Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.57■■■■■ 6.33
Farp2Q91VS8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
Farp2Q91VS8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
Farp2Q91VS8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.57■■■■■ 5.21
Farp2Q91VS8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC47.08■■■■■ 5.13
Farp2Q91VS8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Farp2Q91VS8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Farp2Q91VS8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
Farp2Q91VS8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Farp2Q91VS8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.47■■■■■ 4.87
Farp2Q91VS8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
Farp2Q91VS8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
Farp2Q91VS8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.18■■■■■ 4.66
Farp2Q91VS8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Farp2Q91VS8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Farp2Q91VS8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Farp2Q91VS8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Farp2Q91VS8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
Farp2Q91VS8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Farp2Q91VS8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Farp2Q91VS8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Farp2Q91VS8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
Farp2Q91VS8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
Farp2Q91VS8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Farp2Q91VS8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Farp2Q91VS8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
Farp2Q91VS8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Farp2Q91VS8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Farp2Q91VS8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Farp2Q91VS8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Farp2Q91VS8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Farp2Q91VS8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Farp2Q91VS8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Farp2Q91VS8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Farp2Q91VS8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Farp2Q91VS8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Farp2Q91VS8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Farp2Q91VS8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Farp2Q91VS8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Farp2Q91VS8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Farp2Q91VS8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Farp2Q91VS8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Farp2Q91VS8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Farp2Q91VS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
Farp2Q91VS8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Farp2Q91VS8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Farp2Q91VS8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Farp2Q91VS8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Farp2Q91VS8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Farp2Q91VS8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Farp2Q91VS8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Farp2Q91VS8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Farp2Q91VS8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Farp2Q91VS8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Farp2Q91VS8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Farp2Q91VS8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Farp2Q91VS8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Farp2Q91VS8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Farp2Q91VS8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Farp2Q91VS8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Farp2Q91VS8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Farp2Q91VS8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Farp2Q91VS8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Farp2Q91VS8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Farp2Q91VS8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
Farp2Q91VS8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Farp2Q91VS8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Farp2Q91VS8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Farp2Q91VS8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Farp2Q91VS8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Farp2Q91VS8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Farp2Q91VS8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
Farp2Q91VS8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Farp2Q91VS8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Farp2Q91VS8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Farp2Q91VS8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Farp2Q91VS8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Farp2Q91VS8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Farp2Q91VS8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
Farp2Q91VS8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Farp2Q91VS8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
Farp2Q91VS8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Farp2Q91VS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Farp2Q91VS8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Farp2Q91VS8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Farp2Q91VS8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Farp2Q91VS8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Farp2Q91VS8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Farp2Q91VS8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Farp2Q91VS8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Farp2Q91VS8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Farp2Q91VS8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Farp2Q91VS8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Farp2Q91VS8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Farp2Q91VS8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Farp2Q91VS8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
Farp2Q91VS8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Farp2Q91VS8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Farp2Q91VS8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Farp2Q91VS8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms