Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM52

Mink1, Misshapen-like kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mink1Q9JM52 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.21■■■■■ 6.27
Mink1Q9JM52 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
Mink1Q9JM52 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
Mink1Q9JM52 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
Mink1Q9JM52 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.11■■■■■ 5.13
Mink1Q9JM52 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
Mink1Q9JM52 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.77■■■■■ 4.92
Mink1Q9JM52 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Mink1Q9JM52 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
Mink1Q9JM52 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Mink1Q9JM52 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
Mink1Q9JM52 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Mink1Q9JM52 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
Mink1Q9JM52 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
Mink1Q9JM52 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Mink1Q9JM52 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Mink1Q9JM52 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Mink1Q9JM52 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Mink1Q9JM52 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Mink1Q9JM52 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
Mink1Q9JM52 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Mink1Q9JM52 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
Mink1Q9JM52 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Mink1Q9JM52 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Mink1Q9JM52 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
Mink1Q9JM52 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Mink1Q9JM52 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Mink1Q9JM52 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
Mink1Q9JM52 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
Mink1Q9JM52 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
Mink1Q9JM52 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Mink1Q9JM52 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Mink1Q9JM52 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Mink1Q9JM52 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Mink1Q9JM52 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Mink1Q9JM52 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Mink1Q9JM52 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Mink1Q9JM52 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Mink1Q9JM52 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Mink1Q9JM52 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Mink1Q9JM52 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Mink1Q9JM52 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Mink1Q9JM52 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Mink1Q9JM52 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Mink1Q9JM52 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Mink1Q9JM52 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Mink1Q9JM52 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Mink1Q9JM52 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
Mink1Q9JM52 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Mink1Q9JM52 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Mink1Q9JM52 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Mink1Q9JM52 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Mink1Q9JM52 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Mink1Q9JM52 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Mink1Q9JM52 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Mink1Q9JM52 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Mink1Q9JM52 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
Mink1Q9JM52 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Mink1Q9JM52 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Mink1Q9JM52 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Mink1Q9JM52 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Mink1Q9JM52 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Mink1Q9JM52 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Mink1Q9JM52 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Mink1Q9JM52 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Mink1Q9JM52 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Mink1Q9JM52 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Mink1Q9JM52 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
Mink1Q9JM52 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Mink1Q9JM52 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Mink1Q9JM52 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Mink1Q9JM52 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Mink1Q9JM52 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Mink1Q9JM52 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Mink1Q9JM52 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Mink1Q9JM52 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Mink1Q9JM52 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Mink1Q9JM52 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Mink1Q9JM52 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Mink1Q9JM52 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Mink1Q9JM52 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Mink1Q9JM52 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Mink1Q9JM52 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Mink1Q9JM52 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Mink1Q9JM52 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Mink1Q9JM52 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
Mink1Q9JM52 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Mink1Q9JM52 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Mink1Q9JM52 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
Mink1Q9JM52 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Mink1Q9JM52 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Mink1Q9JM52 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Mink1Q9JM52 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Mink1Q9JM52 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Mink1Q9JM52 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Mink1Q9JM52 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Mink1Q9JM52 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Mink1Q9JM52 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Mink1Q9JM52 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Mink1Q9JM52 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms