Protein–RNA interactions for Protein: Q64446

Atp7b, Copper-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp7bQ64446 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC54,05■■■■■ 6,24
Atp7bQ64446 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC50,31■■■■■ 5,64
Atp7bQ64446 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,37■■■■■ 5,49
Atp7bQ64446 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC47,21■■■■■ 5,15
Atp7bQ64446 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC46,75■■■■■ 5,07
Atp7bQ64446 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,71■■■■■ 4,91
Atp7bQ64446 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC45,68■■■■■ 4,9
Atp7bQ64446 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC45,5■■■■■ 4,87
Atp7bQ64446 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
Atp7bQ64446 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,09■■■■■ 4,81
Atp7bQ64446 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC45,07■■■■■ 4,81
Atp7bQ64446 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,16■■■■■ 4,66
Atp7bQ64446 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC44,1■■■■■ 4,65
Atp7bQ64446 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43,72■■■■■ 4,59
Atp7bQ64446 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,71■■■■■ 4,59
Atp7bQ64446 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC43,7■■■■■ 4,59
Atp7bQ64446 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,54■■■■■ 4,56
Atp7bQ64446 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Atp7bQ64446 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC43,11■■■■■ 4,49
Atp7bQ64446 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
Atp7bQ64446 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,02■■■■■ 4,48
Atp7bQ64446 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,93■■■■■ 4,46
Atp7bQ64446 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC42,89■■■■■ 4,46
Atp7bQ64446 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC42,81■■■■■ 4,44
Atp7bQ64446 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,63■■■■■ 4,41
Atp7bQ64446 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Atp7bQ64446 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42,12■■■■■ 4,33
Atp7bQ64446 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC41,88■■■■■ 4,29
Atp7bQ64446 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,83■■■■■ 4,29
Atp7bQ64446 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,71■■■■■ 4,27
Atp7bQ64446 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Atp7bQ64446 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC41,67■■■■■ 4,26
Atp7bQ64446 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC41,47■■■■■ 4,23
Atp7bQ64446 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC41,43■■■■■ 4,22
Atp7bQ64446 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Atp7bQ64446 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,21
Atp7bQ64446 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Atp7bQ64446 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC41,27■■■■■ 4,2
Atp7bQ64446 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC41,14■■■■■ 4,18
Atp7bQ64446 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Atp7bQ64446 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Atp7bQ64446 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC40,86■■■■■ 4,13
Atp7bQ64446 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC40,84■■■■■ 4,13
Atp7bQ64446 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC40,82■■■■■ 4,12
Atp7bQ64446 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Atp7bQ64446 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Atp7bQ64446 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Atp7bQ64446 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Atp7bQ64446 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC40,49■■■■■ 4,07
Atp7bQ64446 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC40,48■■■■■ 4,07
Atp7bQ64446 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,41■■■■■ 4,06
Atp7bQ64446 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Atp7bQ64446 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40,35■■■■■ 4,05
Atp7bQ64446 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,29■■■■■ 4,04
Atp7bQ64446 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC40,24■■■■■ 4,03
Atp7bQ64446 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC40,21■■■■■ 4,03
Atp7bQ64446 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Atp7bQ64446 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,15■■■■■ 4,02
Atp7bQ64446 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,14■■■■■ 4,02
Atp7bQ64446 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40,09■■■■■ 4,01
Atp7bQ64446 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC40,01■■■■■ 4
Atp7bQ64446 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Atp7bQ64446 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC39,97■■■■□ 3,99
Atp7bQ64446 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Atp7bQ64446 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC39,73■■■■□ 3,95
Atp7bQ64446 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC39,68■■■■□ 3,94
Atp7bQ64446 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,57■■■■□ 3,93
Atp7bQ64446 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,46■■■■□ 3,91
Atp7bQ64446 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Atp7bQ64446 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,9
Atp7bQ64446 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Atp7bQ64446 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Atp7bQ64446 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Atp7bQ64446 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC39,32■■■■□ 3,88
Atp7bQ64446 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Atp7bQ64446 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Atp7bQ64446 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39,26■■■■□ 3,88
Atp7bQ64446 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Atp7bQ64446 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,22■■■■□ 3,87
Atp7bQ64446 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,21■■■■□ 3,87
Atp7bQ64446 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Atp7bQ64446 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,14■■■■□ 3,86
Atp7bQ64446 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Atp7bQ64446 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Atp7bQ64446 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38,93■■■■□ 3,82
Atp7bQ64446 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
Atp7bQ64446 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Atp7bQ64446 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Atp7bQ64446 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Atp7bQ64446 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Atp7bQ64446 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Atp7bQ64446 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,69■■■■□ 3,78
Atp7bQ64446 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,66■■■■□ 3,78
Atp7bQ64446 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Atp7bQ64446 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Atp7bQ64446 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Atp7bQ64446 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,59■■■■□ 3,77
Atp7bQ64446 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,58■■■■□ 3,77
Atp7bQ64446 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Atp7bQ64446 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,54■■■■□ 3,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms