Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC53,89■■■■■ 6,22
Sirt1Q923E4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC49,98■■■■■ 5,59
Sirt1Q923E4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,25■■■■■ 5,47
Sirt1Q923E4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC46,88■■■■■ 5,1
Sirt1Q923E4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,85■■■■■ 5,09
Sirt1Q923E4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,85■■■■■ 4,93
Sirt1Q923E4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,57■■■■■ 4,89
Sirt1Q923E4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,49■■■■■ 4,87
Sirt1Q923E4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,43■■■■■ 4,86
Sirt1Q923E4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC44,97■■■■■ 4,79
Sirt1Q923E4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,76■■■■■ 4,76
Sirt1Q923E4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,71■■■■■ 4,75
Sirt1Q923E4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,22■■■■■ 4,67
Sirt1Q923E4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC43,96■■■■■ 4,63
Sirt1Q923E4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,85■■■■■ 4,61
Sirt1Q923E4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,57■■■■■ 4,57
Sirt1Q923E4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,47■■■■■ 4,55
Sirt1Q923E4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Sirt1Q923E4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,43■■■■■ 4,54
Sirt1Q923E4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,39■■■■■ 4,54
Sirt1Q923E4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,27■■■■■ 4,52
Sirt1Q923E4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,92■■■■■ 4,46
Sirt1Q923E4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,83■■■■■ 4,45
Sirt1Q923E4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,77■■■■■ 4,44
Sirt1Q923E4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42,76■■■■■ 4,44
Sirt1Q923E4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,71■■■■■ 4,43
Sirt1Q923E4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Sirt1Q923E4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Sirt1Q923E4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,65■■■■■ 4,42
Sirt1Q923E4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,48■■■■■ 4,39
Sirt1Q923E4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Sirt1Q923E4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42,15■■■■■ 4,34
Sirt1Q923E4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC42,08■■■■■ 4,33
Sirt1Q923E4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Sirt1Q923E4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41,87■■■■■ 4,29
Sirt1Q923E4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,25
Sirt1Q923E4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,56■■■■■ 4,24
Sirt1Q923E4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,46■■■■■ 4,23
Sirt1Q923E4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,44■■■■■ 4,22
Sirt1Q923E4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,39■■■■■ 4,22
Sirt1Q923E4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Sirt1Q923E4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,37■■■■■ 4,21
Sirt1Q923E4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,18■■■■■ 4,18
Sirt1Q923E4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC41,11■■■■■ 4,17
Sirt1Q923E4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41,11■■■■■ 4,17
Sirt1Q923E4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC41■■■■■ 4,15
Sirt1Q923E4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,95■■■■■ 4,15
Sirt1Q923E4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Sirt1Q923E4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,59■■■■■ 4,09
Sirt1Q923E4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Sirt1Q923E4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,07
Sirt1Q923E4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,49■■■■■ 4,07
Sirt1Q923E4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,47■■■■■ 4,07
Sirt1Q923E4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,42■■■■■ 4,06
Sirt1Q923E4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Sirt1Q923E4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC40,38■■■■■ 4,05
Sirt1Q923E4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,37■■■■■ 4,05
Sirt1Q923E4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,37■■■■■ 4,05
Sirt1Q923E4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,31■■■■■ 4,04
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40,25■■■■■ 4,03
Sirt1Q923E4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Sirt1Q923E4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,13■■■■■ 4,01
Sirt1Q923E4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,11■■■■■ 4,01
Sirt1Q923E4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,08■■■■■ 4,01
Sirt1Q923E4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40,07■■■■■ 4,01
Sirt1Q923E4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,03■■■■■ 4
Sirt1Q923E4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,02■■■■■ 4
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3,99
Sirt1Q923E4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Sirt1Q923E4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Sirt1Q923E4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,91■■■■□ 3,98
Sirt1Q923E4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Sirt1Q923E4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Sirt1Q923E4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39,8■■■■□ 3,96
Sirt1Q923E4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Sirt1Q923E4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Sirt1Q923E4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Sirt1Q923E4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,56■■■■□ 3,92
Sirt1Q923E4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,55■■■■□ 3,92
Sirt1Q923E4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Sirt1Q923E4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,45■■■■□ 3,91
Sirt1Q923E4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,4■■■■□ 3,9
Sirt1Q923E4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,39■■■■□ 3,9
Sirt1Q923E4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Sirt1Q923E4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Sirt1Q923E4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,35■■■■□ 3,89
Sirt1Q923E4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39,31■■■■□ 3,88
Sirt1Q923E4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Sirt1Q923E4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,15■■■■□ 3,86
Sirt1Q923E4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Sirt1Q923E4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Sirt1Q923E4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,08■■■■□ 3,85
Sirt1Q923E4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Sirt1Q923E4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Sirt1Q923E4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,01■■■■□ 3,83
Sirt1Q923E4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,97■■■■□ 3,83
Sirt1Q923E4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,96■■■■□ 3,83
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Sirt1Q923E4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Sirt1Q923E4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms