Protein–RNA interactions for Protein: Q61210

Arhgef1, Rho guanine nucleotide exchange factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 920 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef1Q61210 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,03■■■■■ 6,24
Arhgef1Q61210 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,33■■■■■ 5,65
Arhgef1Q61210 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,54■■■■■ 5,52
Arhgef1Q61210 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,2■■■■■ 5,15
Arhgef1Q61210 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,43■■■■■ 5,02
Arhgef1Q61210 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,69■■■■■ 4,9
Arhgef1Q61210 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,64■■■■■ 4,9
Arhgef1Q61210 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,36■■■■■ 4,85
Arhgef1Q61210 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,29■■■■■ 4,84
Arhgef1Q61210 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,1■■■■■ 4,81
Arhgef1Q61210 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,01■■■■■ 4,8
Arhgef1Q61210 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,32■■■■■ 4,69
Arhgef1Q61210 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,92■■■■■ 4,62
Arhgef1Q61210 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,87■■■■■ 4,61
Arhgef1Q61210 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,8■■■■■ 4,6
Arhgef1Q61210 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,72■■■■■ 4,59
Arhgef1Q61210 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,46■■■■■ 4,55
Arhgef1Q61210 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,12■■■■■ 4,49
Arhgef1Q61210 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Arhgef1Q61210 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,98■■■■■ 4,47
Arhgef1Q61210 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,92■■■■■ 4,46
Arhgef1Q61210 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,91■■■■■ 4,46
Arhgef1Q61210 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,42
Arhgef1Q61210 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,03■■■■■ 4,32
Arhgef1Q61210 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,9■■■■■ 4,3
Arhgef1Q61210 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
Arhgef1Q61210 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,29
Arhgef1Q61210 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Arhgef1Q61210 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,5■■■■■ 4,23
Arhgef1Q61210 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Arhgef1Q61210 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,45■■■■■ 4,23
Arhgef1Q61210 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Arhgef1Q61210 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,33■■■■■ 4,21
Arhgef1Q61210 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,17■■■■■ 4,18
Arhgef1Q61210 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,12■■■■■ 4,17
Arhgef1Q61210 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,97■■■■■ 4,15
Arhgef1Q61210 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,97■■■■■ 4,15
Arhgef1Q61210 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Arhgef1Q61210 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Arhgef1Q61210 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Arhgef1Q61210 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,82■■■■■ 4,13
Arhgef1Q61210 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,81■■■■■ 4,12
Arhgef1Q61210 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,8■■■■■ 4,12
Arhgef1Q61210 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Arhgef1Q61210 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,63■■■■■ 4,09
Arhgef1Q61210 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,58■■■■■ 4,09
Arhgef1Q61210 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,58■■■■■ 4,09
Arhgef1Q61210 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC40,56■■■■■ 4,08
Arhgef1Q61210 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Arhgef1Q61210 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,45■■■■■ 4,07
Arhgef1Q61210 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,34■■■■■ 4,05
Arhgef1Q61210 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,33■■■■■ 4,05
Arhgef1Q61210 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,32■■■■■ 4,05
Arhgef1Q61210 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Arhgef1Q61210 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Arhgef1Q61210 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Arhgef1Q61210 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Arhgef1Q61210 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,82■■■■□ 3,97
Arhgef1Q61210 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,81■■■■□ 3,96
Arhgef1Q61210 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,74■■■■□ 3,95
Arhgef1Q61210 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,69■■■■□ 3,94
Arhgef1Q61210 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,54■■■■□ 3,92
Arhgef1Q61210 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,91
Arhgef1Q61210 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,48■■■■□ 3,91
Arhgef1Q61210 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC39,44■■■■□ 3,9
Arhgef1Q61210 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Arhgef1Q61210 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Arhgef1Q61210 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Arhgef1Q61210 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,31■■■■□ 3,88
Arhgef1Q61210 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Arhgef1Q61210 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39,24■■■■□ 3,87
Arhgef1Q61210 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Arhgef1Q61210 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Arhgef1Q61210 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,1■■■■□ 3,85
Arhgef1Q61210 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,09■■■■□ 3,85
Arhgef1Q61210 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39,09■■■■□ 3,85
Arhgef1Q61210 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,08■■■■□ 3,85
Arhgef1Q61210 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Arhgef1Q61210 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Arhgef1Q61210 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Arhgef1Q61210 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Arhgef1Q61210 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC38,68■■■■□ 3,78
Arhgef1Q61210 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,66■■■■□ 3,78
Arhgef1Q61210 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Arhgef1Q61210 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38,61■■■■□ 3,77
Arhgef1Q61210 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Arhgef1Q61210 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,55■■■■□ 3,76
Arhgef1Q61210 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,54■■■■□ 3,76
Arhgef1Q61210 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,51■■■■□ 3,76
Arhgef1Q61210 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Arhgef1Q61210 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Arhgef1Q61210 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,44■■■■□ 3,74
Arhgef1Q61210 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Arhgef1Q61210 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Arhgef1Q61210 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,4■■■■□ 3,74
Arhgef1Q61210 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Arhgef1Q61210 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,73
Arhgef1Q61210 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Arhgef1Q61210 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38,34■■■■□ 3,73
Arhgef1Q61210 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
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