Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYI5

Rgl3, Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgl3Q3UYI5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54.8■■■■■ 6.36
Rgl3Q3UYI5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50.63■■■■■ 5.7
Rgl3Q3UYI5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Rgl3Q3UYI5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC48■■■■■ 5.27
Rgl3Q3UYI5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
Rgl3Q3UYI5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47.46■■■■■ 5.19
Rgl3Q3UYI5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC47.01■■■■■ 5.12
Rgl3Q3UYI5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Rgl3Q3UYI5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rgl3Q3UYI5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.32■■■■■ 5.01
Rgl3Q3UYI5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Rgl3Q3UYI5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Rgl3Q3UYI5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Rgl3Q3UYI5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Rgl3Q3UYI5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Rgl3Q3UYI5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
Rgl3Q3UYI5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Rgl3Q3UYI5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
Rgl3Q3UYI5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
Rgl3Q3UYI5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Rgl3Q3UYI5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
Rgl3Q3UYI5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
Rgl3Q3UYI5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Rgl3Q3UYI5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Rgl3Q3UYI5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Rgl3Q3UYI5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Rgl3Q3UYI5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Rgl3Q3UYI5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Rgl3Q3UYI5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
Rgl3Q3UYI5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Rgl3Q3UYI5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Rgl3Q3UYI5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Rgl3Q3UYI5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
Rgl3Q3UYI5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Rgl3Q3UYI5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
Rgl3Q3UYI5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
Rgl3Q3UYI5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Rgl3Q3UYI5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Rgl3Q3UYI5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Rgl3Q3UYI5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Rgl3Q3UYI5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Rgl3Q3UYI5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Rgl3Q3UYI5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Rgl3Q3UYI5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
Rgl3Q3UYI5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rgl3Q3UYI5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rgl3Q3UYI5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rgl3Q3UYI5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rgl3Q3UYI5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Rgl3Q3UYI5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Rgl3Q3UYI5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rgl3Q3UYI5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rgl3Q3UYI5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Rgl3Q3UYI5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rgl3Q3UYI5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Rgl3Q3UYI5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Rgl3Q3UYI5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rgl3Q3UYI5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rgl3Q3UYI5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Rgl3Q3UYI5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rgl3Q3UYI5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rgl3Q3UYI5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rgl3Q3UYI5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC41.21■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rgl3Q3UYI5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Rgl3Q3UYI5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rgl3Q3UYI5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rgl3Q3UYI5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rgl3Q3UYI5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.17
Rgl3Q3UYI5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rgl3Q3UYI5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Rgl3Q3UYI5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Rgl3Q3UYI5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Rgl3Q3UYI5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Rgl3Q3UYI5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Rgl3Q3UYI5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Rgl3Q3UYI5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Rgl3Q3UYI5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Rgl3Q3UYI5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
Rgl3Q3UYI5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Rgl3Q3UYI5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rgl3Q3UYI5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rgl3Q3UYI5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rgl3Q3UYI5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rgl3Q3UYI5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
Rgl3Q3UYI5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rgl3Q3UYI5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rgl3Q3UYI5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Rgl3Q3UYI5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rgl3Q3UYI5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rgl3Q3UYI5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rgl3Q3UYI5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Rgl3Q3UYI5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Rgl3Q3UYI5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Rgl3Q3UYI5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Rgl3Q3UYI5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms