□ 3,9
Ap3b2Q9JME5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Ap3b2Q9JME5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Ap3b2Q9JME5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Ap3b2Q9JME5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,16■■■■□ 3,86
Ap3b2Q9JME5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,09■■■■□ 3,85
Ap3b2Q9JME5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Ap3b2Q9JME5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Ap3b2Q9JME5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,06■■■■□ 3,84
Ap3b2Q9JME5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Ap3b2Q9JME5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Ap3b2Q9JME5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Ap3b2Q9JME5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,92■■■■□ 3,82
Ap3b2Q9JME5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38,91■■■■□ 3,82
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,9■■■■□ 3,82
Ap3b2Q9JME5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,89■■■■□ 3,82
Ap3b2Q9JME5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Ap3b2Q9JME5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ap3b2Q9JME5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ap3b2Q9JME5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Ap3b2Q9JME5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Ap3b2Q9JME5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Ap3b2Q9JME5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,67■■■■□ 3,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms