RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000154553.1

Sft2d1-210, Transcript of Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sft2d1, Length 1,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MypopQ8R4U1 393 aa32,23■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 DccP70211 1447 aa32,23■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Siglec1Q62230 1695 aa32,22■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kdm2aP59997 1161 aa32,22■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa32,21■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP32,21■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fan1Q69ZT1 1020 aa32,2■■■□□ 2,75
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa32,19■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP32,19■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 GnpatP98192 678 aa32,18■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ggt6Q6PDE7 497 aa32,18■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Usp32F8VPZ3 1604 aa32,18■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrp6O88572 1613 aa32,18■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kcna6Q61923 529 aa32,17■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep170bQ80U49 1574 aa32,16■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rgl3Q3UYI5 709 aa32,16■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa32,15■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP32,15■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Os9Q8K2C7 672 aa32,14■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Farp2Q91VS8 1065 aa32,14■■■□□ 2,74
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wnk3Q80XP9 1757 aa32,12■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrrc7Q80TE7 1490 aa32,11■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Usp47Q8BY87 1376 aa32,11■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dmrt2Q8BG36 561 aa32,11■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP32,1■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NinlQ6ZQ12 1394 aa32,08■■■□□ 2,73
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm20521D3Z5F7 333 aa32,07■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Plekhg1F6S200 1446 aa32,07■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 C5P06684 1680 aa32,05■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa32,05■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Als2Q920R0 1651 aa32,03■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abcc10Q8R4P9 1501 aa32,01■■■□□ 2,72
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP32■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tmem2Q5FWI3 1383 aa31,99■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Idi1P58044 227 aa31,99■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Camta1A2A891 1682 aa31,99■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP31,98■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Smim5Q8BT42 78 aa31,98■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eid3Q3V124 375 aa31,96■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP31,96■■■□□ 2,71
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sox12Q04890 314 aa31,93■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Emilin2Q8K482 1074 aa31,93■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Zranb1Q7M760 708 aa31,92■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa31,92■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Kif1aP33173 1695 aa31,91■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 IqubQ8CDK3 788 aa31,9■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tex14Q7M6U3 1450 aa31,89■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abca14E9Q8F8 1683 aa31,89■■■□□ 2,7
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mier1Q5UAK0 511 aa31,87■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fam135bQ9DAI6 1403 aa31,86■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mink1Q9JM52 1308 aa31,86■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP31,86■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa31,86■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Stag3O70576 1240 aa31,85■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atp7bQ64446 1462 aa31,84■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP31,84■■■□□ 2,69
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Usp40Q8BWR4 1235 aa31,82■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP31,81■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP31,8■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Acsbg1Q99PU5 721 aa31,8■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Atp10bB1AWN4 1474 aa31,79■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NgefQ8CHT1 710 aa31,79■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa31,78■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Wdr17E9Q271 1322 aa31,78■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ap3b2Q9JME5 1082 aa31,77■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP31,76■■■□□ 2,68
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cadps2Q8BYR5 1297 aa31,76■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sirt1Q923E4 737 aa31,76■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP31,75■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 MpndQ3TV65 487 aa31,74■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 PtpruB1AUH1 1446 aa31,74■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Eno4Q8C042 619 aa31,72■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Polr3aB2RXC6 1390 aa31,71■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Rgs17Q9QZB0 210 aa31,71■■■□□ 2,67
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 InhbeO08717 350 aa31,68■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nphp4P59240 1425 aa31,67■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Znf316Q6PGE4 1016 aa31,67■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Neurod1Q60867 357 aa31,65■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cdk19Q8BWD8 501 aa31,65■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Slc35g1Q8BY79 368 aa31,64■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa31,64■■■□□ 2,66
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 NktrP30415 1453 aa31,63■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Abca15E9PWH4 1668 aa31,62■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Dixdc1Q80Y83 711 aa31,62■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa31,6■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Nrxn1Q9CS84 1514 aa31,59■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Fyb1O35601 819 aa31,58■■■□□ 2,65
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP31,57■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Psrc1Q9D0P7 329 aa31,57■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mon2Q80TL7 1715 aa31,57■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Mug2P28666 1451 aa31,53■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa31,53■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Stard8Q8K031 1019 aa31,53■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col22a1E9Q7P1 1613 aa31,52■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Col16a1Q8BLX7 1580 aa31,51■■■□□ 2,64
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 CenpjQ569L8 1344 aa31,5■■■□□ 2,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Ildr2B5TVM2 661 aa31,48■■■□□ 2,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa31,47■■■□□ 2,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Txnrd1Q9JMH6 613 aa31,47■■■□□ 2,63
Sft2d1-210ENSMUST00000154553 Gsto1O09131 240 aa31,45■■■□□ 2,63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21,3 ms